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AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel

>20,000개의 인간 RefSeq 유전자의 발현 수준을 측정하는 표적 패널.

6시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음)

Assay 시간

< 1.5시간

수작업 시간

RNA 1~100 ng(10 ng 권장)

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina 전사체 인간 유전자 발현 패널용 AmpliSeq는 단일 분석에서 20,000개 이상의 인간 RefSeq 유전자의 발현 수준을 측정하기 위한 고도로 다중화된 표적 재서열 분석이다.

주요 기능

  • 빠른 유전자 발현 프로파일링 - < 1.5시간의 실습 시간으로 6시간 내에 라이브러리를 준비하고 < 2일 내에 결과를 이용할 수 있습니다.

  • 저품질, 저수량 샘플 입력 - 포르말린 고정, 파라핀 포매(FFPE) 조직에서 최소한의 입력으로 시작할 때에도 고품질 데이터를 얻을 수 있습니다.

  • DNA-분석 솔루션 - 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 분석을 아우르는 포괄적인 워크플로우를  활용합니다.

전사체 인간 유전자 발현 패널은 Illumina 중합효소 연쇄반응(PCR) 기반 라이브러리 준비를 위한 AmpliSeq, 합성에 의한 Illumina 염기서열분석(SBS) 차세대 염기서열분석(NGS) 기술, 자동화 분석을 포함하는 통합 워크플로우의 일부입니다.

바로 사용할 수 있는 이 패널은 표적을 식별하고, 프라이머를 설계하고, 패널을 최적화하는 데 드는 시간과 노력을 절약해 줍니다.

AmpliSeq for Illumina에 대해 자세히 알아보기

사양

Assay 시간 6시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음)
콘텐츠 사양 인간 RefSeq 유전자의 > 95%, 20,802개 유전자, 인간 전사체 캡처
설명 시퀀스 특이적 앰플리콘을 사용하여 >20,000개의 인간 RefSeq 유전자의 발현 수준을 연구합니다.
수작업 시간 < 1.5시간
사용량 RNA 1~100 ng(10 ng 권장)
Instruments NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System
작용 기전 Multiplex PCR
방법 Exome sequencing, mRNA sequencing, Targeted RNA sequencing
멀티플렉싱 이중 인덱스 조합 96개
Nucleic acid type RNA
앰플리콘 수 풀 1개
특수 샘플의 종류 Blood, FFPE tissue
Species category Human
Technology Sequencing
변이 클래스 Transcript variants

필수 제품

AmpliSeq for Illumina 전사체 인간 유전자 발현 패널 워크플로우에는 전사체 패널, 라이브러리 플러스 키트 및 인덱스 어댑터가 필요합니다. RNA 워크플로우에는 cDNA 합성도 필요합니다.

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우

1
준비

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel

2
시퀀스
3
분석

관련 애플리케이션 및 방법

표적 재시퀀싱

표적 재시퀀싱을 통해 유전자 또는 유전체 영역의 부분집합을 분리하고 시퀀스를 분석하며, 이를 통해 검사실의 리소스를 절약할 수 있습니다.

암 RNA 시퀀싱

Detect cancer gene expression and transcriptome changes and identify novel cancer transcripts with RNA next-generation sequencing (RNA-Seq).

mRNA 시퀀싱

NGS를 사용한 mRNA 시퀀싱(mRNA-Seq)은 알려지거나 새로운 전사물을 모두 식별하고 전사물 풍부도를 측정할 수 있습니다.

문서

제품 관련 자료
지원 문서

비교하기

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome TruSeq Stranded Total RNA TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
Assay 시간 6시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음) 약 7시간 11.5시간 11.5시간
콘텐츠 사양 인간 RefSeq 유전자의 > 95%, 20,802개 유전자, 인간 전사체 캡처 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처
설명 시퀀스 특이적 앰플리콘을 사용하여 >20,000개의 인간 RefSeq 유전자의 발현 수준을 연구합니다. 다양한 RNA-Seq 애플리케이션을 지원하는 저 RNA 입력 및 저품질 샘플에서 전체 전사체 시퀀싱 준비 라이브러리를 준비하는 데 사용됩니다. 풍부한 전사체 분석을 용이하게 하기 위해 여러 종에서 rRNA 및 글로빈 RNA의 단일 튜브 고갈을 위한 Ribo-Zero Plus를 포함한다.  전장 전사체 시퀀싱 연구용입니다. Total RNA 버전은 세포질 rRNA를 제거하며 Total RNA Gold 버전은 세포질 및 미토콘드리아 rRNA를 제거합니다. 혈액 유래 RNA에 대한 전장 전사체 시퀀싱 연구용입니다. 세포질 및 미토콘드리아 rRNA와 글로빈 mRNA를 제거합니다.
수작업 시간 < 1.5시간 < 3시간 5.5시간 5.5시간
사용량 RNA 1~100 ng(10 ng 권장) 표준 품질 RNA 검체에 대해 1–1000 ng 총 RNA. 최적의 성능 및 FFPE 검체에 대해 최소 10 ng 총 RNA 권장  고품질 Total RNA 0.1~1 ug. 품질이 낮은 샘플에는 추가적인 최적화가 필요할 수 있음. 혈액 고품질 정제 Total RNA 0.1~1 ug
Instruments NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq 6000 System NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
작용 기전 Multiplex PCR 효소 rRNA 제거, 어댑터 및 인덱스의 라이게이션 기반 첨가 비드 기반 rRNA 제거, cDNA 합성 및 PCR 비드 기반 rRNA 제거, cDNA 합성 및 PCR
방법 Exome sequencing, mRNA sequencing, Targeted RNA sequencing Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing Whole-transcriptome sequencing Whole-transcriptome sequencing
멀티플렉싱 이중 인덱스 조합 96개 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI) 저처리량 키트: 최대 12개의 샘플을 풀링합니다. 또는 세트 A, B를 함께 사용 시 최대 24개의 샘플 풀링, 고처리량 키트: 조합 듀얼 인덱스 또는 고유한 듀얼 인덱스를 사용하여 96개의 인덱스 샘플 준비 고처리량 키트: 조합 듀얼 인덱스 또는 고유한 듀얼 인덱스를 사용하여 96개의 인덱스 샘플 준비, 저처리량 키트: 최대 12개의 샘플을 풀링합니다. 또는 세트 A, B를 함께 사용 시 최대 24개의 샘플 풀링
Nucleic acid type RNA RNA RNA RNA
앰플리콘 수 풀 1개
특수 샘플의 종류 Blood, FFPE tissue Microbiome samples, Low-input samples, FFPE tissue FFPE tissue Blood
Species category Human Mouse, Human, Rat, Bacteria Mouse, Human, Rat Mouse, Human, Rat
Technology Sequencing Sequencing Sequencing Sequencing
변이 클래스 Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants

패널 (1)

AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Panel for Illumina®

20019170

AmpliSeq Library PLUS for Illumina와 함께 사용할 경우 24개의 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비, 인덱스 어댑터 및 액세서리 제품을 별도로 구입하십시오.

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라이브러리 프렙 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

24개의 검체 라벨링에 충분한 24개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 8 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 시약과 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

Illumina, 세트 A, 세트 B, 세트 C 및 세트 D용 AmpliSeq CD 인덱스 4세트가 포함됩니다. 각 세트에는 96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 8bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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액세서리 제품 (4)

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

Illumina RNA 패널(예: AmpliSeq for Illumina Immune Response, Immune Repertoire Plus, TCR 베타 패널, 골수, 전사체 인간 유전자 발현, 포커스, 종합 패널 v3 및 맞춤형 또는 커뮤니티 RNA 패널)용 AmpliSeq로 작업할 때 총 RNA를 cDNA로 변환하기 위한 반응 혼합물 및 효소 혼합물 포함. 반응 수는 패널에 따라 다르다(예: Illumina 면역반응에 대한 AmpliSeq, 포커스, 종합 패널 v3, 맞춤형 패널에 대한 키트당 100건의 반응, Illumina 전사체 인간 유전자 발현, 골수, 면역 레퍼토리 플러스, TCR 베타 패널에 대한 AmpliSeq 키트당 200건의 반응).

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AmpliSeq™ for Illumina® Sample ID Panel

20019162

AmpliSeq Library PLUS for Illumina와 페어링 시 96개 반응에 충분한 8개의 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP) 표적 프라이머 쌍과 1개의 성별 구별 프라이머 쌍이 포함됩니다. 빠르고 정확한 시료 식별이 가능합니다. 라이브러리 준비, 프로브 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

파라핀 제거 또는 DNA 정제 없이 Illumina 프로토콜용 AmpliSeq를 사용하여 라이브러리 구성을 위해 비염색 슬라이드 장착 FFPE 조직으로부터 DNA를 준비하는 24가지 반응을 포함합니다.

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

시퀀싱을 위해 Illumina 라이브러리용 AmpliSeq를 준비할 때 라이브러리 정규화를 위한 비드 및 시약이 포함됩니다.

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

iSeq 100 Reagents

iSeq 100 System용 시약은 간단하고 저렴한 시퀀싱을 위한 1채널 SBS 화학 및 CMOS 기술을 갖춘 즉시 사용 가능한 카트리지가 특징입니다.

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