De Novo 시퀀싱
De Novo 시퀀싱은 무엇인가요?
De novo 시퀀싱은 정렬을 위해 사용 가능한 참조 시퀀스가 없는 새로운 유전체를 시퀀싱하는 것을 말합니다. 시퀀스 리드는 콘티그로 조합되고 de novo 시퀀스 데이터의 커버리지 품질은 콘티그에 크기와 연속성에 따라 다릅니다(예: 데이터에서 갭의 수).
차세대 시퀀싱(NGS)은 생어 시퀀싱과 같은 기존 방법에 비해 모든 종의 특성을 더 빠르고 정확하게 규명할 수 있습니다. Illumina NGS 기술은 모든 종에 대해 신속하고 포괄적이며 정확한 특성 규명을 제공합니다.
De Novo 시퀀싱의 장점
- 복잡하거나 배수체 유전체에 대해서도 정확한 참조 시퀀스를 생성합니다
- 새로운 유기체의 유전체를 매핑하거나 알려진 생물의 유전체를 완성하는 데 유용한 정보를 제공합니다
- 정확한 de novo 조립을 위해 매우 유사하거나 반복적인 영역을 명확히 구분합니다
- 결실, 역전 또는 전위와 같은 구조적 변이와 복잡한 재배열을 식별합니다
정확한 De Novo 유전체 조립
처음으로 유전체를 시퀀싱할 때, 결합된 접근 방식을 사용하면 더 높은 품질의 어셈블리를 얻을 수 있습니다. 예를 들어, 짧은 삽입, 페어드 엔드 및 긴 삽입, 메이트 페어(mate pair) 시퀀스를 결합하는 것은 커버리지를 극대화하는 한 가지 옵션입니다. 더 높은 뎁스로 시퀀싱된 짧은 리드는 긴 삽입으로 커버되지 않는 갭을 메울 수 있습니다.
이 조합을 통해 광범위한 구조적 변이 유형을 감지할 수 있으며 복잡한 재배열을 정확하게 식별하는 데 필수적입니다.
주요 De Novo 시퀀싱 기사
Illumina 시퀀서는 코로나바이러스의 특성을 규명하고 제어하는 데 도움이 됩니다
New England Journal of Medicine에 게재된 다른 기술과 함께 신종 코로나바이러스 유전체의 de novo 시퀀싱 및 특성 규명을 위해 Illumina NGS가 어떻게 사용되었는지 확인해 보세요.
기사 읽어 보기
고구마 바이러스 식별
남아프리카 Agricultural Research Council의 과학자들은 식량 안보를 강화하기 위해 시퀀싱을 통해 알려진 고구마 바이러스와 새로운 고구마 바이러스를 식별합니다.
기사 읽어 보기
종 연구의 발전
Okinawa Institute of Science and Technology의 연구원들은 육지와 바다에 서식하는 다양한 종을 식별하고 특성을 규명하고 목록화하기 위해 de novo 시퀀싱 및 기타 NGS 방법을 사용합니다.
기사 읽어 보기COVID-19 감염 취약성에 대한 유전자 연구 조사
Illumina는 중증 및 경증 COVID-19 환자의 유전체를 비교하기 위해 설립된 Genomics England가 주도하는 영국 전역의 연구에 시퀀싱을 제공하고 있습니다. 이 연구는 취약성과 관련된 유전적 요인을 밝혀내는 데 도움이 될 수 있습니다.
기사 읽어 보기
De Novo 박테리아 시퀀싱을 위한 권장 워크플로우
포괄적인 De Novo 유전체 시퀀싱 워크플로우
Illumina의 sequencing by synthesis(SBS) chemistry는 가장 널리 활용되고 있는 NGS 기술로, 전 세계 시퀀싱 분석 데이터의 약 90%가 이 기술을 통해 생성됩니다.*
업계 최고의 데이터 품질 외에도, Illumina는 라이브러리 준비부터 데이터 분석에 이르기까지 de novo 시퀀싱을 간소화하는 통합적 워크플로우를 제공합니다.
아래 를 클릭하시면 각 워크플로우 단계별 제품을 확인하실 수 있습니다.
Illumina DNA PCR-Free Prep
인간 WGS, de novo 미생물 유전체 어셈블리, 종양 정상 변이 콜과 같은 민감한 애플리케이션을 위한 탁월한 사용 편의성, 균일한 커버리지, 높은 정확도의 데이터를 제공합니다.
롱 리드 시퀀싱
롱-리드 기술에 대해 자세히 알아보고 de novo 어셈블리 서비스부터 유전체 페이징 및 구조적 변이 검출에 이르는 다양한 파트너십 제품을 살펴보세요.
iSeq 100 System
미생물 종에 대해 균일한 커버리지와 유전체 어셈블리를 제공하는 빠르고 사용이 용이하며 경제적인 시퀀싱입니다.
MiSeq® System표적 시퀀싱 및 작은 유전체 시퀀싱에 적합한 속도와 간소함
NovaSeq 6000 시스템거의 대부분의 유전체, 시퀀싱 방법, 프로젝트 규모에 따라 조정이 가능한 처리량과 유연성을 제공합니다.
Illumina 시퀀싱 플랫폼
시퀀싱 플랫폼을 비교하고 실제 검사실과 애플리케이션에 가장 적합한 시스템을 확인해 보세요.
시퀀싱 시약각 Illumina 시퀀싱 시스템에 맞는 시퀀싱 시약, 플로우 셀 및/또는 버퍼가 포함된 키트를 찾아 보세요.
BaseSpace SPAdes Genome Assembler 앱
단일세포 및 분리주 유전체에 적합한 De novo assembler
BaseSpace Velvet De Novo Assembly 앱Velvet assembler을 사용한 박테리아 유전체의 de novo assembly
Integrative Genomics Viewer복잡한 변이 분석을 수행하기 위해 여러 샘플의 정렬 및 변이를 표시합니다.
DRAGEN Bio-IT Platform
NGS 데이터의 초고속 2차 분석을 수행합니다.
BaseSpace Sequence HubNGS 데이터 분석 및 관리 시 이용하는 Illumina의 유전체학 컴퓨팅 환경입니다.
NovaSeq 6000 Flow Cell Options
Reagent kits for the NovaSeq 6000 System are available in multiple flow cell configurations to support a broad range of applications. SP and S1 are ideal for small batch sizes or in situations where rapid turnaround time is required. S2 is a quick, powerful, and cost-effective option for high-throughput applications. S4 offers ultra-high throughput sequencing across a wide range of sequencing methods.
View Kits
관련 솔루션
NGS 회사 선택하기
사용이 용이한 바이오인포매틱스 도구와 업계를 선도하는 지원 및 서비스를 보유한 업계 최고 수준의 차세대 시퀀싱 회사를 확인해 보세요. 증거 보기.
미생물 시퀀싱
미생물 전장 유전체 시퀀싱은 새로운 유기체의 유전체를 매핑하거나, 알려진 유기체의 유전체를 완성하거나, 여러 샘플의 유전체를 비교하는 데 중요한 도구입니다. 미생물 WGS에 대해 자세히 알아보세요.
암 전장 유전체 시퀀싱
종양 샘플의 전장 유전체 시퀀싱은 암 조직의 고유한 돌연변이에 대한 종합적인 관점을 제공하여 발암 유전자, 종양 억제인자 및 기타 위험 요인에 대한 분석 정보를 제공합니다. 암 WGS에 대해 자세히 알아보세요.
메타지노믹스
미생물학자들은 샷건 메타지노믹스 시퀀싱을 통해 박테리아 다양성을 평가하고 다른 방법으로는 분석이 어렵거나 불가능한 배양 불가능한 미생물을 연구할 수 있습니다. 메타지노믹 시퀀싱에 대해 자세히 알아보세요.
식물 및 동물 시퀀싱
De novo 시퀀싱은 식물이나 동물의 기능과 환경적 상호작용에 대한 인사이트를 제공할 수 있습니다. 일부 연구자들은 조립된 유전체를 사용해 지도 위치를 지정하고 다양한 품종 정보를 쌓아 후속 SNP 발견에 활용합니다. 식물 및 동물 시퀀싱에 대해 자세히 알아보세요.
뉴스레터, 사례 연구 및 유전체 분석 기법에 대한 정보를 받고 싶으신가요? 이메일 주소를 입력해 주세요.
*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015