작은 전장 유전체 시퀀싱
작은 전장 유전체 시퀀싱 소개
작은 유전체 시퀀싱(≤ 5 Mb)에는 세균, 바이러스 또는 기타 미생물의 전장 유전체를 시퀀싱한 다음 해당 시퀀스를 알려진 참조 유전체와 비교하는 작업이 포함됩니다. 작은 미생물 유전체 시퀀싱은 공중 보건 분야의 식품 검사, 감염병 감시 시스템, 분자 역학 연구 및 환경 메타지노믹에 유용할 수 있습니다.
작은 유전체 시퀀싱의 장점
- 단일 유기체 배양체에서 모든 유전자 조사가 가능합니다.
- 수천 개의 유기체를 동시에 시퀀싱합니다.
- 미생물 또는 바이러스 유전체에 대한 포괄적인 분석을 제공합니다.
- 상동 염색체의 고유한 유전자 정보를 제공하고 일배체형을 지원하여 미생물 또는 바이러스 샘플 내에서의 새로운 생체표지자 발견에 도움이 됩니다.
신속한 무배양 미생물 분석
기존 접근법과 달리 차세대 시퀀싱(NGS)를 사용한 작은 전장 유전체 시퀀싱(WGS) 연구는 노동 집약적인 복제 단계에 의존하지 않습니다. 또한 NGS를 사용하면 생물학자들은 멀티플렉싱을 통해 수백 개의 유기체를 동시에 시퀀싱할 수 있습니다. NGS는 누락될 수 있거나 다른 방법을 사용해 식별하면 비용이 너무 많이 드는 저주파 변이, 유전체 재배열 및 기타 유전적 변화를 식별할 수 있습니다. 작은 유전체의 경우 DNA 라이브러리를 2일 만에 준비, 시퀀싱 및 분석할 수 있습니다.
작은 전장 유전체 시퀀싱을 위한 권장 워크플로우
라이브러리 준비
시퀀싱
데이터 분석
전장 유전체 시퀀싱 및 신약 발견
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포괄적인 작은 전장 유전체 워크플로우
Illumina의 sequencing by synthesis(SBS) chemistry는 가장 널리 활용되고 있는 NGS 기술로, 전 세계 시퀀싱 분석 데이터의 약 90%가 이 기술을 통해 생성됩니다.*
업계 최고의 데이터 품질 외에도, Illumina는 라이브러리 준비부터 데이터 분석에 이르기까지 작은 유전체 시퀀싱을 간소화하는 통합적 워크플로우를 제공합니다.
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*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015