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Pan-Coronavirus Panel

Pan-Coronavirus Panel

이 패널은 인간과 동물 저장소에서 얻은 225종의 알려진 신종 코로나바이러스에 대한 특성 규명과 유전체 감시 시스템을 지원합니다.

< 9시간 라이브러리 준비 시간

Assay 시간

< 2시간 라이브러리 준비 시간

수작업 시간

10~100 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Pan-Coronavirus Panel 패널(Pan-CoV)은 알려진 인간 및 동물 코로나바이러스와 인간에 감염될 가능성이 있는 밀접한 관련이 있는 신종 코로나바이러스의 검출 및 시퀀싱을 가능하게 합니다. 여기에는 여러 코로나바이러스 균주 및 알려진 다양한 동물 숙주의 기준 유전체에 걸쳐 있는 hybrid–capture oligos를 포함합니다.

Illumina RNA Prep with Enrichment와 결합하면, Pan-Coronavirus Panel은 알려진 225종의 인간 및 동물 코로나바이러스에 대한 전장 유전체 시퀀싱(WGS)을 가능하게 합니다. 표적 농축 접근법은 바이러스 유전체 전체에서 돌연변이와 변이를 포착하여 신종 코로나바이러스 균주의 염기서열분석과 균주 간 재조합 검출을 가능하게 합니다.

패널은 다음과 같은 여러 응용 분야에 사용할 수 있습니다.

  • 동물 숙주에서 코로나바이러스를 식별하고 모니터링하기 위한 감시 시스템

  • 전염 패턴 및 바이러스 돌연변이 추적

  • 가이드 백신 및 치료 개발

통합 바이러스 시퀀싱 솔루션

Pan-Coronavirus 패널은 라이브러리 준비, 표적 농축, 차세대 염기서열 분석(NGS) 및 강력한 데이터 분석을 포함하는 포괄적인 워크플로우에 통합될 수 있으며, 강력하고 신뢰할 수 있는 바이러스 결과를 얻을 수 있는 간단한 수단을 제공합니다.

사양

Assay 시간 < 9시간 라이브러리 준비 시간
자동화 기능 Liquid handling robots
설명 Pan-Coronavirus 패널은 다양한 동물 숙주에서 200개 이상의 알려진 신종 코로나바이러스 균주를 검출하고 전장 유전체 염기서열분석을 가능하게 하는 통합 워크플로우의 일부입니다.
수작업 시간 < 2시간 라이브러리 준비 시간
사용량 10~100 ng
Instruments MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System
작용 기전 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계
방법 Whole-genome sequencing, Target enrichment
멀티플렉싱 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플
Nucleic acid type RNA
Species category Virus
Strand specificity Non-stranded
Technology Sequencing

필수 제품

Illumina RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation(16 또는 96개 샘플)은 인덱스 어댑터와 함께 별도로 주문해야 합니다. Illumina DNA/RNA 인덱스 세트 A, B, C, 또는 D가 사용될 수 있다.

Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D, (20091654, 20091656, 2009165820091660)에 대한 IDT20042667가 중단되고 있으므로 Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20027213, 20027214, 20042666)를 주문하는 것이 좋습니다.

 

/ 결과

애플리케이션

하이브리드 캡처를 통한 표적 인리치먼트(Target Enrichment)는 동물 저장소 감시 시스템, 전염 추적, 치료 및 백신 개발을 위해 225개의 알려진 인간 및 동물 코로나바이러스와 밀접하게 관련된 신종 코로나바이러스의 검출 및 시퀀싱을 가능하게 합니다.

예시 워크플로우

1
준비

Pan-Coronavirus Panel

2
시퀀스
3
분석

프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
MiSeq System

6–12 samples using MiSeq Reagent Kit v2 (1–2M reads/sample) 

2 × 150 bp
NextSeq 550 System

65–130 samples using NextSeq 500/550 Mid-Output Kit (1–2M reads/sample)

2 × 150 bp
NextSeq 1000 System

100–200 samples using P2 Reagent Kit (1–2M reads/sample)

2 × 150 bp
NextSeq 2000 System

100–200 samples using P2 Reagent Kit (1–2M reads/sample)

2 × 150 bp

관련 애플리케이션 및 방법

감염병의 유전체 감시 시스템

NGS는 코로나바이러스의 새로운 균주 및 기타 새로운 감염병 제제의 식별을 통해 효과적인 유전체 감시 시스템 전략을 뒷받침합니다.

코로나바이러스 시퀀싱

NGS는 신종 코로나바이러스 변이를 식별하고, COVID-19 전파를 추적하는 등 다양한 기능을 수행할 수 있습니다. 다양한 코로나바이러스 시퀀싱 목표에 대한 NGS 방법을 비교합니다.

미생물 유전체학

NGS를 사용하여 새로운 미생물을 발견하고, 질병 발생을 모니터링하고, 먹이 공급원을 분석하는 등의 더 많은 작업을 수행해 보세요.

다른 사람들이 이 제품을 사용하는 방법
이스라엘에 최첨단 임상 연구 시퀀싱 실험실 건설
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문서

제품 관련 자료
Support documentation

비교하기

Pan-Coronavirus Panel Viral Surveillance Panel Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit
Assay 시간 < 9시간 라이브러리 준비 시간 < 9시간 라이브러리 준비 시간 < 9시간 라이브러리 준비 시간
자동화 기능 Liquid handling robots Liquid handling robots Liquid handling robots
설명 Pan-Coronavirus 패널은 다양한 동물 숙주에서 200개 이상의 알려진 신종 코로나바이러스 균주를 검출하고 전장 유전체 염기서열분석을 가능하게 하는 통합 워크플로우의 일부입니다. Illumina RNA Prep with Enrichment가 포함된 Viral Surveillance Panel은 66개의 RNA 및 DNA 바이러스 병원체의 바이러스 발생 검출 및 모니터링을 지원하는 최적화된 워크플로우를 제공합니다. SARS-CoV-2 및 기타 흔한 호흡기 바이러스를 검출하고 분석하기 위한 간소화된 워크플로. 비의존적 설계는 여러 관심대상 검체 유형 전반에서 병원성 바이러스의 광범위한 식별을 가능하게 한다.
수작업 시간 < 2시간 라이브러리 준비 시간 < 2시간 라이브러리 준비 시간 < 2시간 라이브러리 준비 시간
사용량 10~100 ng 10~100 ng 10~100 ng
Instruments MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, MiniSeq System
작용 기전 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계
방법 Whole-genome sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Whole-genome sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment
멀티플렉싱 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플
Nucleic acid type RNA DNA, RNA DNA, RNA
Species category Virus Virus Human, Virus
Strand specificity Non-stranded Non-stranded
Technology Sequencing Sequencing Sequencing

선택 도구:

Library Prep and Array Kit Selector

Find the right sequencing library preparation kit or microarray for your needs. Filter by method, species, and more. Compare, share, and order kits.

그림 자료

패널에서 다루는 코로나바이러스 균주

Pan-Coronavirus 패널에는 225개의 알려진 인간 및 동물 코로나바이러스를 포획하는 하이브리드 포획 올리고가 포함되어 있습니다.

숙주 관련 코로나바이러스 유전체

Pan-Coronavirus 패널에는 알려진 다양한 동물 숙주가 포함되어 있습니다.

Coronaviridae 판독치 강화

Pan-Coronavirus Panel은 다양한 바이러스 복제수 입력에 걸쳐 테스트된 모든 라이브러리에서 코로나 바이러스 판독을 성공적으로 강화했습니다.

코로나바이러스 유전체 커버리지 개선

범코로나바이러스 패널로 강화 후 10 ng UHR에서 합성 바이러스 RNA 대조(SARS-CoV-2 및 HCoV229E)의 범위 중앙값. 증가된 판독 깊이(상단) 및 판독 길이(하단)는 개선된 게놈 커버리지를 초래하였다. 판독 길이를 36, 74, 100 및 149 bp로 트리밍하였다.

패널 (1)

Pan-Coronavirus Panel, RUO 96 Rxns

20088155

Illumina RNA Prep with Enrichment 키트와 함께 사용할 경우 32, 3-plex 농축 반응에 충분한 바이러스 감시 패널이 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 강화 키트와 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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라이브러리 프렙 (2)

Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (16 Samples)

20040536

16개의 라이브러리(16개의 1-플렉스 증균 반응)를 준비하고 증균하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널, 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (96 Samples)

20040537

96개의 라이브러리(32, 3-플렉스 증균 반응)를 준비하고 증균하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널, 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (8)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스 포함. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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선택 품목 요약

제품

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FAQ

패널은 대부분의 변형을 효과적으로 포착할 수 있는 증균 프로브로 제작되었습니다. 또한, Pan-Coronavirus Panel은 다양한 동물 유래의 225가지 코로나바이러스 유전형을 풍부하게 하도록 설계되었으며 대부분의 신종 코로나바이러스를 캡처할 것으로 예상됩니다. 예를 들어, Pan-Coronavirus Panel은 오미크론 변이체 이전에 설계되었지만, 여전히 높은 커버리지를 갖는 전체 유전체(genome)를 풍부하게 하는 것으로 나타났습니다(자세한 내용은 데이터 시트 참조).

예, Pan-Coronavirus Panel은 환경 샘플과 다양한 동물 유래의 샘플을 처리하도록 설계되었습니다. 실제로 이 패널은 박쥐, 폐수 및 모든 잠재적 코로나바이러스 숙주와 같은 다양한 샘플 유형의 코로나바이러스 염기서열분석에 사용됩니다. 패널 성공을 극대화하려면 얻을 수 있는 최고 품질의 RNA를 사용하십시오.

다른 출력 외에도, 콘티그를 조립하고 유전체 커버리지/깊이를 탐색할 수 있는 무료 DRAGEN 미생물 농축 BaseSpace 앱이 있습니다. 

/ 결과

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

NextSeq 1000/2000 Reagents

NextSeq 1000/2000 시스템용 시약은 사용하기 쉬운 카트리지와 유연한 시퀀싱 옵션을 위한 다중 플로우 셀 구성이 특징입니다.

Nextera XT DNA Library Preparation Kit

DNA 투입 요구량이 적은 작은 유전체, PCR 앰플리콘, 플라스미드 및 cDNA 염기서열 분석을 위한 DNA 라이브러리를 준비하는 90분 워크플로우를 제공합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

Illumina UD Indexes

고유한 듀얼(UD) 인덱스를 사용하면 처리량을 늘리고 비용 절감의 이점을 위해 다중화할 수 있는 고품질 라이브러리를 준비할 수 있습니다.

Illumina DNA Prep with Enrichment

광범위한 표적 염기서열 분석 애플리케이션을 위한 염기서열 분석용 DNA 라이브러리 프렙을 제공하는 빠른 통합 워크플로우입니다.

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