Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit

SARS-CoV-2 균주를 포함한 일반적인 호흡기 바이러스의 매우 민감한 검출 및 특성화를 제공하는 간소화된 워크플로우입니다.

< 9시간 라이브러리 준비 시간

Assay 시간

< 2시간 라이브러리 준비 시간

수작업 시간

10~100 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

Respiratory Virus Oligos Panel V2(RVOP v2, 카탈로그 번호 20044311)는 이제 Respiratory Virus Oligo Panel V2, library prep and enrichment reagents, and index adapters를 포함하는 포괄적인 키트(세트 A-D)로 판매됩니다. 독립형 RVOP v2 제품 또는 개별 구성품은 MyIllumina를 통해 구입하실 수 있습니다.

개요

이전에 Respiratory Virus Oligo Panel (RVOP) 제품은 Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit 및 SARS-CoV-2 and influenza A/B와 같은 일반적인 호흡기 바이러스를 검출하는 효과적이고 간소화된 방법을 제공합니다. 

  • 바이러스 진화 또는 바이러스 감시를 위한 변이 분석 이해1

  • 바이러스 전파 패턴을 결정하고 재수술을 예측

  • 동시 감염과 복합 질환에서의 그 역할을 식별하고 특성화합니다.

호흡기 바이러스 검출을 위한 표적 강화

하이브리드 캡처 방법을 통한 표적 강화는 샷건 메타지노믹 시퀀싱에 필요한 높은 리드 깊이 없이 매우 민감한 검출을 가능하게 합니다. 또한, 이 방법은 표적 바이러스에 대한 전장 유전체 시퀀싱 데이터를 생성하면서 앰플리콘 시퀀싱에 비해 포괄적인 프로파일링을 위해 극적으로 더 큰 프로브 패널을 가능하게 합니다.

바이러스 애플리케이션을 위한 간소화된 솔루션

이 포괄적인 워크플로우는 라이브러리 준비, 표적 강화, 시퀀싱 및 데이터 분석을 통합하여 연구자와 공중 보건 과학자에게 하나의 워크플로우로 여러 바이러스와 변이를 모니터링할 수 있는 기능을 제공합니다.


사양


필수 제품

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit에는 Respiratory Virus Oligo Panel( RVOP) v2, Illumina RNA Prep with Enrichment 및 4개의 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index) 플레이트 중 하나가 포함되어 있습니다. 384개의 샘플을 한 번에 실행하려면 4개의 세트(A, B, C 및 D)를 모두 주문하십시오. 필요한 추가 Illumina 시약에는 Illumina 시퀀서와 적절한 시퀀싱 시약 및 플로우 셀(들)이 포함됩니다.
/ 결과

애플리케이션

Illumina 호흡기 바이러스 농축 키트, Illumina 시퀀싱 및 DRAGEN 2차 분석은 40개 이상의 일반적인 인간 호흡기 바이러스를 검출하고 특성화할 수 있는 간소화된 워크플로우를 제공합니다. 

워크플로우 예시


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System Rapid: 20 samples, 1M clusters and a minimum of 1M single-end reads per sample 1 × 100 bp
MiSeq System v3 reagents: ~20 samples, 1M clusters and a minimum of 1 M single-end reads per sample 1 × 150 bp
NextSeq 550 System High output: 384 samples, 1M clusters and a minimum of 1M single-end reads per sample 1 × 150 bp

관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
Assay 시간 < 9시간 라이브러리 준비 시간 < 9시간 라이브러리 준비 시간
자동화 기능 Liquid handling robots Liquid handling robots
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
콘텐츠 사양 SARS-CoV-2, 인플루엔자 A 및 B 바이러스, 아데노바이러스, 리노바이러스, 호흡기 세포융합 바이러스, 기타 흔한 호흡기 바이러스를 포함한 약 40종의 흔한 호흡기 바이러스를 표적으로 하고 특성을 규명한다. 호흡기 병원체 DNA와 RNA를 동시에 검출하고 항균 내성(AMR) 유전자 발현을 동시에 프로파일링합니다.
설명 SARS-CoV-2 및 기타 흔한 호흡기 바이러스를 검출하고 분석하기 위한 간소화된 워크플로. 비의존적 설계는 여러 관심대상 검체 유형 전반에서 병원성 바이러스의 광범위한 식별을 가능하게 한다. 호흡기 감염 및 동시 감염을 식별하고, 항균제 내성 표지자를 검출하며, 바이러스 진화 및 전파를 연구하기 위해 주요 병원체(SARS-CoV-2 및 Flu A/B 바이러스)의 균주 유형 분석을 실시한다.
수작업 시간 < 2시간 라이브러리 준비 시간 < 2시간 라이브러리 준비 시간
사용량 10~100 ng 용량 기준(농도 의존적 아님)
Instruments MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, MiniSeq System MiSeq System, NextSeq 550 System, MiniSeq System
작용 기전 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계
방법 Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment
멀티플렉싱 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플
Nucleic acid type DNA, RNA DNA, RNA
샘플의 종류 세부 사항 비강 면봉 및 세척, 폐수 등
Species category Human, Virus Fungal, Virus, Bacteria
종 세부 사항 최근 인플루엔자 바이러스 균주 및 SARS-CoV-2 등 일반적인 호흡기 바이러스를 검출합니다. 패널에는 품질 기능으로 인간 표적에 대한 프로브가 포함되어 있으므로 분석된 모든 샘플의 인간 표적을 검출합니다. 호흡기 병원체(180+ 세균, 50+ 진균, SARS-CoV-2를 포함한 40+ 바이러스) 및 항균 내성 대립유전자(1200+)를 검출한다.
Technology Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels)

선택 도구

그림 자료

호흡기 바이러스 검출을 위한Enrichment workflow

호흡기 바이러스 검출을 위한 간소화된 NGS 워크플로우는 검체 준비, 라이브러리 프렙, 표적 농축, 염기서열 분석, 자료 분석을 통합합니다.

고감도 SARS-CoV-2 검출

정의된 양의 바이러스 복제물을 첨가한 인간 타액 RNA의 적정 실험에서, Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit는 최저 2개의 SARS-CoV-2 바이러스 RNA 복제물로부터 바이러스 판독을 검출했습니다.

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit에 의해 검출된 바이러스

Respiratory Virus Oligo Panel에는 흔한 호흡기 바이러스, 최근 독감 균주, SARS-CoV-2, 양성 대조물질로 작용하는 인간 프로브를 검출하는 7800개의 프로브가 포함되어 있다. 모든 프로브는 80량체 올리고이며, 매우 가깝게 이격되어 패널의 모든 바이러스에 대한 완전한 게놈 커버리지를 제공합니다.

인간 코로나바이러스 229E 인간 파라인플루엔자 바이러스 1 인간 보카바이러스 4 NI 균주 HBoV4-NI-385 인플루엔자 A 바이러스(A/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013(H7N9))
인간 코로나바이러스 NL63 인간 파라인플루엔자 바이러스 2 KI 폴리오마바이러스 스톡홀름 60 인플루엔자 A 바이러스(A/홍콩/1073/99(H9N2))
인간 코로나바이러스 OC43 인간 파라인플루엔자 바이러스 3 WU 폴리오마바이러스 인플루엔자 A 바이러스(A/Texas/50/2012(H3N2))
인간 코로나바이러스 HKU1 인간 파라인플루엔자 바이러스 4a 인간 파레코바이러스 제1형 PicoBank/HPeV1/a 인플루엔자 A 바이러스(A/미시간/45/2015(H1N1))
SARS-CoV-2 인간 메타뉴모바이러스(CAN97-83) 인간 파레코바이러스 6 인플루엔자 B 바이러스(B/Lee/1940)
인간 아데노바이러스 B1 호흡기 세포융합 바이러스(A형) 인간 리노바이러스 A89 인플루엔자 B 바이러스(B/위스콘신/2010년 1월)
인간 아데노바이러스 C2 인간 호흡기 세포융합 바이러스 9320(B형) 인간 리노바이러스 C(균주 024) 인플루엔자 B 바이러스(B/Brisbane/60/2008)
인간 아데노바이러스 E4 인플루엔자 A 바이러스(A/푸에르토리코/8/1934(H1N1)) 인간 리노바이러스 B14 인플루엔자 B 바이러스(B/Colorado/2017년 6월)
인간 보카바이러스 1(영장류 보카파보바이러스 1 분리주 st2) 인플루엔자 A 바이러스(A/Korea/426/1968(H2N2)) 인간 엔테로바이러스 C104 균주: AK11 인플루엔자 B 바이러스(B/워싱턴/2019년 2월)
인간 보카바이러스 2c PK 분리주 PK-5510 인플루엔자 A 바이러스(A/뉴욕/392/2004(H3N2)) 인간 엔테로바이러스 C109 분리주 NICA08-4327 인간 대조 유전자
인간 보카바이러스 3 인플루엔자 A 바이러스(A/구스/광동/1/1996(H5N1))    

Illlumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set A (96 indexes, 96 samples)

20100469

Illumina RNA Prep with Enrichment 라이브러리 준비 및 혼성화 시약, Respiratory Virus Oligo Panel v2 및 IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A를 포함한 완전한 혼성화 기반 증균 키트. 각 키트는 혼성화 반응당 3개의 라이브러리가 있는 32개의 혼성화 반응에서 96개의 검체에 충분한 시약을 제공합니다. SARS-CoV-2 및 인플루엔자를 포함한 40가지 공통 인간 호흡기 바이러스의 농축을 가능하게 하며 각 표적 바이러스에 대한 전체 유전체 서열을 생성한다.

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set B (96 indexes, 96 samples)

20100470

Illumina RNA Prep with Enrichment 라이브러리 준비 및 혼성화 시약, Respiratory Virus Oligo Panel v2 및 IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B를 포함한 완전한 혼성화 기반 증균 키트. 각 키트는 혼성화 반응당 3개의 라이브러리가 있는 32개의 혼성화 반응에서 96개의 검체에 충분한 시약을 제공합니다. SARS-CoV-2 및 인플루엔자를 포함한 40가지 공통 인간 호흡기 바이러스의 농축을 가능하게 하고 각 표적 바이러스에 대한 전체 유전체 서열을 생성한다.

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set C (96 indexes, 96 samples)

20100471

Illumina RNA Prep with Enrichment 라이브러리 준비 및 혼성화 시약, Respiratory Virus Oligo Panel v2, Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C용 IDT®를 포함한 완전한 혼성화 기반 증균 키트. 각 키트는 혼성화 반응당 3개의 라이브러리가 있는 32개의 혼성화 반응에서 96개의 검체에 충분한 시약을 제공합니다. SARS-CoV-2 및 인플루엔자를 포함한 40가지 공통 인간 호흡기 바이러스의 농축을 가능하게 하며 각 표적 바이러스에 대한 전체 유전체 서열을 생성한다.

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set D (96 indexes, 96 samples)

20100472

Illumina RNA Prep with Enrichment 라이브러리 준비 및 혼성화 시약, Respiratory Virus Oligo Panel v2 및 IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D를 포함한 완전한 혼성화 기반 증균 키트. 각 키트는 혼성화 반응당 3개의 라이브러리가 있는 32개의 혼성화 반응에서 96개의 검체에 충분한 시약을 제공합니다. SARS-CoV-2 및 인플루엔자를 포함한 40가지 공통 인간 호흡기 바이러스의 농축을 가능하게 하며 각 표적 바이러스에 대한 전체 유전체 서열을 생성한다.

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선택 품목 요약

제품

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Unit Price

FAQ

Respiratory Virus Enrichment Kit는 포르말린 고정, 비강 면봉, 비강 세척 및 폐수 샘플을 포함한 광범위한 샘플 소스를 지원합니다.

호흡기 바이러스 농축 키트 라이브러리 준비 및 농축 프로토콜은 < 9시간, < 2시간의 실습 시간이 소요됩니다.

MiniSeq 신속 시약 키트, MiniSeq 염기서열 분석 시스템 및 DRAGEN RNA 병원체 검출 앱과 함께 사용하면 전체 프로세스를 < 24시간 내에 완료할 수 있습니다. 호흡기 바이러스의 빠른 검출에 대해 자세히 알아보십시오.

예, 이 키트는 혼성화 기반 증균을 사용하며 40개 이상의 바이러스에 대한 프로브를 포함하므로 여러 바이러스를 검출할 수 있습니다. Illumina RNA Prep with Enrichment를 사용하여 호흡기 바이러스를 검출하고 특성화하는 방법에 대해 자세히 알아보십시오.

Illumina 호흡기 바이러스 농축 키트에는 DRAGEN RNA 병원체 검출 앱 과 DRAGEN 표적 미생물 앱의 무료 사용이 포함되어 있으며, 둘 다 병원체 데이터를 분석하고 공통 서열을 생성합니다.

/ 결과

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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