TruSeq DNA Nano

전장 유전체 염기서열분석 라이브러리를 생성하고 이용 가능한 DNA가 제한된 검체를 효율적으로 조사합니다.

약 6시간의 총 분석 시간

Assay 시간

~4시간

수작업 시간

genomic DNA 100 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

Illumina DNA Prep 및  Illumina DNA PCR-Free Prep 을 사용할 수 있습니다. 이러한 라이브러리 준비 솔루션은 TruSeq DNA Nano에 비해 처리 시간과 작업 시간을 줄이면서 향상된 성능을 제공합니다.

개요

TruSeq DNA Nano는 이용 가능한 DNA가 제한된 샘플을 효율적으로 조사할 수 있게 합니다. 기계적 단편화-결찰 화학에 기반한 이 저입력 방법은 거의 모든 시퀀싱 응용 분야에서 높은 커버리지 품질과 감소된 바이어스를 제공합니다.

주요 기능

  • 낮은 샘플 입력을 위해 설계됨

  • 높은 커버리지 품질

  • 가속 라이브러리 준비

하루 이내에 고품질 라이브러리 수동 준비

TruSeq DNA Nano는 겔 기반 크기 선택을 비드 기반 선택으로 대체함으로써 간소화되었으며, 연구원들이 하루도 안 되는 시간에 고품질 라이브러리를 준비할 수 있도록 합니다. 2 × 101bp에서 2 × 151bp까지 다양한 판독 길이에 최적화되어 있습니다.

제한된 DNA 검체와 함께 사용

TruSeq DNA Nano는 최소 100 ng의 입력으로 우수한 결과를 제공하므로 DNA 마이크로그램에 대한 일반적인 요구 사항이 없습니다. 이를 통해 연구자들은 이용 가능한 DNA가 제한된 검체(예: 종양 검체)를 연구할 수 있으며 향후 또는 대체 임상시험에서 사용하기 위해 검체를 보존하는 데 도움이 됩니다. 비드 기반 크기 선택은 워크플로를 가속화하는 것 외에도 겔 기반 선택과 관련된 일반적인 샘플 손실을 방지합니다.

라이브러리 편향 및 적용 범위 격차 감소

TruSeq DNA Nano는 일반적인 PCR 유도 갭의 수와 평균 크기를 감소시킵니다. 향상된 워크플로우는 라이브러리 바이어스를 줄이고 유전체 전반의 적용 범위 균일성을 개선합니다. 이러한 키트는 또한 GC가 풍부한 영역, 프로모터 및 반복 영역을 포함하여 전통적으로 도전적인 게놈 함량에 대한 우수한 커버리지를 제공합니다. 이를 통해 연구자들은 각 염기서열분석 실행에서 더 많은 정보에 접근할 수 있습니다. Truseq DNA Nano 제품은 거의 모든 차세대 시퀀싱 응용 분야를 위한 고품질 유전체학 적용범위에 대해 검증되었습니다.

유연한 처리량 옵션 이용

  • 단일 인덱스가 있는 TruSeq DNA Nano는 저처리량(LT) 연구를 위한 24개 샘플 수동 처리를 지원합니다.
  • 96개의  CD 인덱스가 있는 TruSeq DNA Nano는 고처리량(HT) 연구를 위한 96개 샘플 처리를 지원하며 액체 처리 로봇에서 자동화(또는 수동 처리)할 수 있습니다.
  • Illumina 고유 이중(UD) 인덱스(24 또는 96)용 IDT는 판독의 정확한 할당과 유동 셀의 효율적인 사용을 가능하게 하는 향상된 플렉시티를 제공합니다.

빠르고 자동화를 지원하는 워크플로우

하루 안에 Illumina 시퀀싱을 위한 라이브러리를 준비해 보세요. Illumina의 적격 방법은 파트너를 통해 다양한 자동화 플랫폼에서 사용할 수 있습니다.


사양


필수 제품

Illumina는 이제 워크플로우의 유연성을 위해 모듈식 제품 주문을 제공합니다. 다음 인덱스가 있는 다음 라이브러리 준비 제품을 주문할 수 있습니다. 

Illumina Advantage 대규모 시퀀싱 제품은 운영 성공을 보장하기 위해 최고 수준의 서비스와 지원을 제공합니다. 로트별 배송 및 테스트, 연장된 유통기한, 실험실 효율성을 높이기 위한 고급 변경 알림이 특징입니다. 

Illumina 프리 어댑터 차단 시약은 인덱스 호핑 위험을 최소화하기 위해 라이브러리 풀에서 프리 어댑터를 차단하도록 설계된 선택적 효소 솔루션입니다.

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

1 sample per run (based on 30× coverage of a human genome)

350 bp 삽입: ≤ 2 × 100 bp
550 bp 삽입: ≤ 2 × 150 bp


관련 애플리케이션 및 방법

다른 사람들이 이 제품을 사용하는 방법

비교하기

TruSeq DNA Nano TruSeq DNA PCR-Free Illumina DNA Prep
Assay 시간 약 6시간의 총 분석 시간 총 분석 시간 5시간 약 3~4시간(DNA 추출부터 정규화된 라이브러리까지)
자동화 기능 Liquid handling robots Liquid handling robots Liquid handling robots
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
설명 높은 유전체 커버리지 품질과 편향 감소 효과를 제공하는 저사용량 연구 방법입니다. 유전체의 어려운 영역을 통과해 시퀀싱하는 기능을 갖춘 전장 유전체 시퀀싱 연구를 위한 단순한 전체 포함 PCR-free prep입니다. 다양한 샘플 유형과 DNA 투입량을 수용하여 인간에서 미생물 전장 유전체 염기서열 분석에 이르기까지 광범위한 응용 분야에 액세스할 수 있는 빠르고 유연한 라이브러리 준비 워크플로우. 
수작업 시간 ~4시간 4시간 1~1.5시간
사용량 genomic DNA 100 ng DNA 1 ug 작은 게놈(예: 미생물)의 경우 1~500 ng DNA, 또는 큰 게놈(예: 인간)의 경우 100~500 ng DNA. (혈액 및 타액의 경우 참조 가이드 확인).
Instruments MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
작용 기전 기계적 DNA 절편화 및 어댑터 라이게이션. 워크플로우는 편향 감소 PCR을 사용하고 겔이 없음. 기계적 DNA 절편화 및 어댑터 라이게이션. 워크플로우는 PCR을 사용하지 않고 겔이 없음. Bead-linked transposome
방법 Genotyping by sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing Genotyping by sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing Amplicon sequencing, De novo sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing
멀티플렉싱 싱글 최대 24개, 조합(CD) 듀얼 96개, 고유한 듀얼 24개 및 고유한 듀얼(UD) 조합 96개 싱글 최대 24개, 조합(CD) 듀얼 96개, 고유한 듀얼 24개 및 고유한 듀얼(UD) 조합 96개 최대 384개의 고유한 듀얼(UD) 조합 및 96개의 조합 듀얼(CD) 조합
Nucleic acid type DNA DNA DNA
특수 샘플의 종류 Not FFPE-compatible, Low-input samples Not FFPE-compatible Blood, Not FFPE-compatible, Saliva
Species category Other, Mammalian, Mouse, Human, Rat, Plant Other, Mammalian, Mouse, Human, Rat, Plant Drosophila, Any species, Mammalian, Mouse, Yeast, Zebrafish, Human, Rat, Plant, Virus, Nematode, Bacteria
종 세부 사항 대부분의 큰 DNA 유전체와 호환됨. 대부분의 큰 DNA 유전체와 호환됨. 모든 종과 호환됨
표적 단편 크기 350 bp 또는 550 bp 350 bp 또는 550 bp ~350 bp
Technology Sequencing Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

선택 도구:

라이브러리 프렙 (1)

TruSeq Nano DNA Low Throughput Library Prep Kit (24 samples)

20015964

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약 및 샘플 정제 비드가 포함되어 있습니다. 인덱스 어댑터를 별도로 구매하십시오.

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TruSeq Nano DNA High Throughput Library Prep Kit (96 samples)

20015965

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약 및 샘플 정제 비드가 포함되어 있습니다. 인덱스 어댑터를 별도로 구매하십시오.

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인덱스 어댑터 (1)

IDT for Illumina – TruSeq DNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040870

96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96개의 8 bp 인덱스를 포함하며 TruSeq Nano 및 TruSeq PCR-Free Library Prep Kit와 호환됩니다. 버전 2는 플레이트 20022370의 192개 인덱스 올리고(oligo) 중 8개에 대한 개선 사항을 포함하고 있으며, 나머지 184개에는 변경사항이 없습니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입하세요.

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Illumina Advantage 제품 (3)

TG TruSeq® Nano DNA LT Sample Prep Kit, Set A (24 Samples)

TG-202-1001

단일 판독, 페어드 엔드 및 멀티플렉스 시퀀싱을 위한 총 24개 샘플의 DNA 샘플 준비를 위한 키트 시약. 이 키트에는 12개의 고유한 단일 인덱스가 포함되어 있습니다.(지수 2,4,5,6,7,12,13,14,15,16,18,19)

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TG TruSeq® Nano DNA LT Sample Prep Kit, Set B (24 Samples)

TG-202-1002

단일 판독, 페어드 엔드 및 멀티플렉스 시퀀싱을 위한 총 24개 샘플의 DNA 샘플 준비를 위한 키트 시약. 이 키트에는 12개의 고유한 단일 인덱스가 포함되어 있습니다. (지수 1,3,8,9,10,11,20,21,22,23,25,27)

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TG Truseq® Nano DNA Accessory Kit

TG-280-1001

TruSeq Nano DNA LT 키트 A 및 B와 cfDNA 워크플로우와 함께 사용하기 위한 액세서리 키트. 하나의 부속품 키트는 cfDNA 워크플로우를 통해 4개의 추가 16개 검체 배치에 충분한 추가 EPM 시약을 제공합니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

Unit Price

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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