TruSight Oncology 500 ctDNA v2

주요 IO 유전자 시그니처(TMB, MSI)와 혈장 내 ctDNA의 모든 주요 변이체 계열을 검출할 수 있는 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

정제된 핵산에서 변이체 보고까지 <4일

Assay 시간

라이브러리 준비 및 증균의 경우 ~2.5시간

수작업 시간

세포유리 DNA 20 ng(혈장 4 ml)

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

이 제품은 일부 지역에서만 제공됩니다. 제공 여부를 확인하시려면 이 제품을 배송받기를 원하시는 지역을 선택해 주세요.

TruSight Oncology 500 ctDNA v2는 이제 더 낮은 cfDNA 입력, 더 빠른 처리 시간 및 더 간소화된 워크플로우를 사용하여 향상된 감도로 사용할 수 있습니다.

개요

TruSight Oncology 500 ctDNA v2는 연구를 위해 혈액 혈장 내 순환 종양 DNA(ctDNA)의 사내 종합 유전체 프로파일링(CGP)을 가능하게 하는 범암 NGS 분석입니다. 

  • 최소 침습적 혈액 검체를 조직 생검의 보체 또는 대안으로 활용

  • 주요 변이 계열(SNV, MNV, 인델, CNV, 유전자 재배열) 전반에서 DNA 변이를 평가하기 위한 표적 523개 유전자 + 주요 면역항암 유전자 시그니처(TMB, MSI)

  • 최소 cfDNA 입력에서 초고감도 감지 가능

  • 간소화된 워크플로우로 cfDNA로부터 <4일 이내에 최종 보고서 받기

Low-level 바이오마커 검출

UMI 기반 하이브리드 캡처 라이브러리 준비 및 심층 시퀀싱을 사용하여 낮은 입력(20ng)으로 민감하고 정확한 감지(SNV의 경우 0.2% VAF)를 달성합니다.

통합 바이오인포매틱스(bioinformatics)

DRAGEN 2차 분석은 Illumina Connected Analytics를 통해 온프레미스 또는 클라우드에서 신속한 변이 검출 알고리즘을 지원합니다. Illumina Connected Insights* 또는 Velsera와 통합된 보고를 사용하여 인사이트에 액세스합니다.

간소화된 워크플로우

고급 화학 및 광범위한 워크플로우 최적화를 통해 1일 라이브러리 준비와 강화를 통해 총 처리 시간이 <4일입니다. 자동화 친화적인 키트와 방법을 통해 효율성을 높일 수 있습니다.

*일부 국가에서는 제공되지 않습니다. Illumina Connected Insights는 제3자 지식 소스에 대한 API 호출을 통해 사용자 정의 3차 분석을 지원합니다.


포괄적인 포트폴리오로 CGP 지원

TruSight Oncology 500 제품군으로 실행 가능한 변경을 식별할 가능성을 극대화해 보세요.

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

TruSight Oncology 500과 유사한 DNA 패널 함량으로 혈장 내 순환 종양 DNA(ctDNA)를 분석합니다.

 

HRD는 TruSight Oncology 500 HRD 키트를 TruSight Oncology 500 키트에 추가한 경우에만 사용할 수 있습니다. 일본에서는 제공되지 않습니다.


사양


필수 제품

TruSight Oncology 500 ctDNA v2를 실행하려면 다음이 필요합니다.

DRAGEN 파이프라인으로 분석하려면 다음이 필요합니다.

최종 변형 보고서를 생성하려면 다음이 필요합니다.

* 일부 국가에서는 지원되지 않습니다. Illumina Connected Insights는 제3자 지식 소스에 대한 API 호출을 통해 사용자 정의 3차 분석을 지원합니다.

 벨세라는 이전에 Pierian으로 알려졌습니다. 기타 상업적 옵션을 이용할 수 있습니다.

/ 결과

애플리케이션

워크플로우 예시

*Novaseq X 및 NovaSeq 6000Dx(RUO 모드) 호환성은 2024년에 제공될 예정입니다.

일부 국가에서는 제공되지 않습니다. Illumina Connected Insights는 제3자 지식 소스에 대한 API 호출을 통해 사용자 정의 3차 분석을 지원합니다.


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NovaSeq 6000 System

24 samples per run (S4 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage

2 × 150 bp

NovaSeq 6000 System

8 samples per run (S2 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage

2 × 150 bp


관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료

비교하기

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 TruSight Oncology 500 TruSight Oncology 500 High-Throughput
분석 민감도 ≥ 95%(작은 변이, ≥ 0.5% VAF)
분석 특이도 ≥ 99.995%(작은 변이, ≥ 0.5% VAF)
Assay 시간 정제된 핵산에서 변이체 보고까지 <4일 검체에서 결과까지 4~5일 검체에서 결과까지 4~5일
Cancer type Pan-cancer, Solid tumor Pan-cancer, Solid tumor Pan-cancer, Solid tumor
콘텐츠 사양 총 1.94 Mb의 패널 크기에 대해 523개 유전자의 표적 선택(전체 코딩 시퀀스).
• 면역항암 생체표지자 범위: TMB 및 MSI
• 가이드라인 적용 범위: 다양한 고형암 유형에 대한 주요 가이드라인의 광범위한 커버리지
• 임상시험 보장 범위: 600건 이상의 임상시험(2023년 2월 기준 Pierian 임상 지식 기반)
총 1.94 Mb 패널 크기에 대해 523개 유전자의 DNA 및 55개 유전자의 RNA의 표적화된 시퀀싱. MSI 및 TMB 측정 포함.  선택적 TruSight Oncology 500 HRD 키트(일본에서는 이용 불가) 콘텐츠에는 Myriad Genetics가 제공하는 종합적인 유전체 불안정성 점수(LOH+TAI+LST)를 통해 상동성 재조합 결핍을 평가하기 위한 약 25K SNP의 적용범위가 포함된다.  총 1.94Mb 패널 크기로 523개의 관심 대상 유전자에서 얻은 DNA와 55개의 유전자에서 얻은 RNA의 표적 염기서열분석. MSI 및 TMB 측정 포함. 
설명 액체 생검 검체(혈장의 ctDNA)의 포괄적인 유전체 프로파일링을 통해 암 연구 응용 분야를 위한 고형암 프로파일링을 위한 비침습적 방법을 제공한다. 이 액체 생검 접근법은 조직 기반 CGP를 보완하기 위한 최소 침습적 검체 채취 접근법을 이용하여 종양 내 및 종양 간 이질성에 대한 통찰력을 제공한다. FFPE 조직에서 종합적인 유전체 프로파일링을 가능하게 하고 NextSeq 550 시스템 또는 NextSeq 550Dx 기기(연구 모드)에서 실행되며 한 번에 최대 8개의 검체를 배치화할 수 있는 분석. NovaSeq 6000 시스템 또는 NovaSeq 6000Dx 기기(연구 모드)를 사용하여 간소화된 워크플로우에서 가이드라인 및 > 1K 임상시험의 주요 생체표지자를 식별하기 위한 고처리량 종합 NGS 분석. 면역종양학 생체표지자 MSI 및 TMB의 범위를 포함한다.
유전자 수 DNA의 경우 유전자 523개
수작업 시간 라이브러리 준비 및 증균의 경우 ~2.5시간 자동화된 워크플로우의 경우 ~2.5시간.
수동 워크플로의 경우 ~10.5시간.
자동화된 워크플로우의 경우 ~2.5시간.
수동 워크플로의 경우 ~10.5시간.
사용량 세포유리 DNA 20 ng(혈장 4 ml) 40 ng DNA 및/또는 40 ng RNA 40 ng DNA 및/또는 40~80 ng RNA
Instruments NovaSeq 6000 System NextSeq 550 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500 System NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System
작용 기전 하이브리드 캡처 chemistry
방법 Targeted DNA sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment
멀티플렉싱 Xp-4 레인 워크플로우를 사용하여 S2에서 최대 8개, S4에서 24개, 최대 16개 인덱스 최대 8플렉스 최대 16-plex(SP 플로우 셀), 32-plex(S1 플로우 셀), 72-plex(S2 플로우 셀) 및 192-plex(S4 플로우 셀)
Nucleic acid type DNA DNA, RNA DNA, RNA
특수 샘플의 종류 Circulating tumor DNA, Blood FFPE tissue FFPE tissue
Species category Human Human Human
Technology Sequencing Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Novel transcripts, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants Gene fusions, Somatic variants, Novel transcripts, Structural variants, Transcript variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

* 2023년 2월 기준 Pierian 임상 지식 기반.

* RUO 모드의 NovaSeq 6000Dx 시스템은 2차 분석을 위해 별도의 독립형 DRAGEN 서버가 필요합니다.

* NovaSeq X 및 NovaSeq 6000 Dx 호환성은 2024년 출시 예정

그림 자료

낮은 VAF에서 작은 뉴클레오티드 변이체 검출

각각의 단일 뉴클레오티드 변이체에 대해 알려진 변이체 대립유전자 빈도(VAF)를 갖는 합성 대조군 샘플을 0.20% 내지 0.50% VAF 범위의 값으로 희석하고 TruSight Oncology 500 ctDNA v2에 의해 분석하였다.

 

낮은 VAF에서 인델 검출

각 삽입 또는 결실에 대해 알려진 VAF를 갖는 합성 대조 샘플을 0.20% 내지 0.50% VAF 범위의 값으로 희석하고 TruSight Oncology 500 ctDNA v2에 의해 분석하였다.

 

종양-정상 호출에 비해 높은 TMB 상관관계

생식세포 및 CH 변이체 필터링에 대한 고급 생물정보학을 활용하는 TSO 500 ctDNA v2의 종양 단독 워크플로우는 종양-정상 워크플로우에 비해 매우 일치하는 bTMB를 생성한다.

 

면역종양학 연구를 위한 민감한 MSI 검출

현미부수체 불안정성(MSI)은 MSI-높음 상태가 알려진 3개 세포주(검체 1~3)에서 평가되었으며 최대 약 2300개의 단일중합체 부위를 평가하는 0.3% 종양 분획까지 검출되었다.

 

CNV에 대한 분석 성능, 증폭에 대한 LOD ≥1.3배 및 결실에 대한 ≤0.6

시작 복사본 수가 적어서 검출 한계로 인한 상대적 MYC 검출이 더 낮게 다가갔습니다.  Illumina 데이터 기록, 2023.

 

LOD에서의 검출을 이용한 유전자 재배열에 대한 분석 성능(0.5%)

VAF는 총 보조 판독 수를 중단점의 두 면의 더 높은 깊이로 나누어 계산합니다. Illumina 파일 데이터, 2023.

 

리소스

축소판

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

Illumina는 TruSight Oncology ctDNA 500 v2로 순환 종양 분석을 개선했습니다. 동영상에서 새로운 기능과 이점에 대해 알아보십시오.

 

TruSight Oncology 500 포트폴리오 브로셔

TruSight Oncology 500 제품 포트폴리오에 대해 자세히 알고 싶으십니까?

수동 프렙 키트 (12)

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24 samples)

20105899

TSO 500 ctDNA v2 수동 키트

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (24 samples)

20105901

혼합 워크플로 TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC 수동 키트

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)

20105902

혼합 워크플로 TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC 수동 키트

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24 samples) plus Velsera Interpretation Report

20105905

TSO 500 ctDNA v2 수동 키트 + Velsera 해석 보고서

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (24 samples)

20105907

혼합 워크플로 TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC 수동 키트 + Velsera 해석 보고서

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)

20105908

혼합 워크플로 TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC 수동 키트 + Velsera 해석 보고서

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit (48 samples)

20039252

TruSight Oncology 500 ctDNA 키트(DNA 라이브러리 및 증균 시약 포함), NovaSeq 코어 시약은 포함되지 않음.

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit plus Velsera Interpretation Report (16 indexes, 48 Samples) 

20043410

라이브러리 준비 및 강화 시약과 데이터 해석 보고서(Velsera Clinical Genomics Workspace 소프트웨어를 통해)가 포함됩니다. NovaSeq 시스템 핵심 시약은 포함되지 않습니다.

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit, for use with NovaSeq 6000 S2 (48 samples)

20101995

TSO500 ctDNA 및 NovaSeq 6000 S2 코어 소모품용 조합 SKU

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit, for use with NovaSeq 6000 S4 (48 samples)

20101998

TSO500 ctDNA 및 NovaSeq 6000 S4 코어 소모품용 조합 SKU

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit for use with NovaSeq 6000 S2 plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 samples)

20102000

TSO500 ctDNA 및 NovaSeq 6000 S2 코어 소모품의 조합 SKU + Velsera 보고서

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit for use with NovaSeq 6000 S4 plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 samples)

20102001

TSO500 ctDNA 및 NovaSeq 6000 S4 코어 소모품 + Velsera 보고서용 조합 SKU

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인덱스 어댑터 (4)

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034701

UMI DNA 인덱스 앵커(플레이트 = 20031416, 박스 = 20032620) + Nextera 호환 고유 이중 인덱스 A(판매 키트 = 20027213, 플레이트 = 20025019, 박스 = 20026121)

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IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034702

Illumina UMI DNA 인덱스 앵커 세트 B용 IDT

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IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation

20066404

Illumina - UMI DNA/RNA UD 인덱스용 96 IDT 상자 1개 96개 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 자동화용 세트 A 및 Illumina - UMI DNA 인덱스 앵커용 96 IDT 상자 1개가 포함됩니다.

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IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation

20063213

Illumina - UMI DNA/RNA UD 인덱스용 96 IDT 1박스 자동화용 세트 B는 96개 샘플에 라벨을 부착하기에 충분하며 Illumina - UMI DNA 인덱스 앵커용 96 IDT 1박스가 포함되어 있습니다.

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시약 (2)

NovaSeq 6000 S2 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)

20028314

NovaSeq 6000 시스템에서 300주기 실행을 지원하는 S2 플로우 셀 1개, 버퍼 카트리지 1개, 클러스터 카트리지 1개 및 시퀀싱 카트리지 1개가 포함됩니다.

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NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)

20028312

NovaSeq 6000 시스템에서 300주기 실행을 지원하는 S4 플로우 셀 1개, 버퍼 카트리지 1개, 클러스터 카트리지 1개 및 시퀀싱 카트리지 1개가 포함됩니다.

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소프트웨어 & 인포매틱스 옵션 (14)

Illumina DRAGEN Server v4

20051343

첫 해에 대한 Avance Exchange 지원이 포함됩니다. 연간 DRAGEN 라이센스를 구매해야 합니다.

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ICA Basic Annual Subscription

20044874

Illumina Connected Analytics(ICA) 기본 연간 구독. 이 제품에는 시퀀싱 장비 연결, 데이터 관리 기능, 사전 패키지 도구에 대한 액세스 등 TSO500 고객을 위한 ICA 무료 액세스 1년이 포함됩니다.

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ICA Professional Annual Subscription

20044876

Illumina Connected Analytics(ICA) Professional Annual Subscription. 이 제품에는 시퀀싱 기기 연결, 데이터 관리 기능, 사전 패키지된 도구에 대한 액세스, 도구, 파이프라인, 데이터 웨어하우스 및 노트북으로 구성된 맞춤형 워크플로우를 생성하는 기능 등 1년 동안 ICA에 대한 액세스가 포함됩니다.

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ICA Enterprise Annual Subscription

20038994

Illumina Connected Analytics(ICA) Enterprise Annual Subscription. 이 제품에는 시퀀싱 기기 연결, 데이터 관리 기능, 맞춤형 및 사전 패키지 분석 도구, 데이터 웨어하우징 및 마이닝을 위한 기본 모듈을 포함한 ICA Enterprise에 대한 1년 액세스가 포함됩니다. ICA Enterprise에는 옵션인 HIPPAA BAA(미국만 해당), 싱글 사인온(SSO) 및 서비스 수준 계약(SLA)도 포함됩니다.

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ICA Enterprise Service and Compliance Add-on (applies to Basic only)

20066830

Illumina Connected Analytics(ICA) 엔터프라이즈 서비스 및 규정 준수 추가 기능. 이 제품은 1년간 ICA 기본 연간 구독에 적용되며 HIPPAA BAA(미국만 해당), 싱글 사인온(SSO) 및 서비스 수준 계약(SLA)이 포함됩니다.

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Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

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Illumina Analytics  Starter Pack - 1,000 iCredits

20042039

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

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Illumina Analytics  - 5,000 iCredits

20042040

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

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Illumina Analytics  - 50,000 iCredits

20042041

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

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Illumina Analytics - 100,000 iCredits

20042042

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

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Illumina Connected Insights-Annual Subscription

20090137

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Illumina Connected Insights‒Oncology Genome Equivalent Sample-VCF

20090138

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Illumina Connected Insights‒Training and Onboarding

20092376

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Informatics Professional Services

20071787

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서비스 (2)

Informatics Professional Services

20071787

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Illumina Connected Insights‒Training and Onboarding

20092376

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선택 품목 요약

제품

수량

Unit Price

FAQ

TruSight Oncology 500 ctDNA v2는 <4일 내에 혈장 검체로부터 CGP를 가능하게 하는 고형암에 대한 초민감성의 간결한 액체 생검 분석이다. TruSight Oncology 500 ctDNA v2는 원래의 TruSight Oncology 500 ctDNA 분석법에 비해 낮은 cfDNA 입력, 빠른 처리 시간 및 보다 간소화된 워크플로우를 사용하여 향상된 감도를 제공합니다. TruSight Oncology 500TruSight Oncology 500 High-Throughput은 조직 샘플에서 CGP를 활성화합니다. TruSight Oncology 분석 비교표의 다른 차이점을 참조하십시오.

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 분석 워크플로우는 DRAGEN v4 또는 v3 서버 또는 Illumina Connected Analytics 플랫폼에서 실행되는 기기 외 소프트웨어를 사용하여 높은 수준의 샘플 메트릭, 검출된 변이체, TMB 및 MSI 점수를 포함한 샘플 출력을 생성합니다. 3차 분석은 Illumina Connected Insights 또는 Velsera CGW로 활성화됩니다.

 BaseSpace Sequence Hub 평가 앱은 평가용으로만 사용할 수 있습니다. Illumina는 이 앱에 대한 기술 지원을 제공할 의무가 없습니다. 이용 기간은 30일로 제한됩니다.

 호환되는 분석 소프트웨어 제품에 대해 자세히 알아보십시오.

DRAGEN 서버에 대한 분석은 24개의 라이브러리가 있는 S4 실행의 경우 약 20~24시간, 8개의 라이브러리가 있는 S2 실행의 경우 약 9~12시간이 소요됩니다.

예, 자체 소프트웨어로 분석을 수행할 수 있습니다. 그러나 Illumina는 이 경우 직접 기술 지원을 제공할 수 없습니다.

>90% 민감도 및 >95% 특이성에서 SNV에 대한 약 0.2% VAF 검출을 달성하기 위해 약 20 ng 입력 cfDNA가 권장되나, 이 분석법은 10~30 ng cfDNA의 다양한 입력을 수용할 수 있다.

/ 결과

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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