Illumina Complete Long Reads with Enrichment, Human

인간 유전체의 매핑하기 까다로운 영역을 처리하기 위한 비용 효율적이며 유연한 표적 롱 리드 솔루션입니다.

약 2일

Assay 시간

~6시간

수작업 시간

50 ng DNA 권장; 최저 10 ng DNA

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina Complete Long Reads with Enrichment, Human은 낮은 입력 DNA에서 매우 정확하고 비용 효율적이며 표적화된 긴 판독을 가능하게 합니다. 이 Library Prep Kit는 표준 쇼트 리드 전장 유전체를 가장 선호되는 표적 롱 리드 패널로 보완함으로써 최대한의 가치를 제공하는 곳에 롱 리드를 활용하여 비용 효율적인 통찰력을 추가합니다. 참고: 분석에는 표적 롱 리드를 보완하기 위해 동일한 샘플의 표준 ≥ 30× 쇼트 리드 WGS 데이터가 필요합니다.

주요 기능

  • 사전 제조, 사전 설계 또는 맞춤형 패널과 호환되는 매우 유연한 표적 롱 리드

  • N50 5~7 kb의 표적 롱 리드는 인간 유전체의 매핑하기 까다로운 영역에 대해 향상된 커버리지 제공

  • 가장 큰 가치를 제공하는 곳에 표적 롱 리드를 제공함으로써 비용 효율적인 통찰력 제공

  • 표준 NGS 라이브러리 준비 워크플로우 및 Illumina NovaSeq X, NovaSeq 6000, NovaSeq 6000Dx(RUO 모드) 시스템으로 액세스 가능

  • 간소화되고 종합적인 DRAGEN 앱을 사용해 ≥ 30× 표준 쇼트 리드 인간 전장 유전체와 결합하여 분석


사양


필수 제품

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human에는 표적 롱 리드 라이브러리를 생성하기 위한 핵심 시약이 포함됩니다. 사전 제조된 인간 종합 패널(별도로 또는 키트의 일부로 주문 가능) 또는 DesignStudio 맞춤형 분석 설계 도구에서 사전 설계 또는 맞춤형 패널 중 하나와 같은 강화용 프로브 패널을 구입합니다. 

어떤 액세서리가 필요한가요?

Illumina의 고유한 이중 인덱스가 필요하며 처리량에 따른 데이터 저장 및 분석 요구를 충족하기에 충분한 iCredit이 필요합니다.

Illumina 강화 포함 완전 긴 판독 분석을 위해서는 동일한 검체에서 얻은 표준 짧은 판독 ≥ 30 x 전장 유전체 라이브러리가 필요합니다. 표준 쇼트 리드 전장 유전체의 라이브러리 준비에는 Illumina DNA PCR-Free Prep을 권장합니다. 제3자 WGS 키트도 호환됩니다. 비표시 라이브러리는 동시에 준비 또는 시퀀싱할 필요가 없습니다. 이전에 분석한 샘플의 FASTQ 파일을 사용할 수 있습니다.

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우

1
라이브러리 준비

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human

맞춤형 패널

3
데이터 분석

DRAGEN ICLR (Illumina Complete Long Read) with Enrichment 앱


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NovaSeq 6000 System

Human Comprehensive Panel: 24 samples per S4 flow cell Large panels (15–25 Mb): ~75 samples per S4 flow cell Medium panels (5–15 Mb): ~187 samples per S4 flow cell Small panels (> 5 Mb): ~375 samples per S4 flow cell

2 × 150

NovaSeq X System

Human Comprehensive Panel: 24 samples per 10B flow cell, 64 samples per 25B flow cell Large panels (15–25 Mb): ~75 samples per 10B flow cell, ~200 samples per 25B flow cell Medium panels (5–15 Mb): ~187 samples per 10B flow cell, ~500 samples per 25B flow cell Small panels (> 5 Mb): ~375 samples per 10B flow cell, ~1000 samples per 25B flow cell

2 × 150

NextSeq 2000 System

Human Comprehensive Panel: 3 samples per P3 flow cell Large panels (15–25 Mb): ~9 samples per P3 flow cell Medium panels (5–15 Mb): ~22 samples per P3 flow cell Small panels (> 5 Mb): ~45 samples per P3 flow cell

2 × 150

관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료

비교하기

Illumina Complete Long Reads with Enrichment, Human Illumina Complete Long Read Prep, Human Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
Assay 시간 약 2일 약 7.5~8.5시간 6.5시간
설명 매우 정확한 WGS를 위한 쇼트 리드 데이터와 결합된 유연하고 비용 효율적인 표적 롱 리드. 사전 설계된 패널 또는 맞춤형 패널과 페어링하여 유전체의 매핑하기 어려운 영역을 해결하거나 관심 영역에 단계별 시퀀싱을 추가합니다. Illumina Complete Long Read Prep, Human은 기존 Illumina NovaSeq 플랫폼을 사용하여 롱 리드 인간 생식세포(germline) 전장 유전체 시퀀싱을 수행합니다. 비용 효율적이고 안정적인 인간 전장 엑솜 시퀀싱을 위한 최신 엑솜 콘텐츠의 집중 인리치먼트 프로브 패널을 사용하는 인리치먼트 워크플로우가 포함된 빠르고 사용하기 쉬운 라이브러리 준비입니다.
수작업 시간 ~6시간 (PCR 및 QC) 포함 5~6시간 ~2시간
사용량 50 ng DNA 권장; 최저 10 ng DNA 50 ng DNA 권장 고품질 genomic DNA 50~1,000 ng(직접 혈액 및 타액의 경우, 참조 가이드 확인)
Instruments NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System NovaSeq 6000Dx Instrument, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
방법 Custom sequencing, Targeted DNA sequencing, Long-read sequencing, Phased sequencing, Whole-genome sequencing, Target enrichment Long-read sequencing, Whole-genome sequencing Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment
멀티플렉싱 레인당 최대 384개의 샘플(패널 타겟 크기 및 시퀀싱 출력에 따라 다름) 최대 48개 최대 12플렉스의 사전 인리치먼트 풀링이 테스트됩니다. 키트 구성은 최대 192개 샘플의 멀티플렉싱을 지원합니다. 최대 384개가 가능합니다.
Nucleic acid type DNA DNA DNA
반응 수 반응 24 또는 96개 8 또는 24개
특수 샘플의 종류 Blood, Not FFPE-compatible, Saliva Blood, Not FFPE-compatible, Low-input samples, Saliva Blood, Saliva
Species category Human Human Human
표적 단편 크기 단편 크기: 500~700 bp, 리드 길이 N50 5~7 kb 500~700 bp
Technology Sequencing Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Germline variants, Structural variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Short tandem repeats (STRs), Germline variants, Structural variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

그림 자료

표적 롱 리드를 통한 까다로운 영역의 정확성 향상

표준 쇼트 리드 WGS(파란색)와 비교 시 Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment(주황색)를 사용하여 (A) Human Comprehensive Panel 또는 (B) CMRG 패널에 의해 표적화된 HG002 유전자 영역의 SNP 및 삽입/결실에 대한 위음성(FN) 및 위양성(FP) 변이 검출.

whole-genome coverage

까다로운 영역의 비용 효율적인 인간 전장 유전체 커버리지

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human은 표준 쇼트 리드 인간 WGS를 보완하기 위해 까다로운 유전자 영역의 커버리지를 향상시키는 데 도움이 됩니다. 표준 쇼트 리드 WGS 및 Illumina Complete Long Reads with Enrichment를 사용하여 시퀀싱된 RHCE의 IGV 도표입니다. 표적 영역은 빨간색으로 표시됩니다.

 

haplotypes in polymorphic genes

표적 롱 리드는 다형성이 높은 유전자에서 일배체형 해결 지원

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human을 사용한 롱 리드 시퀀싱의 IGV 도표입니다. MHC 유전자좌의 722 kb 영역에 대한 페이징입니다. 580 kb 영역(분홍색)은 1개의 위상 블록에서 캡슐화되어 있습니다.

 

haplotypes in polymorphic genes

표적 롱 리드는 다형성이 높은 유전자에서 일배체형 해결 지원

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human을 사용한 롱 리드 시퀀싱의 IGV 도표입니다. HLA-C 유전자는 완전히 페이징되었습니다. 리드는 일배체형으로 분리됩니다.

 

리소스

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (24 samples)

20113834

롱 리드 인간 전장 유전체 시퀀싱(WGS) 애플리케이션에 이점을 제공할 영역을 처리하기 위해 설계된 프로브 패널이 포함된 라이브러리 준비 및 인리치먼트 솔루션입니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

가격 요청하기

List Price:

Discounts:

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (96 samples)

20113835

롱 리드 인간 전장 유전체 시퀀싱(WGS) 애플리케이션에 이점을 제공할 영역을 처리하기 위해 설계된 프로브 패널이 포함된 라이브러리 준비 및 인리치먼트 솔루션입니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

가격 요청하기

List Price:

Discounts:

Illumina Human Comprehensive Panel (24 samples)

20113836

롱 리드 전장 유전체 시퀀싱(WGS) 애플리케이션에 이점을 제공할 인간 유전체의 영역을 표적화하도록 설계된 하이브리드화 캡처 프로브 패널입니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

가격 요청하기

List Price:

Discounts:

Illumina Human Comprehensive Panel (96 samples)

20113837

롱 리드 전장 유전체 시퀀싱(WGS) 애플리케이션에 이점을 제공할 인간 유전체의 영역을 표적화하도록 설계된 하이브리드화 캡처 프로브 패널입니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

가격 요청하기

List Price:

Discounts:

인덱스 어댑터 (4)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

데이터 분석 & 스토리지 (3)

Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina Analytics  Starter Pack - 1,000 iCredits

20042039

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina Analytics  - 5,000 iCredits

20042040

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

액세서리 제품 (2)

Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (24 Samples)

20041794

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약 및 Illumina 정제 비드가 포함되어 있습니다. 인덱스 어댑터를 별도로 구매하십시오.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (96 Samples)

20041795

96개 라이브러리를 준비하기 위한 시약 및 Illumina 정제 비드가 포함되어 있습니다. 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

표시 /

선택 품목 요약

제품

수량

Unit Price

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

전문가와 상담하기

Illumina의 제품 및 서비스에 대한 정보 또는 Illumina의 기술 관련 질문에 대한 답변을 원하신다면 연락해 보세요.