Illumina Human Comprehensive Panel

Illumina Complete Long Read with Enrichment Library Prep Kit를 사용하여 단백질 코딩 유전자 내에 있는 매핑하기 까다로운 영역에 대해 향상된 커버리지를 제공하기 위해 사전 설계 및 최적화된 패널입니다. 필요한 ≥ 30× 표준 쇼트 리드 전장 유전체와 결합하여 분석됩니다.

약 2일

Assay 시간

~6시간

수작업 시간

50 ng DNA 권장; 최저 10 ng DNA

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina Human Comprehensive Panel은 유전체에 가장 큰 가치를 제공하는 부분에 롱 리드의 초점을 둡니다.표적 롱 리드는 매우 정확한 쇼트 리드 WGS를 보완하여, PrecisionFDA Truth Challenge v2 벤치마크로 측정 시 99.87%의 F1 점수(SNV +삽입/결실)로 뛰어난 작은 변이 정확성을 제공하는 포괄적인 인간 전장 유전체 솔루션이 됩니다.

비용 효율적이고 집중된 롱 리드

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment와 Human Comprehensive Panel은 Illumina 플랫폼과 페어링 시 다른 롱 리드 시퀀싱 솔루션에 비해 더 많은 샘플 처리량을 달성하는 데 도움이 될 수 있습니다. 더 큰 변이 발견을 촉진하는 도구로 기존 WGS 데이터 세트를 강화하는 데 사용합니다.

포괄적이고 최적화된 프로브 패널

Illumina Human Comprehensive Panel은 >6,500개의 단백질 코딩 유전자 내에서 표적 롱 리드로부터 이점을 얻을 수 있는 유전자 영역의 넓은 집합에서 커버리지를 향상시킵니다.2  이 패널을 개발할 때, 20,000개가 넘는 단백질 코딩 유전자로 구성된 전체 집합이 고려되었습니다. 쇼트 리드만으로도 포괄적으로 다루어지는 유전자는 제외되었습니다. 이 패널은 출시 준비가 되어 있으며 Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human과 사용하도록 최적화되어 있습니다.

  • 유전체의 단백질 코딩 영역 내에서 매핑하기 까다로운 부분의 커버리지를 향상시키도록 설계된 매우 최적화된 패널
  • > 6,500개의 유전자를 처리하는 넓은 패널로서 Illumina Complete Long Read를 사용하여 총 > 90 Mb를 표적화함으로써 낮은 커버리지 영역을 처리하는 패널

참고 문헌

  1. PrecisionFDA. Truth Challenge V2: Calling Variants from Short and Long Reads in Difficult-to-Map Regions.  https://precision.fda.gov/challenges/10
  2. Bekritsky MA, Colombo C, Eberle MA. Identifying Genomic Regions with High Quality Single Nucleotide Variant Calling.  illumina.com/science/genomics-research/articles/identifying-genomic-regions-with-high-quality-single-nucleotide-.html

사양


필수 제품

패널을 단독으로 또는 키트의 일부로 주문할 수 있습니다. Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human (24 or 96 samples) 및 Illumina의 고유한 듀얼 인덱스가 필요합니다. 충분한 iCredit을 구매하여 처리량에 따라 데이터 보관 및 분석 요구 사항을 충족할 수 있습니다.

Illumina Complete Long Read with Enrichment 데이터 분석에는 동일한 샘플로부터의 표준 쇼트 리드 ≥ 30 × 전장 유전체 라이브러리가 필요합니다. 표준 쇼트 리드 전장 유전체의 라이브러리 준비에는 Illumina DNA PCR-Free Prep을 권장합니다. 이전에 실행된 샘플에서 얻은 FASTQ 파일을 사용할 수 있습니다.

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우

3
앤레이즈

DRAGEN ICLR (Illumina Complete Long Read with Enrichment)


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NovaSeq 6000 System

24 samples per S4 flow cell, 10 samples per S2 flow cell, 4 samples per S1 flow cell, 2 samples per SP flow cell
A paired PCR-free WGS library is required for analysis (Illumina DNA PCR-Free Prep recommended)

2 × 150

NovaSeq X System

64 samples per 25B flow cell, 24 samples per 10B flow cell, 4 samples per 1.5B flow cell
A paired PCR-free WGS library is required for analysis (Illumina DNA PCR-Free Prep recommended)

2 × 150


관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료
지원 문서

해당 제품 전용 지원 섹션은 현재 제공되지 않습니다

그림 자료

표적 롱 리드를 사용하여 까다로운 단백질 코딩 영역 해결

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment와 Human Comprehensive Panel은 표준 쇼트 리드 인간 WGS를 보완하기 위해 까다로운 유전자 영역의 커버리지를 향상시키는 데 도움이 됩니다. 표준 쇼트 리드 WGS 및 Illumina Complete Long Reads with Enrichment를 사용하여 시퀀싱된  STRC 의 IGV 도표입니다.

표적 롱 리드를 사용하여 까다로운 단백질 코딩 영역 해결

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment와 Human Comprehensive Panel은 표준 쇼트 리드 인간 WGS를 보완하기 위해 까다로운 유전자 영역의 커버리지를 향상시키는 데 도움이 됩니다. 표준 쇼트 리드 WGS 및 Illumina Complete Long Reads with Enrichment를 사용하여 시퀀싱된 NEB의 IGV 도표입니다.

표적 롱 리드를 통한 까다로운 영역의 정확성 향상

표준 쇼트 리드 WGS(파란색)와 비교 시 Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment(주황색)를 사용하여 Human Comprehensive Panel에 의해 표적화된 유전자 영역의 SNP 및 삽입/결실에 대한 위음성(FN) 및 위양성(FP) 변이 검출.

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (24 samples)

20113834

롱 리드 인간 전장 유전체 시퀀싱(WGS) 애플리케이션에 이점을 제공할 영역을 처리하기 위해 설계된 프로브 패널이 포함된 라이브러리 준비 및 인리치먼트 솔루션입니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

가격 요청하기

List Price:

Discounts:

Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (96 samples)

20113835

롱 리드 인간 전장 유전체 시퀀싱(WGS) 애플리케이션에 이점을 제공할 영역을 처리하기 위해 설계된 프로브 패널이 포함된 라이브러리 준비 및 인리치먼트 솔루션입니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

가격 요청하기

List Price:

Discounts:

인덱스 어댑터 (4)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

데이터 분석 & 스토리지 (3)

Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina Analytics  Starter Pack - 1,000 iCredits

20042039

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina Analytics  - 5,000 iCredits

20042040

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

No Products!

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

표시 /

선택 품목 요약

제품

수량

Unit Price

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

전문가와 상담하기

Illumina의 제품 및 서비스에 대한 정보 또는 Illumina의 기술 관련 질문에 대한 답변을 원하신다면 연락을 주시기 바랍니다.