Illumina Complete Long Read Prep, Human

NovaSeq 플랫폼으로부터 받은 롱 리드 데이터를 이용한 포괄적인 인간 WGS에 적합하며 매우 정확한 고성능의 종합 워크플로우 솔루션입니다.

약 7.5~8.5시간

Assay 시간

(PCR 및 QC) 포함 5~6시간

수작업 시간

50 ng DNA 권장

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

 Illumina Complete Long Read 기술을 통해, 이제 유전체 실험실을 위한 긴 판독 시퀀싱에 액세스하고 간소화할 수 있습니다. Illumina Complete Long Read Prep, Human은 이 기술을 활용하여 유전체에 대해 가장 종합적인 관점을 제공하는 최초의 제품입니다. 고성능 전장 유전체 시퀀싱 assay는 표준 NGS 워크플로우를 사용하여 NovaSeq™ 6000 시스템 및 NovaSeq X 시리즈에서 연속 롱 리드 시퀀스를 생성합니다.

  • 단일 플랫폼에서 롱 리드와 쇼트 리드를 사용하고 NovaSeq X 시리즈 및 NovaSeq™ 6000 시스템과 호환되는, 간소화되고 액세스 가능한 assay

  • 매우 정확하고 신뢰할 수 있는 결과를 위한 최적화된 표준 NGS 라이브러리 준비 및 DRAGEN 2차 분석

  • 사용량 요구 사항을 낮추었으며, 특수 추출, 절단 또는 크기 선택이 필요하지 않은 견고하고 유연한 성능

  • 시판 중인 롱 리드 솔루션에 비해 확장성이 우수하며, 효율적이고 하루만에 완료되는 자동화를 지원하는 워크플로우

  • 참고: 분석에는 동일한 샘플의 표준 ≥ 30× 쇼트 리드 WGS 데이터가 필요합니다.

매우 정확하고 확장 가능한 assay

Illumina Complete Long Read 데이터는 다음을 통해 표준 쇼트 리드 WGS 데이터를 보완하고 더 포괄적인 전장 유전체를 제공합니다.

  • 까다롭고 상동성이 높아 매핑하기 까다로운 영역 또는 반복되는 영역의 변이 검출
  • 복잡한 구조적 변이, 위유전자 및 대형 삽입-결실(indel) 해결
  • 변이 페이징 및 일배체형 콜

 Illumina Complete Long Read 기술에 대해 자세히 알아보기


사양


필수 제품

Illumina Complete Long Read Prep, Human에는 필요한 분석 패키지가 포함되어 있습니다.
기기에 적합한 시퀀싱 시약을 선택합니다. 
인덱스 어댑터는 선택 사항이며 별매입니다.
Illumina Complete Long Read DRAGEN Cloud Analysis.
BaseSpace Sequence Hub Professional 또는 Enterprise 구독이 필요합니다.
보관용 iCredit(선택 사항).

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우

* NovaSeq 플랫폼에서 Illumina Complete Long Read 라이브러리를 시퀀싱하면 런의 보고된 Q30 점수가 NovaSeq 사양 미만으로 떨어지게 될 수 있습니다. 이것은 시퀀싱 런과 라이브러리에 성능 문제가 있다는 의미가 아닙니다.


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NovaSeq 6000 System

4 samples (1 sample per lane of an S4 flow cell).
8 samples (1 sample per lane of an S4 flow cell, dual flow cell run optional).
A paired PCR-free WGS library is required for analysis (Illumina DNA PCR-Free Prep recommended).
NovaSeq 6000 Xp Workflow kit.

2 × 150 bp

NovaSeq X System

4 samples (1 sample per 2 lanes of a 10B flow cell).
A paired PCR-free WGS library is required for analysis (Illumina DNA PCR-Free Prep recommended).
11 samples (25B flow cell).

2 × 150 bp

NovaSeq X Plus System

8 samples (1 sample per 2 lanes of a 10B flow cell, dual flow cell run).
A paired PCR-free WGS library is required for analysis (Illumina DNA PCR-Free Prep recommended).
22 samples (25B flow cell, dual flow cell run).

2 × 150 bp

NovaSeq 6000Dx Instrument

4 samples (1 sample per lane of an S4 flow cell).
8 samples (1 sample per lane of an S4 flow cell, dual flow cell run optional).
A paired PCR-free WGS library is required for analysis (Illumina DNA PCR-Free Prep recommended).
NovaSeq 6000 Xp Workflow kit.

2 × 150 bp


관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료

그림 자료

Illumina Complete Long Read 기술의 원리

태그멘테이션은 긴 절편 크기를 표준화하는 데 사용됩니다. 긴 절편은 단일 분자의 롱 리드 정보를 포착하기 위해 ‘land-marked’ 패턴으로 표시되고 증폭됩니다. 표시된 절편은 시퀀싱을 위해 표준 라이브러리에 태그됩니다. 표시 및 비표시 데이터가 결합되어 매우 정확성이 높은 완벽한 롱 리드를 생성합니다.  Illumina Complete Long Read 기술에 대해 자세히 알아보십시오.

롱 리드의 페이징된 시퀀싱으로 명확한 일배체형 할당 지원

Illumina Complete Long Reads는 HLA-A 유전자와 같은 고도의 다형성 영역을 해결할 수 있습니다.  HLA 지역에서의 균일한 적용범위는 HLA 대립유전자의 정확한 위상을 가능하게 한다.

롱 리드 시퀀싱을 통해 크기가 큰 결실 검출 가능

 SEMG1 유전자의 이형접합 180 bp 결실은 Illumina Complete Long Reads 및 시판 중인 Long Reads 모두에 의해 명확하게 검출된다.

롱 리드 시퀀싱으로 위유전자 해결 가능

Illumina Complete Long Reads와 시판 중인 Long Reads는 모두 가성유전자인 p STRC 로부터 23 kb STRC 유전자를 명확하게 분해합니다. 

롱 리드 시퀀싱으로 STR 삽입 식별 가능

단연쇄 반복(STR) 영역의 삽입은 Illumina Complete Long Read 및 시판 중인 롱 리드 두 가지 모두를 통해 명확하게 검출할 수 있습니다.

롱 리드 시퀀싱으로 위유전자 해결 가능

Illumina Complete Long Reads와 시판 중인 Long Reads는 모두 SULT1A1 유전자(약물유전체학 표지자)를 의사유전자인  SULT1A2에서 명확하게 분리합니다.

매우 다양한 DNA 사용량에 걸친 고품질 성능

DNA 사용량이 5 ng에서 1,200 ng까지인 Illumina Complete Long Read Prep, Human은(3회 반복 실험 시) N50 및 위상 블록 N50에 대해 비슷한 데이터 품질 지표를 생성합니다. N50은 총 어셈블리 길이의 50%에서 가장 짧은 콘티그(또는 위상 블록)의 시퀀스 길이로 정의됩니다.

리소스

축소판

Illumina Complete Long Read 시퀀싱 기술 소개

이 신기술은 유전체의 가장 어두운 구석까지 더 밝게 비춰 줄 것입니다. Illumina Complete Long Read는 유전체의 가장 까다로운 영역을 해결하는 데 도움이 되며 단일 플랫폼에서 쇼트 리드(short read)와 롱 리드(long read)를 가능하게 하여 롱 리드 시퀀싱에 접근하고 이를 간소화합니다.

이 프레젠테이션에서는 Complete Long Read의 사용 사례를 공유하고 전 세계의 협업자들이 진행하고 있는 연구를 소개합니다.

Illumina Complete Long Read 기술은 유전자 영역 중 남은 ~5%에 대한 액세스를 가속화할 것입니다. 제품 관리자인 Andrew Shaver가 정확성, 확장성 및 워크플로우 이점을 포함해 Illumina의 새로운 롱 리드 기술의 이점을 설명하는 내용을 들어 보세요. Illumina Complete Long Read 기술이 Illumina 제품 포트폴리오의 기술적인 혁신을 어떻게 보완해 주는지 알아보세요.

Illumina Complete Long Read Prep, Human (24 samples)

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인간 전장 유전체 시퀀싱용으로 24개의 Illumina Complete Long Read 라이브러리를 준비하기 위한 시약입니다.

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Illumina Complete Long Read Prep, Human (8 samples)

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인간 전장 유전체 시퀀싱용으로 8개의 Illumina Complete Long Read 라이브러리를 준비하기 위한 시약입니다.

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Illumina Unique Dual Indexes, LT (48 indexes, 48 samples)

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Illumina Complete Long Read DRAGEN Cloud Analysis

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Illumina Complete Long Read Prep, Human - 24, S4 starter pack

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선택 품목 요약

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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