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TruSeq DNA PCR-Free

복잡한 유전체에 대한 정확하고 포괄적인 커버리지를 제공하는 간단하고 모든 것을 포함하는 전장 유전체 시퀀싱 (WGS) 라이브러리 프렙입니다.

총 분석 시간 5시간

Assay 시간

4시간

수작업 시간

DNA 1 ug

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

이제 Illumina DNA PCR-Free Prep 을 사용할 수 있습니다. 이 라이브러리 프렙 키트는 TruSeq DNA PCR-Free를 통해 그에 상응하는 성능을 달성하면서 처리 시간과 실습 시간을 줄여줍니다.

개요

TruSeq DNA PCR-Free는 전장 유전체 염기서열 분석 애플리케이션을 위한 간단하고 포괄적인 라이브러리 준비를 제공합니다. 연구자들은 박테리아와 같은 작은 유전체에서 인간 전체 유전체에 이르기까지 다양한 유기체의 염기서열을 분석할 수 있습니다. 워크플로는 다음을 제공합니다.

  • PCR이 필요 없는 단축된 젤 프리 워크플로우

  • 까다로운 영역에 대한 시퀀싱 기능

  • 유전체에 대한 심층적인 통찰력을 위한 탁월한 커버리지 품질

까다로운 영역 시퀀스

TruSeq DNA PCR-Free는 GC가 풍부한 영역, 프로모터 및 반복적 함량과 같이 전통적으로 서열분석이 어려운 영역에 대해 우수한 커버리지를 제공합니다.

워크플로는 다양한 판독 길이로 조정 가능하며 모든 Illumina 시퀀싱 기기에서 지원됩니다. 이를 통해 연구원은 각 실행을 실험의 필요에 맞게 조정할 수 있습니다.

유전체에 대한 심층적인 통찰력 확보

PCR이 없다는 것은 라이브러리 비뚤림과 갭이 줄어든다는 것을 의미합니다. 그 결과, 유전체 전반에 걸쳐 데이터 품질이 높고 변이체 검출이 최적화됩니다. 우수한 유전체 커버리지 품질은 GC가 풍부한 영역에 대한 갭이 거의 없고 커버리지가 양호하다는 것을 의미합니다.

PCR이 없는 프로토콜로 시간 절약

PCR 제거는 시간을 절약하고 PCR 단계와 관련된 유전체 커버리지 편향을 제거합니다. 비드 기반 크기 선택으로 워크플로가 단축됩니다. TruSeq DNA PCR-Free는 Illumina 시퀀싱 시스템과 함께 광범위하게 채택된 라이브러리 준비 워크플로우에 대한 다양한 개선 사항을 제공합니다.

유연한 처리량 옵션 이용

  • 단일 인덱스가 있는 TruSeq DNA PCR-Free는 저처리량(LT) 연구를 위한 24-샘플 수동 처리를 지원합니다.
  • 96개의 CD 인덱스가 있는 TruSeq DNA PCR-Free는 High-throughput(HT) 연구를 위한 96개 샘플 처리를 지원하며 액체 처리 로봇에서 자동화(또는 수동 처리)할 수 있습니다.
  • Illumina 고유 이중(UD) 인덱스(24 또는 96)용 IDT는 판독의 정확한 할당과 유동 셀의 효율적인 사용을 가능하게 하는 향상된 플렉시티를 제공합니다.

빠르고 자동화를 지원하는 워크플로우

하루 안에 Illumina 시퀀싱을 위한 라이브러리를 준비해 보세요. Illumina의 적격 방법은 파트너를 통해 다양한 자동화 플랫폼에서 사용할 수 있습니다.

사양

Assay 시간 총 분석 시간 5시간
자동화 기능 Liquid handling robots
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
설명 유전체의 어려운 영역을 통과해 시퀀싱하는 기능을 갖춘 전장 유전체 시퀀싱 연구를 위한 단순한 전체 포함 PCR-free prep입니다.
수작업 시간 4시간
사용량 DNA 1 ug
Instruments MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
작용 기전 기계적 DNA 절편화 및 어댑터 라이게이션. 워크플로우는 PCR을 사용하지 않고 겔이 없음.
방법 Genotyping by sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing
멀티플렉싱 싱글 최대 24개, 조합(CD) 듀얼 96개, 고유한 듀얼 24개 및 고유한 듀얼(UD) 조합 96개
Nucleic acid type DNA
특수 샘플의 종류 Not FFPE-compatible
Species category Other, Mammalian, Mouse, Human, Rat, Plant
종 세부 사항 대부분의 큰 DNA 유전체와 호환됨.
표적 단편 크기 350 bp 또는 550 bp
Technology Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

필수 제품

Illumina는 이제 워크플로우의 유연성을 위해 모듈식 제품 주문을 제공합니다. 다음 인덱스가 있는 다음 라이브러리 준비 제품을 주문할 수 있습니다. 

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우

1
준비
2
시퀀스
3
분석

프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

1 sample per run (based on 30× coverage of a human genome) 

350 bp 삽입: ≤ 2 × 100 bp
550 bp 삽입: ≤ 2 × 150 bp
NovaSeq 6000 System

Samples per run (dual flow cell): S1: 8, S2: 16, S4: 48 (based on 30× coverage of a human genome) 

350 bp 삽입: ≤ 2 × 150 bp
550 bp 삽입: ≤ 2 × 150 bp

관련 애플리케이션 및 방법

대규모 전장 유전체 시퀀싱

대규모 전장 유전체 시퀀싱은 질병 연구 및 집단 유전체학 연구에 대한 정보를 제공하고 질병 관련 대립유전자를 밝혀냅니다.

미생물 전장 유전체 시퀀싱

Use microbial whole-genome sequencing to map genomes of novel organisms, finish genomes of known organisms, or compare genomes across multiple samples.

다른 사람들이 이 제품을 사용하는 방법
SNS 고양이 인플루언서에 대한 시퀀싱

Max Planck Institute와 University of Pennsylvania의 연구원들은 NextSeq 500 시스템을 사용하여 Lil Bub의 유전체 염기서열 분석에 자금을 지원하여 고양이 희귀 질환의 유전적 원인을 밝혀냈습니다.

문서

제품 관련 자료
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TruSeq DNA PCR-Free Illumina DNA PCR-Free Prep Illumina DNA Prep TruSeq DNA Nano
Assay 시간 총 분석 시간 5시간 ~1.5시간 약 3~4시간(DNA 추출부터 정규화된 라이브러리까지) 약 6시간의 총 분석 시간
자동화 기능 Liquid handling robots Liquid handling robots Liquid handling robots Liquid handling robots
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
설명 유전체의 어려운 영역을 통과해 시퀀싱하는 기능을 갖춘 전장 유전체 시퀀싱 연구를 위한 단순한 전체 포함 PCR-free prep입니다. PCR 유도 바이어스를 동시에 제거하고 총 라이브러리 준비 시간을 90분으로 단축하는 온 비드 태그 부착과 PCR이 없는 화학 물질의 고유한 조합을 사용하여 민감한 응용 분야를 위한 시퀀싱 라이브러리를 준비합니다. 다양한 샘플 유형과 DNA 투입량을 수용하여 인간에서 미생물 전장 유전체 염기서열 분석에 이르기까지 광범위한 응용 분야에 액세스할 수 있는 빠르고 유연한 라이브러리 준비 워크플로우.  높은 유전체 커버리지 품질과 편향 감소 효과를 제공하는 저사용량 연구 방법입니다.
수작업 시간 4시간 약 45분 1~1.5시간 ~4시간
사용량 DNA 1 ug 25~300 ng 작은 게놈(예: 미생물)의 경우 1~500 ng DNA, 또는 큰 게놈(예: 인간)의 경우 100~500 ng DNA. (혈액 및 타액의 경우 참조 가이드 확인). genomic DNA 100 ng
Instruments MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
작용 기전 기계적 DNA 절편화 및 어댑터 라이게이션. 워크플로우는 PCR을 사용하지 않고 겔이 없음. Bead-linked transposome Bead-linked transposome 기계적 DNA 절편화 및 어댑터 라이게이션. 워크플로우는 편향 감소 PCR을 사용하고 겔이 없음.
방법 Genotyping by sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing Whole-genome sequencing, De novo sequencing Amplicon sequencing, Whole-genome sequencing, De novo sequencing, Shotgun sequencing Genotyping by sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing
멀티플렉싱 싱글 최대 24개, 조합(CD) 듀얼 96개, 고유한 듀얼 24개 및 고유한 듀얼(UD) 조합 96개 최대 384플렉스 최대 384개의 고유한 듀얼(UD) 조합 및 96개의 조합 듀얼(CD) 조합 싱글 최대 24개, 조합(CD) 듀얼 96개, 고유한 듀얼 24개 및 고유한 듀얼(UD) 조합 96개
Nucleic acid type DNA DNA DNA DNA
특수 샘플의 종류 Not FFPE-compatible Blood, Not FFPE-compatible, Low-input samples, Saliva, Not FFPE-compatible Blood, Not FFPE-compatible, Saliva Not FFPE-compatible, Low-input samples
Species category Other, Mammalian, Mouse, Human, Rat, Plant Any species, Human Drosophila, Any species, Mammalian, Mouse, Yeast, Zebrafish, Human, Rat, Plant, Virus, Nematode, Bacteria Other, Mammalian, Mouse, Human, Rat, Plant
종 세부 사항 대부분의 큰 DNA 유전체와 호환됨. 모든 종과 호환됨 대부분의 큰 DNA 유전체와 호환됨.
표적 단편 크기 350 bp 또는 550 bp 450 bp +/- 75 bp ~350 bp 350 bp 또는 550 bp
Technology Sequencing Sequencing Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Short tandem repeats (STRs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

선택 도구:

Library Prep and Array Kit Selector

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라이브러리 프렙 (2)

TruSeq DNA PCR-Free Low Throughput Library Prep Kit (24 samples)

20015962

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약 및 샘플 정제 비드가 포함되어 있습니다. 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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TruSeq DNA PCR-Free High Throughput Library Prep Kit (96 samples)

20015963

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약 및 샘플 정제 비드가 포함되어 있습니다. 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (1)

IDT for Illumina – TruSeq DNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040870

96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96개의 8 bp 인덱스를 포함하며 TruSeq Nano 및 TruSeq PCR-Free Library Prep Kit와 호환됩니다. 버전 2는 플레이트 20022370의 192개 인덱스 올리고(oligo) 중 8개에 대한 개선 사항을 포함하고 있으며, 나머지 184개에는 변경사항이 없습니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입하세요.

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

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클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

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Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

TruSeq DNA Nano

전장 유전체 염기서열분석 라이브러리를 생성하고 이용 가능한 DNA가 제한된 검체를 효율적으로 조사합니다.

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NovaSeq 6000 Xp Workflow는 플로우 셀당 독립적인 레인 로딩 및 높은 라이브러리 다중화의 유연성을 제공하여 단일 실행에서 샘플 처리량을 극대화합니다.

Illumina DNA PCR-Free Prep

민감한 시퀀싱 애플리케이션에 대해 매우 정확한 데이터를 제공하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 준비 워크플로우입니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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