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NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시퀀싱 시스템 사양

강력하고 검증된 벤치탑 시퀀싱

규모에 따라 조정이 가능한 데이터 아웃풋, 효율적인 분석 소요 시간, 높은 데이터 품질 제공

유동 셀당 시퀀싱 출력a

XLEAP-SBS 화학이 포함된 NextSeq 1000 및 NextSeq 2000

플로우 셀 유형 P1b P2b P3b,c P4c
1 × 50 bp       90Gb
2 × 50 bp 10 Gb 40 Gb 120 Gb 180 Gb
2 × 100 bp   80 Gb 240 Gb 360 Gb
2 × 150 bp 30 Gb 120 Gb 360 Gb 540Gb
2 × 300 bp 60 Gb 240 Gb    

a. 출력 사양은 지원되는 클러스터 밀도에서 Illumina PhiX 제어 라이브러리를 기반으로 합니다.
b. 2024년 2Q2에 P1, P2 및 P3 플로우 셀용 XLEAP-SBS 시약을 사용할 수 있습니다. 표준 SBS 사양은 여기에서 확인하세요.
c. P3 및 P4 시약은 NextSeq 2000 시스템에서만 사용할 수 있습니다.

사용기간

NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시퀀싱 시스템

품목 보관 온도 P1, P2, P3 사용기간a P4 사용기간b
카트리지 -25°C ~ -15°C 6개월 3개월
플로우 셀 2°C ~ 8°C 6개월 3개월
Tween 20c 포함 RSB 2°C ~ 8°C 6개월 6개월

a. XLEAP-SBS 화학이 있는 P1, P2 , P3은 6개월의 사용기간으로 2024년 2Q2에 시작될 것이다.
b. 2024년 1H기에 P4 사용기간은 3개월이 될 것이다. 이는 202H 6개월로 연장될 것입니다. 표준 SBS 사양은 여기에서 확인하세요.
c. 실온에서 배송합니다.

유동 셀당 통과 필터 판독

XLEAP-SBS 화학이 포함된 NextSeq 1000 및 NextSeq 2000

플로우 셀 유형 P1a P2a P3a,b P4b
단일 읽기 100M 400M c 1.2B 1.8B
페어링된 엔드 읽기 200M 개 800M 일 2.4B 개 3.6B

a. 2024년 2Q2에 P1, P2 및 P3 플로우 셀용 XLEAP-SBS 시약을 사용할 수 있습니다.
b. P3 및 P4 시약은 NextSeq 2000 시스템에서만 사용할 수 있습니다. 표준 SBS 사양은 여기에서 확인하세요.
c. 표준 SBS 화학 물질로 2 × 300 bp에 대한 300M 단일 종단 판독. XLEAP-SBS 화학을 사용한 2 x 300 bp에 대한 400M 단일 종단 판독.
d. 표준 SBS 화학 물질과 함께 2 × 300bp에 대한 600M 페어드 엔드 판독. XLEAP-SBS 화학을 사용한 2 x 300 bp에 대한 800M 싱글 엔드 리드.

품질 점수 및 실행 시간

XLEAP-SBS 화학이 포함된 NextSeq 1000 및 NextSeq 2000

플로우 셀 유형 P1 a P2 a P3 a,b P4 b
품질 점수c  
1 × 50 bp Q30을 넘는 염기의 ≥ 90%
2 × 50 bp Q30을 넘는 염기의 ≥ 90%
2 × 100 bp Q30을 넘는 염기의 ≥ 90%
2 × 150 bp Q30을 넘는 염기의 ≥ 90%
2 × 300 bp Q30을 넘는 염기의 ≥ 85%
실행 시간  
1 × 50 bp       12시간
2 × 50 bp 8시간 12시간 18시간 20시간
2 × 100 bp   19시간 31시간 34시간
2 × 150 bp 17시간 22시간 40시간 44시간
2 × 300 bp 34시간 42시간    

a. 2024년 2Q2에 P1, P2 및 P3 플로우 셀용 XLEAP-SBS 시약을 사용할 수 있습니다.
b. P3 및 P4 시약은 NextSeq 2000 시스템에서만 사용할 수 있습니다. 표준 SBS 사양은 여기에서 확인하세요.
c. 품질 점수는 Illumina PhiX 제어 라이브러리를 기반으로 합니다. 성능은 라이브러리 유형 및 품질, 삽입 크기, 로딩 농도 및 기타 실험 요인에 따라 다를 수 있습니다.
d. 실행 시간에는 NextSeq 1000 또는 NextSeq 2000 시스템에서 클러스터 생성, 시퀀싱 및 기본 호출이 포함됩니다.

주요 어플리케이션에 대한 예상 샘플 처리량a

XLEAP-SBS 화학이 포함된 NextSeq 1000 및 NextSeq 2000

애플리케이션 P1b P2b P3b,c P4c
  샘플 수 샘플 수 샘플 수 샘플 수

소규모 전장 유전체 염기서열분석(300주기)

130 Mb 유전체, 30× 적용 범위

 7 30 92 138

전엑솜 염기서열분석(200주기)

엑솜당 약 8Gb, 평균 커버리지의 90배

 ~2일 10 30 45

총 RNA-Seq(200주기)d

샘플당 50M 리드 페어

 2일 8 24 36

mRNA-Seq(200주기)d

샘플당 25M 리드 페어

 4일 16 48 72

단일 세포 RNA-Seq(100주기)e

5K 세포, 세포당 20K 판독

 1e 4 12 48

miRNA-Seq 또는 소형 RNA 분석(50주기)

샘플당 11M만 개 판독

 9f 36f 108f 163
16S RNA 시퀀싱(600 사이클) 384g 384g 해당 없음

a. 표 값은 실행당 추정 검체 수를 나타낸다. 권장되는 염기서열분석 깊이는 검체 유형 및 실험 목적에 따라 크게 달라지며 각 시험에 최적화되어야 한다.
b. 2024년 2Q2에 P1, P2 및 P3 플로우 셀용 XLEAP-SBS 시약을 사용할 수 있습니다. 표준 SBS 사양은 여기에서 확인하세요.
c. P3 및 P4 시약은 NextSeq 2000 시스템에서만 사용할 수 있습니다.
d. P1 300-사이클 키트를 사용하십시오.
e. P1 시약은 단일 세포 정도 관리 실험에 적합한 옵션입니다.
f. 100-사이클 키트를 사용하십시오.
g. Illumina는 최대 384개의 고유한 이중 인덱스를 제공합니다.

기기 사양

NextSeq 1k / 2k instrument specifications
AR 보기
AR 보기
  • Instrument configuration
    Self-contained, dry instrument with integrated DRAGEN Bio-IT FPGA secondary analysis
  • Instrument control computer
    Base Unit: 2U Microserver located inside the instrument
    Memory: 288 GB Hard Drive: 3.8 TB SSD
    Operating System: Linux CentOS 7.6
  • Operating environment
    For Indoor Use Only
    Temperature: 15°C-30°C
    Humidity: 20%-80% relative humidity, non-condensing
    Altitude: 0 meters-2000 meters
  • Laser
    Wavelengths
    449 nm, 523 nm, 820 nm
  • Crated Dimensions
    W × D × H
    92 cm × 120 cm × 118 cm
    Weight: 232 kg
  • Dimensions
    W × D × H
    55 cm × 65 cm × 60 cm
    (21.7 in × 25.6 in × 23.6 in)
  • Weight
    141 kg (310.9 lb)
  • Crated weight
    232 kg (511.5 lb)
  • Power requirements
    Instrument Input Voltage: 100Vac to 240Vac
    Instrument Input Frequency: 50/60Hz
  • Bandwidth for network connection
    200 Mb/s/instrument for internal network uploads
    200 Mb/s/instrument for BaseSpace Sequence Hub uploads
    5 Mb/s/instrument for Instrument Operational Data uploads
  • Product safety and compliance
    Safety: Class 1 Laser Product
    NRTL certified IEC
    61010-1 CE marked
    FCC/IC approved
심층 사양 시트(PDF) 보기

주요 기술

XLEAP-SBS 화학

NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템은 XLEAP-SBS 화학, 표준 Illumina SBS 화학의 입증된 기반 위에 구축된 더 빠르고 더 높은 품질의 더 강력한 SBS 화학을 기반으로 합니다.* XLEAP-SBS 뉴클레오티드는 최신 염료와 열에 더 내성이 있고, 가수분해의 50배 감소 및 2.5배 더 빠른 블록 절단을 보여 위상 및 사전 위상을 감소시키는 새로운 링커 및 블록을 사용한다. XLEAP-SBS 중합효소는 그 어느 때보다 더 빠르고 높은 충실도로 뉴클레오티드를 통합하도록 설계되었습니다.

*P1, P2, P3의 XLEAP-SBS 화학검사는 2024년 2Q2에 이용 가능할 것이다.

합성 기술에 의한 시퀀싱

NextSeq 1000 및 2000 시스템은 입증된 SBS(합성 기반 시퀀싱) 기술을 활용하여 매우 정확한 데이터와 강력한 성능을 제공합니다. 이 기술은 Illumina만의 형광 표지된 가역적 종결자(reversible terminator) 방법을 사용하여 대규모 병렬형 시퀀싱을 지원합니다. P1, P2, P3의 XLEAP-SBS 화학검사는 2024년 2Q2에 이용 가능할 것이다.

무손실 유전체 데이터 압축 기술

NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시퀀싱 시스템 기기 내에서 유전체 데이터를 무손실 압축(lossless compression)할 수 있습니다. 이 기술은 초고속 매핑 기법을 사용하여 리드를 참조 유전체(reference genome)에 매핑한 다음, 해당 리드를 재생성하는 데 필요한 데이터(위치 및 차이점 목록)만 저장합니다.

패턴 플로우 셀 기술

NextSeq 1000 및 2000 시스템은 혁신적인 패턴 플로우 셀 기술을 활용하여 다양한 시퀀싱 응용 분야에 탁월한 수준의 처리량을 제공합니다. 패턴화된 플로우 셀은 정해진 위치에 수십억 개의 나노웰(nanowell)을 가지고 있으며, 시퀀싱 클러스터의 간격이 균일하게 설계되어 있습니다. 이를 통해 시퀀싱 리드 및 전체 데이터 아웃풋이 크게 증가합니다.