플로우 셀 유형 | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
2 × 50 bp | 약 165 Gb | 약 1 Tb | 해당 없음 |
2 × 100 bp | 약 330 Gb | 약 2 Tb | 해당 없음 |
2 × 150 bp | 약 500 Gb | 약 3 Tb | 약 8 Tb |
고처리량 시퀀싱의 새로운 기준
차세대 시퀀싱 데이터 생성량, 샘플 처리량, NovaSeq X 및 NovaSeq X Plus 시스템의 사양
플로우 셀 유형 | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
2 × 50 bp | 약 165 Gb | 약 1 Tb | 해당 없음 |
2 × 100 bp | 약 330 Gb | 약 2 Tb | 해당 없음 |
2 × 150 bp | 약 500 Gb | 약 3 Tb | 약 8 Tb |
* 해당 사양은 Illumina의 PhiX Control 라이브러리 또는 NA12878로 생성된 TruSeq DNA 라이브러리를 사용해 지원되는 클러스터 밀도(cluster density)로 얻은 수치를 근거로 합니다.
NovaSeq X Plus 시스템은 단일 플로우 셀 실행 또는 듀얼 플로우 셀 실행이 가능합니다. 듀얼 플로우 셀 실행은 위에 나열된 출력의 두 배를 제공합니다.
NovaSeq X 시스템은 단일 플로우 셀 실행이 가능합니다.
플로우 셀 유형 | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
싱글 엔드 리드 | 1.6B 개 | 10B 개 | 26B 개 |
페어드 엔드 리드 | 3.2B 개 | 20B 개 | 52B 개 |
플로우 셀 유형 |
1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
Quality Score | |||
2 × 50 bp | Q30을 넘는 염기의 ≥ 90% | ||
2 × 100 bp | Q30을 넘는 염기의 ≥ 85% | ||
2 × 150 bp | Q30을 넘는 염기의 ≥ 85% | ||
런 타임 | |||
2 × 50 bp | 약 17시간 | 약 18시간 | 해당 없음 |
2 × 100 bp | 약 20시간 | 약 22시간 | 해당 없음 |
2 × 150 bp | 약 23시간 | 약 25시간 | 약 48시간 |
* Quality Score(Q-score, 품질 점수)는 베이스 콜링(base calling) 시 오류가 발생할 확률을 예측한 점수입니다. 런 전체에 걸쳐서 > Q30인 염기의 백분율의 평균값을 계산했습니다. Q-Score는 NovaSeq X 시리즈에서 Illumina PhiX Control 라이브러리를 사용하여 10B 시약으로 수행한 시퀀싱을 기준으로 합니다. 성능은 라이브러리 유형 및 품질, 단편(insert) 크기, 사용 농도(loading concentration), 및 기타 실험 요인에 따라 상이할 수 있습니다.
† 런 타임에는 자동 클러스터 생성, 시퀀싱, 자동 포스트런 워시(post-run wash), 베이스 콜링에 소요된 시간을 포함합니다. 런 타임은 Illumina의 PhiX Control 라이브러리를 사용해 지원되는 클러스터 밀도로 얻은 수치를 근거로 합니다. 성능은 라이브러리 유형 및 품질, 단편(insert) 크기, 사용 농도, 및 기타 실험 요인에 따라 상이할 수 있습니다.
이 기술 노트에 요약된 모범 사례를 따라 라이브러리 품질을 평가하고, 로딩 농도를 최적화하고, 풀 라이브러리를 사용하여 NovaSeq X Series의 성능을 극대화하십시오.
플로우 셀 유형 | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
플로우 셀당 인간 게놈 | 약 4개 | 약 24개 | 약 64개 |
플로우 셀당 엑솜 | 약 41개 | 약 250개 | 약 750개 |
플로우 셀당 전사체 | 약 30개 | 약 200개 | 약 520개 |
*모든 샘플 처리량은 싱글 플로우 셀 런당 예상 샘플 처리량입니다. 인간 유전체(genome)에 대한 추정치는 30x 유전체 커버리지(coverage)를 달성하기 위해 샘플당 > 120 Gb의 데이터를 가정하여 도출했습니다. 엑솜은 샘플당 ~8Gb 또는 ~40M 판독을 가정하여 100배의 커버리지를 달성합니다. 전사체에 대한 추정치는 ≥50M 개의 리드를 가정하여 도출했습니다. 처리량은 엑솜 패널 크기, 필요한 깊이 및 사용된 라이브러리 준비 키트 등 여러 가지 요인에 따라 달라질 수 있습니다.
가상 투어에서 NovaSeq X 시리즈의 다양한 혁신과 XLEAP-SBS chemistry에 대한 개요를 살펴보세요. 통합 바이오인포매틱스, 데이터 공간 감소, 동결 건조 시약 및 기타 혁신에 대해 알아보세요.
NovaSeq X 시리즈는 현재까지 출시된 기기 중 가장 빠르고, 품질이 우수하며, 가장 강력한 sequencing by synthesis(SBS) chemistry인 XLEAP-SBS chemistry를 기반으로 합니다. 표준 Illumina SBS chemistry의 검증된 기술력을 기반으로 개발된 XLEAP-SBS chemistry는 2배 더 빠른 포합 시간으로 향상된 시약 안정성을 제공합니다.
NovaSeq X 시리즈는 여러 패턴화된 플로우 셀 기술을 통합하여 매우 많은 양의 데이터를 처리하므로 다양한 시퀀싱 애플리케이션에 이용할 수 있습니다. NovaSeq X 패턴화된 플로우 셀은 정해진 위치에 수십억 개의 나노웰(nanowell)을 가지고 있으며, 시퀀싱 클러스터의 간격이 균일하게 설계되어 있습니다. 이를 통해 시스템의 시퀀싱 리드 및 전체 데이터 생성량이 크게 증가합니다.
NovaSeq X 및 NovaSeq X Plus 시스템은 DRAGEN Bio-IT Platform과 통합되어, 유전체 데이터 분석을 정확하고 매우 빠른 속도로 수행하게 해 줍니다. 여러 2차 분석 파이프라인을 기기 또는 클라우드에서 동시에 실행하세요. 한 번의 런으로 플로우 셀당 최대 4개의 애플리케이션을 동시에 실행할 수 있습니다.
통합 DRAGEN ORA(original read archive)는 무손실 압축(lossless compression)을 통해 FASTQ 파일 크기를 최대 5배까지 줄일 수 있게 해 줍니다. 이렇게 최적화된 유전체 데이터 압축을 통해 더 빠르게 데이터를 전송하고 더 쉽게 데이터를 관리할 수 있습니다. 또한 데이터 발자국이 더 작아져 보관 및 에너지 소비 비용도 줄어듭니다.
보다 지속가능한 방식으로, 더욱더 많은 발견을 이끌어 내 보세요.
NovaSeq X 시리즈는 지속 가능성 개선을 목표로 제작되었습니다. 실온 상태로 도착하는 동결건조 시약과 시약 포장 폐기물의 약 90%가 감소하는 등의 혁신이 이루어졌습니다. 플라스틱 사용량이 50% 이상 감소했으며 버퍼 카트리지는 식물 유래 생체고분자로 제작되었습니다.
NovaSeq X 시리즈는 높은 개구수(numerical aperture), 맞춤형 CMOS 센서, 파란색-청록색 광학 시스템을 갖춘 2채널 SBS를 통해 초고해상도 이미징 데이터를 생성하게 해 줍니다. 더 짧은 파장을 이용함으로써 나노웰 사이의 간격이 더 좁아져 NovaSeq X 시리즈 25B Flow Cell에서 최대 260억 번의 싱글 리드가 가능합니다.