SBS 기술의 장점
강력한 성능 및 데이터 품질
Illumina SBS(Sequencing by Synthesis)는 전 세계에서 시퀀싱 데이터를 생성하는 차세대 시퀀싱(NGS) 기술입니다. SBS chemistry은 오류 없는 리드의 최고 수율을 제공하여1 유전체 전체에서 강력한 염기 검출을 가능하게 합니다. Illumina SBS 기술의 품질 및 성능 이점은 결과에 대한 확신을 제공합니다.
입증된 염기 검출 정확도
SBS chemistry는 단일 염기 연장 및 경쟁적인 뉴클레오티드 첨가를 사용하여 매우 정확한 시퀀싱이 가능하졌습니다. SBS는 염기가 잘못 검출될 확률이 0.1%임을 나타내는 품질 점수인 Q30보다 시퀀싱된 염기의 백분율이 가장 높습니다. 이 입증된 정확도는 주요 NGS 플랫폼 중에서 가장 적은 위양성, 위음성 및 검출 오류로 프로젝트 효율성을 개선합니다.2
유전체 전반에서 편향되지 않은 커버리지
최적화된 SBS 시약은 반복적이거나 GC가 풍부한 스팬과 같이 시퀀싱하기 어려운 유전체 영역에서도 균일한 커버리지와 정확도를 보장합니다. SBS는 염기별, 가역적 종결자 chemistry를 사용하며, 이는 이온 반도체 또는 파이로시퀀싱 기술에서 관찰되는 동종중합체 오류를 사실상 제거합니다. SBS는 또한 하이브리드화 및 라이게이션 기반 chemistry에서 관찰되는 높은 GC 편향을 피합니다.2
페어드 엔드 시퀀싱과의 고품질 정렬
SBS는 페어드 엔드 시퀀싱을 가능하게 하며, 양쪽 말단으로부터 DNA 라이브러리 단편을 시퀀싱하여 고품질의 서열 데이터를 생성합니다. 각 리드 쌍 사이의 거리가 알려져 있기 때문에, 페어드 엔드 시퀀싱은 정렬 및 유전체 조립을 개선합니다. 리드 쌍으로 정렬된 시퀀스는 구조적 변이, 유전자 융합 및 전사물 동형의 정확한 검출을 가능하게 합니다.
푸시 버튼 인포매틱스
사용이 용이한 BaseSpace Sequence Hub 도구를 사용하면 바이오인포매틱스에 대한 경험에 관계없이 모든 연구자가 NGS 데이터 분석에 액세스할 수 있습니다.
BaseSpace에 대해 알아보기모든 처리량 또는 규모에 대해 비용 효율적
SBS 시약, 광학 및 플로우 셀의 혁신으로 Illumina 시퀀서의 기능이 더욱 향상되었습니다. 최근 발전의 예가 아래에 나와 있습니다.
- 2채널 SBS의 더 빠른 이미지 감지 및 데이터 처리로 NGS는 처리량이 적은 애플리케이션에서도 비용 효과적입니다.
- 패턴화된 플로우 셀 기술은 $1000 인간 유전체를 가능하게 하는 초고처리량 및 규모의 시퀀싱을 지원합니다.
- 1채널 SBS 또는 Illumina 반도체 시퀀싱 방법은 SBS를 CMOS 기술과 결합하여 iSeq 100 System에서 기기 비용을 절감하고 NGS를 단순화합니다.
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참고 문헌
- Based on a comparison of the top 3 industry-leading NGS platforms. Data calculations on file. Illumina, Inc. 2016.
- Ross MG, Russ C, Costello M, et al. Characterizing and measuring bias in sequence data. Gen Biol 2013;14:R51