벤치탑 시퀀싱 기기

사용하기 쉬운 플랫폼으로 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)의 성능을 검사실에 도입해 보세요

NovaSeq 2000 in lab setting

벤치탑 시퀀싱으로 간소함과 성능을 함께

벤치탑 시퀀서는 유연하고 접근 가능한 설계로 사용자에게 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 역량을 제공합니다. 사전 구성된 분석 워크플로우를 포함하여 운영상의 간소함으로 구축된 이러한 시스템은 초보자 및 경험이 풍부한 NGS 사용자가 NGS를 사내에 도입하고 다양한 애플리케이션에서 표적 시퀀싱을 수행할 수 있도록 지원합니다.

벤치탑 시퀀서는 대규모 연구 전에 저처리량 및 중간 처리량 애플리케이션과 라이브러리 품질 관리(QC)를 위한 비용 효율적인 솔루션을 제공할 수 있습니다.

scientist using NextSeq 2000

시퀀싱 제어

시퀀싱 프로젝트를 아웃소싱하는 사용자가 벤치탑 시퀀서에 투자하여 차세대 시퀀싱을 사내에 도입하는 것에 다음과 같은 여러 장점이 있을 수 있습니다.

  • 샘플당 시퀀싱 비용 절감
  • 결과를 더 빨리 얻을 수 있도록 총 소요 시간 단축
  • 데이터의 통제 및 프라이버시 유지

벤치탑 시퀀서의 유형

사용자의 요구에 따라 벤치탑 시퀀싱 시스템은 저처리량 또는 중간 처리량 구성으로 다양한 애플리케이션을 지원하는 동시에 탁월한 데이터 품질과 정확성을 갖추었습니다.

저처리량 벤치탑 시스템

데이터 아웃풋: 144메가베이스(Mb)~30기가베이스(Gb)
런당 리드 수: 100만~1억 개

  • 저처리량 내지 중간 처리량의 표적 시퀀싱에 이상적
  • 표적 샘플을 위한 빠른 워크플로우
  • 대규모 프로젝트 전에 파일럿 연구 및 라이브러리 QC에 매우 적합

중간 처리량 벤치탑 시스템

데이터 아웃풋: 10 Gb~540 Gb
런당 싱글 엔드 리드(single-end reads): 7,500만~18억 개

  • 공간 분석 및 단일세포 시퀀싱과 같은 광범위한 새로운 애플리케이션을 위한 유연성
  • 벤치탑 설치 공간을 유지하면서도 데이터 아웃풋 범위 확대
  • 기기 내 2차 분석 파이프라인을 포함할 수 있음

올바른 벤치탑 시퀀서 찾기

벤치탑 시퀀싱 시스템을 구매하려고 할 때 고려해야 할 주요 요소에는 검사실에서 가장 많이 사용하는 애플리케이션의 종류와 생성된 데이터의 분석 방법이 포함됩니다.

애플리케이션 및 샘플 번호와 일치하는 데이터 아웃풋

사용자의 방법과 애플리케이션은 저처리량 또는 중간 처리량 벤치탑 시퀀서가 필요한지 여부를 결정하는 데 도움이 됩니다. 작은 전장 유전체, 미생물 메타지노믹 및 표적 유전자 시퀀싱에 주로 관심이 있다면 저처리량 벤치탑 시퀀서가 적합합니다. 전장 엑솜 및 단일세포 시퀀싱과 같은 방법의 경우, 중간 처리량 벤치탑 시퀀서를 고려해 보세요.

데이터 분석 방법 결정

분석 목표는 시퀀싱 플랫폼을 선택할 때 중요한 고려사항입니다. 초보 사용자는 기기 내 또는 클라우드에서 이용할 수 있는 사용이 용이한 사전 구성 분석 파이프라인으로부터 혜택을 얻을 수 있습니다. 숙련된 사용자의 경우 광범위한 인포매틱스 파이프라인과의 기기 호환성을 활용하거나 자체적으로 구축할 수 있습니다.

주요 Illumina 벤치탑 시퀀서

검사실이 첫 번째 NGS 시퀀서를 획득하든 아니면 확장 준비가 되어 있든 관계없이, Illumina는 단순화된 운영, 유연하고 확장 가능한 시퀀싱, 직관적인 데이터 분석을 갖춘 검증된 벤치탑 시퀀싱 시스템을 제공합니다. 온보드 클러스터 생성과 최소한의 유지 관리를 포함하는 간단하고 세심한 설계로 시퀀서를 차별화합니다.

MiSeq i100 시리즈

MiSeq i100 시리즈를 사용하면 초보자 및 숙련된 사용자가 간편한 운영과 통합 데이터 분석을 통해 NGS에 쉽게 액세스할 수 있습니다. 실행 시간이 4시간으로 빠르므로 당일 결과를 받아 그 어느 때보다 빠르게 발견을 실현할 수 있습니다.

NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템

NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 Sequencing System은 유연하고 확장 가능하여 과학자들이 단일세포, 전장 엑솜 및 RNA 시퀀싱과 같은 애플리케이션을 탐색할 수 있도록 지원합니다. 전 세계에 2,150개 이상의 시스템이 설치되어, 간소화된 실행 설정, 최소 터치포인트 및 온보드 DRAGEN 소프트웨어를 포함한 유연한 인포매틱스 솔루션을 갖추었습니다.

대표적인 Illumina 벤치탑 시퀀싱 시스템 비교

   

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주요 사양

iSeq 100 시스템

MiniSeq 시스템

MiSeq 시스템

MiSeq i100 시리즈

NextSeq 1000 및 2000 시스템

데이터 아웃풋 범위 144 Mb~1.2 Gb 1.65~7.5 Gb 300 Mb~15 Gb 1.5~30 Gb a 10~540 Gb
키트 구성 수 5 5 9 10 14
런 타임(범위) 9.5~19 시간 5~24 시간 5.5~56 시간 4~15.5 시간 8~44 시간
런(run)당 최대 리드 수(싱글 리드) 4M 25M 25M 100M 1.8B
최대 리드 길이 2 × 150 bp 2 × 150 bp 2 × 300 bp 2 × 300 bp 2 × 300 bp
주요 애플리케이션
소형 전장 유전체 시퀀싱(Small Whole-Genome Sequencing)

(미생물, 바이러스)

세균, 바이러스 또는 기타 미생물의 전체 유전체를 시퀀싱해 보세요.

주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
지원되는 애플리케이션
표적 DNA 시퀀싱

표적 유전자 시퀀싱 패널은 주어진 샘플에서 특정 돌연변이를 분석하는 데 유용한 도구입니다.

작은 표적 패널의 주요 애플리케이션*

작은 표적 패널의 주요 애플리케이션*

작은 표적 패널의 주요 애플리케이션*

작은 표적 패널의 주요 애플리케이션*

작은 표적 패널의 주요 애플리케이션*

mRNA 시퀀싱

폴리A 포획을 사용한 mRNA 인리치먼트 후, 민감하고 정확한 유전자 발현 측정법입니다.

     
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
Total RNA 시퀀싱

코딩(coding) 및 다양한 형태의 비코딩(noncoding) RNA를 모두 분석하여 전사체에 대한 포괄적인 관점에서 살펴보세요.

   
지원되는 애플리케이션
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
16s rRNA 시퀀싱

복잡한 마이크로바이옴 또는 연구하기 어려운 환경에서 세균을 식별하고 비교하는 무배양 방법입니다.

   
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
전장 엑솜 시퀀싱

유전자의 코딩 영역을 분석하여 유전적 변이를 식별하는 DNA 기술입니다.

     
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
메타지노믹 프로파일링

(샷건 메타지노믹스, 메타트랜스크립토믹스)

수천 개의 유기체를 동시에 시퀀싱해 보세요. 세균, 바이러스 또는 기타 미생물의 전체 유전체에서 배양이 불가능하거나 존재량이 적은 미생물을 식별하거나 미생물 다양성을 평가해 보세요.

     
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
ATAC-Seq

유전체 전체에서 크로마틴 접근성을 확인하는 데 널리 사용되는 방법입니다.

     
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
메틸레이션 시퀀싱

시퀀싱 기반 DNA 메틸레이션 분석을 통해 높은 커버리지 밀도와 유연성으로 후성유전학적 연구를 향상시켜 보세요.

     
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
표적 단백질체학

특정 단백질을 분석하여 생물 시스템에서 그 기능 및 상호작용을 이해합니다.

     
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
단일세포 시퀀싱

더 큰 조직을 구성하는 고유한 세포 분야를 발견합니다.

     
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
공간 분석

조직 부분 내 전사 활동의 포괄적인 지도를 확보해 보세요.

     
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
액체 생검 연구

비침습적 암 생체표지자로서 세포유리 순환 종양 DNA를 검사해 보세요.

     
지원되는 애플리케이션
지원되는 애플리케이션
면역 레퍼토리 시퀀싱

면역 세포 수용체를 해독하여 면역계의 다양성과 반응을 이해합니다.

   
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
주요 애플리케이션
큰 전장 유전체 시퀀싱(Large whole-genome sequencing)

(인간)

전체 유전체의 광범위한 시퀀싱입니다.

       
지원되는 애플리케이션
 
주요 애플리케이션
 
지원되는 애플리케이션

*소형 표적 패널 < 50 genes, large targeted panels > 50개 유전자.

 

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참고 문헌

  1. 최대 범위는 100M 플로우 셀 사양을 기준으로 합니다. 50M 및 100M 플로우 셀은 2025년부터 MiSeq i100 Plus System에만 사용할 수 있습니다.

검증된 기술과 지원으로 자신 있게 NGS를 실험실에 도입

검사실에 가장 적합한 벤치탑 시퀀서를 결정할 때는 우수성 기록을 보인 업체를 선정하는 것이 중요합니다. Illumina는 과학자들이 성장하는 유전체학 커뮤니티에 참여하도록 영감을 주기 위해 혁신을 지속적으로 추구하고 있으며, 입증된 성과로 Illumina는 다른 시퀀싱 회사보다 더 많이 인용될 수 있었습니다.

421,000+개의 시퀀싱 간행물1
전 세계에 10,000+개의 MiSeq System 설치
전 세계에 2150+개의 NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템 설치
연간 3,000+건의 트레이닝
주5일 24시간 원격 기술 지원
150+개국에 서비스 제공

과학계의 의견 들어 보기

이 비디오와 기사에서 Illumina 벤치탑 시퀀싱 시스템에 대한 다른 사람들의 경험을 들어 보세요.

세균성 약물 내성의 원인 규명

이 기사에서 Philip Supply 박사는 광범위한 내성, 전파, 진화의 패턴을 평가하여 조용한 발병의 원인이 되는 다제 내성 결핵 균주를 식별하는 데 MiSeq System을 어떻게 사용하는지 설명합니다.

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참고 문헌

  1. Data calculations on file, Illumina, Inc. 2023.