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Instruments

MiSeq 시퀀싱 시스템 사양

고성능의 단순함

하나의 소형 벤치탑 시퀀싱 시스템에서 짧은 실행 시간, 조정 가능한 판독 길이 및 다중 플로우 셀 옵션 제공

리드 길이에 따른 플로우 셀 출력a,b

리드 길이(read length) MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq 시약 마이크로 키트 v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
1 × 36 bp 해당 없음 해당 없음 540~610 Mb 해당 없음
2 × 25 bp 해당 없음 해당 없음 750~850 Mb 해당 없음
2 × 75 bp 해당 없음 해당 없음 해당 없음 3.3~3.8 Gb
2 × 150 bp 300 Mb 1.2 Gb 4.5~5.1 Gb 해당 없음
2 × 250 bp 500 Mb 해당 없음 7.5~8.5 Gb 해당 없음
2 × 300 bp 해당 없음 해당 없음 해당 없음 13.2~15 Gb

a. MiSeq 시스템은 단일 플로우 셀을 실행합니다. 플로우 셀당 출력과 실행당 출력은 동일합니다. 

b. 지원되는 클러스터 밀도에서 Illumina PhiX 제어 라이브러리를 기반으로 한 사양입니다.

MiSeq 시퀀싱 시스템

플로우 셀당 필터 통과 리드a

  MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq 시약 마이크로 키트 v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
싱글 엔드 읽기 1M 4M 12~15M 22~25M
페어링된 엔드 읽기 2M 8M 24~30M 44–50M

a. v2 chemistry의 경우 필터를 통과하는 클러스터 개수 467~583 k/mm2개, v3 chemistry의 경우 필터를 통과하는 클러스터 개수 727~827 k/mm2개 사이의 지원되는 클러스터 밀도에서 Illumina PhiX PhiX Control 라이브러리를 기반으로 사양을 설치합니다. 실제 성능 파라미터는 라이브러리의 종류, 라이브러리 품질, 필터를 통과하는 클러스터에 따라 다양할 수 있습니다.

MiSeq 시퀀싱 시스템

품질 점수a

리드 길이(read length) MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq 시약 마이크로 키트 v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp 해당 없음 해당 없음 Q30보다 > 90% 더 높은 염기 해당 없음
2 × 75 bp 해당 없음 해당 없음 해당 없음 Q30보다 > 85% 더 높은 염기
2 × 150 bp 해당 없음 해당 없음 Q30보다 > 80% 더 높은 염기 해당 없음
2 × 250 bp 해당 없음 해당 없음 Q30보다 > 75% 높은 염기 해당 없음
2 × 300 bp 해당 없음 해당 없음 해당 없음 Q30보다 > 70% 더 높은 염기

a. 런 전체에 걸쳐서 > Q30인 염기의 백분율의 평균값을 계산함.

MiSeq 시퀀싱 시스템

실행 시간a

리드 길이(read length) MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq 시약 마이크로 키트 v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp 해당 없음 해당 없음 ~5.5시간 해당 없음
2 × 75 bp 해당 없음 해당 없음 해당 없음 약 21시간
2 × 150 bp 약 17시간 약 19시간 약 24시간 해당 없음
2 × 250 bp ~28시간 해당 없음 ~39시간 해당 없음
2 × 300 bp 해당 없음 해당 없음 해당 없음 ~56시간

a. 총 시간에는 클러스터 생성, 시퀀싱 및 이중 표면 스캐닝으로 활성화된 MiSeq 시스템에서의 기본 호출이 포함됩니다.

MiSeq 시퀀싱 시스템

기기 사양

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발광 다이오드(LED)
파장: 520 nm, 660 nm
치수 및 중량
W × D × H: 68.6 cm × 56.5 cm × 52.3 cm(27.0인치 × 22.2인치 × 20.6인치)
건조 중량: 57.2kg(126lb)
상자 무게: 93.6kg(206lb)
심층 사양 시트(PDF) 보기

주요 기술

합성 화학에 의한 시퀀싱

MiSeq 시스템은 입증된 Illumina 합성 시퀀싱(SBS) 화학을 활용하여 정확한 데이터와 강력한 성능을 제공합니다. SBS 화학은 가역적 종결자 형광 표지 뉴클레오티드를 사용하여 성장하는 DNA 가닥에 통합될 때 단일 염기를 검출하고 수십억 개의 서열을 동시에 판독한다.

페어드 엔드 시퀀싱

MiSeq 시스템은 쌍으로 된 말단 염기서열분석을 통합하여 DNA 조각의 양쪽 말단을 염기서열분석할 수 있습니다. 각 페어드 리드 사이의 거리가 알려져 있으므로 정렬(alignment) 알고리즘은 이 정보를 사용하여 리드를 매핑할 수 있습니다. 이는 시퀀싱하기 어렵고 반복적인 유전체(genome) 영역에서 특히 유용합니다.