가능성 살펴보기
MiSeq 시스템은 표적 유전자 및 소유전체 염기서열분석을 포함한 광범위한 응용 분야에 유연성과 단순성을 제공합니다.
소규모 전장 유전체 염기서열분석(WGS)을 통해 공중 보건, 감염성 질환 감시, 분자 역학 연구 및 환경 메타유전체학 분야에 사용되는 미생물 또는 바이러스 유전체를 포괄적으로 분석할 수 있습니다. 이 접근법에는 세균 배양 또는 노동 집약적 복제 단계가 필요하지 않습니다. MiSeq 런(run)당 최대 24개의 작은 유전체를 시퀀싱합니다.
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
작은 유전체, PCR 앰플리콘 및 플라스미드에 최적화된 빠른 라이브러리 준비로, 최소 1 ng의 입력과 15분의 실습 시간이 필요합니다.
인간 전장 유전체 시퀀싱에서부터 앰플리콘, 플라스미드 및 미생물 종 시퀀싱에 이르는 광범위한 애플리케이션에 적합한 빠르고 통합된 워크플로우입니다.
MiSeq 시스템에서 600주기 실행을 지원하는 클러스터링 및 시퀀싱 시약이 포함된 사전 충전된 즉시 사용 가능한 카트리지.
MDA 단일세포 및 표준 세균 데이터 세트에서 작은 유전체를 조립하도록 설계된 de novo 시퀀싱용 오픈 소스 SW 도구입니다.
미생물 유전체 조립을 위한 2개의 데이터 분석 파이프라인(Tell-Read 및 Tell-Link).
BaseSpace Sequence Hub에서 샘플 데이터 찾아보기(로그인 필요): MiSeq 작은 유전체 데이터
샘플당 예상 비용: >80%
*5 Mb 유전체, 50~100X 커버리지(coverage), 2 x 300 bp 리드 길이(read length), Nextera XT Library Prep Kit, MiSeq Reagent v3 600사이클 키트를 기준으로 2016년에 계산한 MiSeq 시스템의 작은 전장 유전체 시퀀싱 샘플당 예상 비용
표적 재시퀀싱(targeted resequencing)은 연구 관심 대상인 유전자의 부분집합 또는 유전체 영역만을 시퀀싱하는 데 시간과 비용 및 분석의 초점을 맞추고 있습니다. PCR 앰플리콘의 울트라 딥 시퀀싱(ultra-deep sequencing)인 앰플리콘 시퀀싱을 사용하면 하나의 assay에서 최대 수백 개의 표적 유전체 영역을 비용 효율적으로 분석할 수 있습니다. 한 번의 MiSeq 런에서 최대 96개 샘플과 1,536개 이상의 앰플리콘을 시퀀싱합니다.
한 번의 런에서 유전체 몇 개에서 수백개에 이르는 표적을 사용하는 고도로 멀티플렉싱된 중합효소 연쇄 반응(PCR) 기반 워크플로우입니다.
DesignStudio는 맞춤형 시퀀싱 프로브를 설계, 주문하거나 맞춤형 유전형 분석 어레이 assay를 생성하는 데 도움이 되는 웹 기반 분석 설계 도구입니다.
MiSeq 시스템에서 300주기 실행을 지원하는 클러스터링 및 시퀀싱 시약이 들어 있는 사전 충전된 즉시 사용 가능한 카트리지.
시퀀싱 런 생성, 런 상태 모니터링, 데이터 분석에 적합한 온프레미스 솔루션
NGS 데이터 분석 및 관리 시 이용하는 Illumina의 유전체학 클라우드 컴퓨팅 환경입니다.
16S 리보솜 RNA(rRNA) 유전자의 시퀀싱은 복잡한 마이크로바이옴 또는 연구하기 어려운 환경에서 세균을 식별하고 비교하는 무배양 방법입니다. 16S rRNA 시퀀싱을 위한 Illumina의 입증된 프로토콜은 실험에서 추측을 제거하는 데 도움이 될 수 있다. 멀티플렉싱(Multiplexing)을 사용하면 MiSeq 런당 최대 96개의 샘플을 시퀀싱할 수 있습니다.
NexteraXT 인덱스 키트를 사용하면 한 번의 시퀀싱 런에서 최대 384개의 고유하게 인덱싱된 샘플을 풀링하고 시퀀싱할 수 있습니다.
MiSeq 시스템에서 600주기 실행을 지원하는 클러스터링 및 시퀀싱 시약이 포함된 사전 충전된 즉시 사용 가능한 카트리지.
Illumina의 큐레이션을 거친 GreenGenes 분류 데이터베이스를 사용하여 16S rRNA 표적 앰플리콘 리드의 분류학적 분류를 수행합니다.
샘플당 예상 비용: 10.
*96개 샘플, 2 x 300 bp 리드 길이, Nextera XT 인덱스 프라이머, MiSeq Reagent v3 600사이클 키트를 기준으로 2016년에 계산한 MiSeq 시스템의 16S rRNA 시퀀싱 샘플당 예상 비용
MiSeq 시스템 셀프 서비스 소책자는 컴퓨터, 태블릿 및 스마트폰에서 액세스할 수 있는 클릭 가능한 기능이 포함된 대화형 가이드입니다. 실행 준비, 장비 유지보수, 문제 해결 등을 살펴보십시오. 동영상 보기: MiSeq 셀프 서비스 소책자 소개
모든 종에 대해 이용 가능한 참조 서열이 없는 새로운 유전체를 빠르고 정확하게 특성화할 수 있습니다.
microRNA와 같은 작은 RNA 종을 분리 및 시퀀싱하여, 유전자 침묵(silencing)과 전사후 조절(posttranscriptional regulation)에서 비코딩(noncoding) RNA의 역할을 연구할 수 있습니다.
바이오프로덕션 연구에 대한 품질 관리(QC) 애플리케이션을 수행하거나 본격적인 런에 커밋하기 전에 시퀀싱 라이브러리의 품질을 평가합니다.
표적 재시퀀싱(targeted resequencing)은 연구 관심 대상인 유전자의 부분집합 또는 유전체 영역만을 시퀀싱하는 데 시간과 비용 및 분석의 초점을 맞추고 있습니다.
유전자 발현 프로파일링 연구를 위해 관심 있는 특정 전사물을 선택하고 시퀀싱합니다.
MiSeq 시스템에서 가능한 기능 보기
캘리포니아 대학교 데이비스의 연구자들은 MiSeq 시스템을 사용하여 와인과 치즈의 미생물군유전체 프로파일과 그 제조 시설을 식별합니다.
덴마크 코펜하겐에 있는 Hvidovre University Hospital의 연구자들은 MiSeq 시스템을 사용하여 전 세계에서 약물 내성 박테리아 균주를 식별합니다.
표적 염기서열분석은 대사 및 신경학적 장애와 관련된 새로운 변이를 발견한다.