와인, 치즈, 그리고 그 맛에 영향을 미치는 마이크로바이옴
University of California에 있는 Davis의 연구자들은 MiSeq® System을 사용하여 와인과 치즈의 마이크로바이옴 프로파일과 마이크로바이옴이 만들어진 시설을 식별합니다.
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MiSeq System으로 표적 유전자 및 작은 유전체 시퀀싱을 포함한 광범위한 애플리케이션에 유연성과 간소함 제공
최고의 단순성과 놀라운 속도로 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)에 액세스
작은 전장 유전체 시퀀싱(Small Whole-Genome Sequencing)을 통해 공중 보건, 감염병 감시 시스템, 분자 역학 연구 및 환경 메타지노믹의 애플리케이션을 위해 미생물 또는 바이러스 유전체를 포괄적으로 분석할 수 있습니다. 이 접근법은 세균 배양 또는 노동 집약적 복제 단계를 필요로 하지 않습니다. MiSeq® System 시퀀싱 런(run)당 최대 24개의 작은 유전체를 시퀀싱해 보세요.
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
작은 유전체, PCR 앰플리콘 및 플라스미드에 최적화된 빠른 라이브러리 준비로, 최소 1 ng의 사용량과 15분의 수작업 시간 필요.
인간 전장 유전체, 앰플리콘, 플라스미드 및 미생물 유전체 시퀀싱을 포함한 광범위한 애플리케이션에 적합한 빠르고 통합된 워크플로우입니다.
MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle)
MiSeq® System에서 600사이클 런을 지원하는 클러스터링 및 시퀀싱 시약이 포함된 즉시 사용 가능한 사전 충전 카트리지.
MDA 단일세포에서 작은 유전체 및 차세대 시퀀싱 데이터에서 표준 세균 데이터 세트의 de novo 조립을 위한 오픈 소스 SW 도구.
미생물 유전체 조립을 위한 2개의 데이터 분석 파이프라인(Tell-Read 및 Tell-Link)입니다.
BaseSpace Sequence Hub에서 샘플 데이터 찾아보기(로그인 필요): MiSeq 작은 유전체 데이터
샘플당 예상 비용: $80*
*5 Mb 유전체, 50~100X 커버리지, 2 x 300 bp 리드 길이, Nextera XT Library Prep Kit, MiSeq Reagent v3 600사이클 키트를 기준으로 2016년에 계산한 MiSeq® System의 작은 전장 유전체 시퀀싱 샘플당 예상 비용.
표적 유전자 시퀀싱은 관심 유전자 또는 관심 유전체 영역만을 시퀀싱하는 데 시간과 비용 및 분석의 초점을 맞추고 있습니다. PCR 앰플리콘의 울트라 딥 표적 시퀀싱인 앰플리콘 시퀀싱을 사용하면 하나의 assay에서 최대 수백 개의 표적 유전체 영역을 비용 효율적으로 분석할 수 있습니다. 한 번의 MiSeq® System 시퀀싱 런에서 최대 96개 샘플과 1,536개 이상의 앰플리콘을 시퀀싱해 보세요.
한 번의 런에서 유전체 몇 개에서 수백 개에 이르는 표적을 사용하는 고도로 멀티플렉싱된 중합효소 연쇄 반응(PCR) 기반 워크플로우입니다.
맞춤형 시퀀싱 프로브를 설계, 주문하거나 맞춤형 유전형 분석 어레이 assay를 생성하는 데 도움이 되는 웹 기반 분석 설계 도구.
MiSeq Reagent Kit v2 (300-cycles)
MiSeq® System에서 300사이클 런을 지원하는 클러스터링 및 시퀀싱 시약이 포함된 즉시 사용 가능한 사전 충전 카트리지.
시퀀싱 런 생성, 런 상태 모니터링, 데이터 분석에 적합한 온프레미스 솔루션.
NGS 데이터 분석 및 관리 시 이용하는 Illumina의 유전체학 클라우드 컴퓨팅 환경.
16S 리보솜 RNA(rRNA) 유전자의 시퀀싱은 복잡한 마이크로바이옴 또는 연구하기 어려운 환경에서 세균을 식별하고 비교하는 무배양 방법입니다. 16S rRNA 시퀀싱을 위한 Illumina의 입증된 프로토콜은 실험에서 추측을 제거하는 데 도움이 될 수 있다. 멀티플렉싱(Multiplexing)을 사용하면 MiSeq 런당 최대 96개의 샘플을 시퀀싱할 수 있습니다.
한 번의 시퀀싱 런에서 최대 384개의 고유하게 인덱싱된 샘플을 풀링하고 시퀀싱하기 위한 인덱스.
16S Metagenomic Sequencing Protocol
16S rRNA 앰플리콘 시퀀싱에 MiSeq® System을 사용하는 포괄적인 워크플로우.
MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle)
MiSeq® System에서 600사이클 런을 지원하는 클러스터링 및 시퀀싱 시약이 포함된 즉시 사용 가능한 사전 충전 카트리지.
Illumina에서 큐레이션한 GreenGenes 분류 데이터베이스 버전을 사용하여 16S rRNA 표적 앰플리콘 리드에 대한 taxonomic 분류 수행.
샘플당 예상 비용: $10*
*96개 샘플, 2 x 300 bp 리드 길이, Nextera XT 인덱스 프라이머, MiSeq Reagent v3 600사이클 키트를 기준으로 2016년에 계산한 MiSeq® System의 16S rRNA 시퀀싱 샘플당 예상 비용
리소스 스포트라이트
MiSeq® System 셀프 서비스 소책자는 컴퓨터, 태블릿 및 스마트폰에서 접속할 수 있는 클릭 가능한 기능이 포함된 대화형 가이드입니다. 런 준비, 기기 유지 관리, 문제 해결 등을 살펴보세요. 비디오 보기: MiSeq 셀프 서비스 소책자 소개
모든 종에 대해 이용 가능한 참조 시퀀스 없이 새로운 유전체에 대한 빠르고 정확한 특성 규명을 가능하게 해 보세요.
마이크로 RNA와 같은 small RNA 종을 분리 및 시퀀싱하여, 유전자 침묵(silencing)과 전사후 조절(posttranscriptional regulation)에서 비코딩(noncoding) RNA의 역할을 연구해 보세요.
바이오프로덕션 연구에 대한 품질 관리(QC) 애플리케이션을 수행하거나 본격적인 런에 커밋하기 전에 시퀀싱 라이브러리의 품질을 평가해 보세요.
관심 유전자 또는 관심 유전체 영역만을 시퀀싱하는 데 시간과 비용 및 분석의 초점을 맞춰 보세요.
유전자 발현 프로파일링 연구를 위해 관심 있는 특정 전사물을 선택하고 시퀀싱해 보세요.
MiSeq® System의 가능성을 확인해 보세요
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덴마크 코펜하겐 Hvidovre University Hospital의 연구자들은 MiSeq® System을 사용하여 전 세계에서 약제 내성이 있는 세균 균주를 식별합니다.
표적 시퀀싱 통해 대사 및 신경학적 장애와 관련된 새로운 변이를 발견합니다.