MiSeq Reporter 내장 데이터 분석 소프트웨어
MiSeq Reporter 소프트웨어는 2차 데이터 분석을 수행하며 MiSeq 시퀀서에 사전 설치되어 있습니다. 실시간 분석 소프트웨어에 의해 실행되는 시퀀싱 중에 기기에서 생성된 기본 호출을 처리합니다.
실시간 분석이 완료되면 MiSeq Reporter가 자동으로 시작됩니다. 이는 각 유전체와 검체에 대한 정렬, 구조적 변이, 콘티그 어셈블리에 관한 정보를 생성한다. 샘플 시트에 지정된 워크플로를 기반으로 분석을 수행합니다.
MiSeq Reporter는 1차 및 2차 분석 데이터와 각 샘플에 대한 품질 및 적용 범위 정보를 간단하고 직관적인 그래픽 형식으로 제공합니다.
데이터를 분석하고 지원되는 워크플로를 탐색하는 방법을 알아보십시오.
데이터베이스: 인간의 경우 miRbase, 인간의 경우 dbSNP, 인간의 경우 refGene
게놈: 아라비돕시스 탈리아나, 소(Bos taurus ), 대장균 균주 DH10b, 인간(Homo sapiens ) 빌드 hg19, 마우스(Mus musculus ), 랫트(Rattus norvegicus ), 황색 포도구균 및 효모(Saccharomyces cerevisiae).
또한 귀하의 참조 유전체를 fasta 형식(*.fasta 또는 *.fa)으로 업로드할 수 있습니다.
MiSeq Reporter에 자신만의 관심 대상 참조 유전체(들)를 추가하는 방법을 알아보십시오.
MiSeq Reporter는 Windows 서비스로 실행되며 웹 브라우저를 통해 볼 수 있습니다. MiSeq 시스템이 후속 실행을 수행하는 동안 데이터를 분석하려면 별도의 컴퓨터에 다른 소프트웨어 사본을 설치할 수 있습니다.
추가 요건은 MiSeq Reporter Computing Requirements 지원 페이지를 참조하십시오.
MiSeq Reporter 최신 버전에 도입된 변경 사항을 확인하고 최신 버전을 다운로드하십시오. 또는 MiSeq Reporter 기술 지원 정보에 액세스하십시오.