NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
이러한 시약은 시퀀싱 데이터의 배경 노이즈를 줄여 무세포 DNA(cfDNA)에서 발견되는 것과 같은 저주파 변이를 검출할 수 있습니다.
TruSight Oncology UMI Reagents
차세대 시퀀싱 라이브러리에 대한 고유 분자 식별자(UMI)를 사용한 오류 수정.
1.5일
Assay 시간
5시간
수작업 시간
세포유리 DNA 30 ng
사용량
개요
오류율 감소
순환 종양 DNA(circulating tumor DNA, ctDNA)는 차세대 염기서열분석(next-generation sequencing, NGS)의 검출 한계에 가까운 매우 작은 cfDNA 분획을 나타낼 수 있다. TruSight Oncology UMI 시약은 UMI 및 오류 수정 소프트웨어로 이러한 문제를 해결하여 오류율을 < 0.007%로 줄이고 저주파 변이를 검출할 수 있게 합니다. 오류율이 낮을수록 분석 특이성이 증가하여 NGS 데이터에 대한 신뢰도가 높아집니다.
워크플로 통합
TruSight Oncology UMI 시약에는 UMI 어댑터 및 인덱스와 DNA 라이브러리 준비 및 농축 시약이 포함됩니다. 이러한 시약은 TruSight Tumor 170 DNA 올리고와도 페어링할 수 있습니다. UMI의 통합은 라이브러리 준비 워크플로우에 추가 단계를 생성하지 않습니다.
오류 수정을 위한 직관적인 소프트웨어
UMI 오류 수정 앱은 읽기를 정렬한 다음 UMI를 사용하여 위양성을 제외함으로써 변이 검출 오류를 줄입니다. UMI 오류 수정 앱은 클라우드 기반 BaseSpace Sequence Hub에서 또는 로컬 설치에 사용할 수 있습니다.
사양
| Assay 시간 | 1.5일 |
|---|---|
| 암 종류 | 전체 고형암 |
| 수작업 시간 | 5시간 |
| 사용량 | 세포유리 DNA 30 ng |
| 기기 | NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NovaSeq 6000 시스템 |
| 방법 | 표적 DNA 시퀀싱 |
| 핵산 종류 | DNA |
| 특수 샘플의 종류 | FFPE 호환 불가, 세포유리 DNA |
| 종 카테고리 | 인간 |
| 기술 | 시퀀싱 |
필수 제품
TruSight Oncology UMI 시약에는 증균 프로브가 포함되어 있지 않습니다. TruSight Tumor 170 DNA 프로브 세트를 사용하려면 TruSight Tumor 170 콘텐츠 세트를 별도로 구입하십시오.
편의를 위해 TruSight cfDNA 기구 번들에는 라이브러리를 생성하는 데 필요한 모든 시약과 선택된 기구의 무세포 DNA(cfDNA) 라이브러리에 대한 권장 시퀀싱 깊이에서 48개의 샘플을 시퀀싱하는 데 필요한 모든 시약이 포함되어 있습니다.
/
건
애플리케이션
예시 워크플로우
준비
TruSight Oncology UMI Reagents
분석
로컬 UMI 오류 수정 앱
현지 UMI 오류 정정 앱에 액세스하려면 현지 Illumina 지원팀에 문의하십시오.
* NovaSeq 6000 시스템의 성능은 입증되었지만 광범위하게 테스트되지는 않았습니다.
관련 애플리케이션 및 방법
Illumina의 임상 암 연구 솔루션은 정확한 유전체 정보를 제공하고 검사실에서 단일 검사를 통해 여러 유전자를 분석할 수 있습니다.
표적 재시퀀싱을 통해 유전자 또는 유전체 영역의 부분집합을 분리하고 시퀀스를 분석하며, 이를 통해 검사실의 리소스를 절약할 수 있습니다.
NGS 기반 암 시퀀싱 방법은 단일 유전자 및 어레이 기반 접근법에 비해 더 짧은 시간에 더 많은 정보를 제공합니다.
문서
제품 관련 자료
그림 자료
배경 감소로 정확한 변이 검출 용이
희귀 변이를 정확하게 검출할 수 있도록 UMI는 오류 수정 소프트웨어와 통합되어 실제 돌연변이를 배경 소음과 구별할 수 있습니다. 하단 패널은 위양성을 초래하는 내재적 오류를 제거함으로써, 감소된 오류율을 통해 실제 돌연변이(빨간색 점)가 배경 노이즈(회색 점)와 더 잘 구별될 수 있는 방법을 보여준다.
UMI로 오류율 감소
라이브러리 준비는 TruSight 종양 170 DNA 분석의 DNA 함량과 쌍을 이룬 TruSight Oncology UMI 시약을 사용하여 수행하였다. HiSeq 4000 시스템에서 4개의 독립적인 시퀀싱 실행 사이에 31개의 샘플을 분배하였다. 평균 오류율은 UMI 오류 정정 앱을 사용하여 축소된 판독과 함께 그리고 축소되지 않고 표시됩니다.
| 시퀀싱 실행 | 평균 오류율(미접힘 판독값) | 평균 오류율(접힌 판독값) |
|---|---|---|
| 1 | 0.038% | 0.0023% |
| 2 | 0.043% | 0.0024% |
| 3 | 0.035% | 0.0024% |
| 4 | 0.084% | 0.0019% |
TruSight Oncology UMI Reagents (16 indexes, 48 samples)
20024586
TruSight 종양학 DNA 라이브러리 준비 및 농축 시약과 TruSight UMI 툴킷이 포함되어 있습니다. 16개의 고유 인덱스 쌍으로 48개의 UMI 포함 라이브러리를 생성하기에 충분한 시약을 제공합니다. 오류율이 감소된 라이브러리를 생성하여 저주파수 변종을 감지할 수 있습니다. 증균 프로브가 들어 있지 않습니다. TST170 내용물은 별도로 구매할 수 있습니다.
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TruSight® Tumor 170 Content Set
20010188
TST170 키트 내 170개 유전자에 대한 DNA 및 RNA 프로브.
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요약
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카탈로그 ID
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MiSeq 시약 키트 v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.
TruSight Oncology 500
모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전암(pan-cancer) 패널을 통해 CGP를 지원합니다.
Illumina DNA Prep
다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.
TruSight Oncology 500
모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전암(pan-cancer) 패널을 통해 CGP를 지원합니다.
TruSight Tumor 170
고형암과 관련된 170개의 유전자를 표적으로 하는 포괄적인 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) assay.
BaseSpace Sequence Hub | 런 관리 및 간소화된 바이오인포매틱스
안전하고 성능이 우수한 시퀀싱 운영을 위한 사용하기 쉬운 클라우드 기반 유전체 런 관리 및 바이오인포매틱스 컴퓨팅 및 스토리지 환경.
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