인간 유전체 프로젝트가 완료된 이후 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 비용은 무어의 법칙을 능가하며 급격한 속도로 감소했습니다. 지속적인 혁신을 통해 Illumina는 NGS 비용을 절감하여 $1000의 인간 유전체가 가능해졌습니다.
차세대 시퀀싱 비용이 계속 감소됨에 따라, Illumina는 NGS를 더욱 비용 효율적이고 접근 가능하게 만들기 위해 압장서고 있습니다. Illumina는 모든 규모의 검사실이 이 강력한 기술의 잠재력을 활용할 수 있도록 도우려고 노력합니다. 이러한 자료를 토내로, Illumina는 NGS 예산 계획 시 고려할 주요 요인들을 안내해 드립니다.
NGS 비용을 평가할 때는 연구의 샘플량을 고려해야 합니다. 일반적으로 몇 개의 샘플에서 단지 몇 가지(< 20개) 표적만 분석하는 경우 생어 시퀀싱 또는 qPCR과 같은 전통적인 방법이 유용할 수 있습니다. 20개 이상의 표적 영역을 시퀀싱하거나 많은 양의 샘플을 시퀀싱하려면 NGS가 바람직합니다.
NGS는 또한 새롭거나 희귀한 변이를 검출할 수 있는 더 뛰어난 발견 역량과 민감도를 제공합니다. 또한 시퀀스 정보에 대한 사전 지식이 필요하지 않은 접근법, 즉 가설이 필요 없는 접근법을 제공합니다. 이러한 인사이트는 발견을 가능하게 하고 연구 논문을 장려하는 데 매우 중요할 수 있습니다.
다음 사항에 대해 더 알아보세요.
NGS와 qPCR의 비교
NGS와 생어 시퀀싱의 비교
NGS와 마이크로어레이의 비교
NGS 비용을 추정할 때 다음 요소를 고려하세요.
또한 다음과 같은 추가 검사실 장비를 고려합니다.
애플리케이션 | 샘플당 예상 비용 | 실험 파라미터 |
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표적 유전자 발현 프로파일링 | 미화 $23 | 샘플당 비용 계산은 다음을 사용한 런을 기준으로 합니다.
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16S 메타지노믹 시퀀싱 | 미화 $18 | 샘플당 비용 계산은 다음을 사용한 런을 기준으로 합니다.
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간소한 설계로 된 iSeq 100 시퀀싱 시스템은 차세대 시퀀싱을 그 어느 때보다 간편하게 합리적인 가격으로 수행할 수 있게 해줍니다. 낮은 비용으로, 더 많은 발견을 이끌어 내세요.
시스템 보기NGS 데이터 보관 및 분석 비용은 초보자가 가장 많이 묻는 질문 중 하나입니다. 데이터 분석 예산에는 다음의 세 요소가 영향을 미칩니다.
컴퓨팅 비용은 분석하는 시퀀싱 데이터의 양에 따라 달라질 수 있습니다. 연구를 위한 NGS 데이터 분석 비용을 계산하는 데 도움이 되도록 일반적인 방법에 대해 생성된 데이터 양을 추정했습니다.
애플리케이션 | 예상 데이터 출력 |
---|---|
인간 전장 유전체 시퀀싱(30배 커버리지일 때) | 약 120 Gb |
인간 엑솜 시퀀싱(100배 커버리지일 때) | 약 8 Gb |
미생물 전장 유전체 시퀀싱 | 약 300 Mb |
16S rRNA 시퀀싱 | 약 60 Mb |
1메가베이스(Mb) = 1M 개 염기
1기가베이스(Gb) = 1B 개 염기
생성된 데이터의 양은 실험의 시퀀싱 커버리지 수준과 관련이 있습니다.
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