차세대 시퀀싱 비용

발견의 가격 재정의

발견의 가격 재정의

인간 유전체 프로젝트가 완료된 이후 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 비용은 무어의 법칙을 능가하며 급격한 속도로 감소했습니다. 지속적인 혁신을 통해 Illumina는 NGS 비용을 절감하여 $1000의 인간 유전체가 가능해졌습니다.

차세대 시퀀싱 비용이 계속 감소됨에 따라, Illumina는 NGS를 더욱 비용 효율적이고 접근 가능하게 만들기 위해 압장서고 있습니다. Illumina는 모든 규모의 검사실이 이 강력한 기술의 잠재력을 활용할 수 있도록 도우려고 노력합니다. 이러한 자료를 토내로, Illumina는 NGS 예산 계획 시 고려할 주요 요인들을 안내해 드립니다.

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차세대 시퀀싱 비용 비교

NGS 비용을 평가할 때는 연구의 샘플량을 고려해야 합니다. 일반적으로 몇 개의 샘플에서 단지 몇 가지(< 20개) 표적만 분석하는 경우 생어 시퀀싱 또는 qPCR과 같은 전통적인 방법이 유용할 수 있습니다. 20개 이상의 표적 영역을 시퀀싱하거나 많은 양의 샘플을 시퀀싱하려면 NGS가 바람직합니다.

NGS는 또한 새롭거나 희귀한 변이를 검출할 수 있는 더 뛰어난 발견 역량과 민감도를 제공합니다. 또한 시퀀스 정보에 대한 사전 지식이 필요하지 않은 접근법, 즉 가설이 필요 없는 접근법을 제공합니다. 이러한 인사이트는 발견을 가능하게 하고 연구 논문을 장려하는 데 매우 중요할 수 있습니다.

다음 사항에 대해 더 알아보세요.
NGS와 qPCR의 비교
NGS와 생어 시퀀싱의 비교
NGS와 마이크로어레이의 비교

차세대 시퀀싱 비용의 고려 사항

NGS 비용을 추정할 때 다음 요소를 고려하세요.

  • 기기 구매
  • 샘플당 비용(예: DNA 분리, 라이브러리 준비, 시퀀싱 시약)
  • 데이터 분석 및 보관
  • 기기 지원 계획(선택 사항)
  • 교육 및 예방 유지 관리(선택 사항)

또한 다음과 같은 추가 검사실 장비를 고려합니다.

  • 핵산 정량화 기기
  • 핵산 품질 분석기
  • 유전자증폭기
  • 초음파분쇄기(일부 라이브러리 준비 방법에 사용됨)
  • 원심분리
  • 일반 검사실 용품(예: 피펫터, 96웰 플레이트, 원심분리 튜브)
Buyer's Guide to NGS Systems

차세대 시퀀싱 비용을 추정하고 검사실에 적합한 기기를 선택하는 데 도움이 되는 팁을 찾아보세요.

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NGS 비용 상담

차세대 시퀀싱을 예산에 맞추는 방법에 대해 질문이 있습니까? Illumina 담당자에게 문의해 보세요.

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샘플당 NGS 비용 예시

애플리케이션 샘플당 예상 비용 실험 파라미터
표적 유전자 발현 프로파일링 미화 $23

샘플당 비용 계산은 다음을 사용한 런을 기준으로 합니다.

  • MiniSeq 시스템
  • 65개 표적
  • 1,000배 커버리지
  • 1 × 150 bp의 리드 길이
  • TruSeq 표적 RNA 발현 커스텀 패널 키트
  • MiniSeq Reagent High Output 75사이클 키트
16S 메타지노믹 시퀀싱 미화 $18

샘플당 비용 계산은 다음을 사용한 런을 기준으로 합니다.

  • MiSeq 시스템
  • 96개 샘플
  • 2 × 300 bp의 리드 길이
  • Nextera XT 인덱스 프라이머
  • MiSeq Reagent v3 600사이클 키트
저비용 NGS 기기

간소한 설계로 된 iSeq 100 시퀀싱 시스템은 차세대 시퀀싱을 그 어느 때보다 간편하게 합리적인 가격으로 수행할 수 있게 해줍니다. 낮은 비용으로, 더 많은 발견을 이끌어 내세요.

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저비용 NGS 기기

NGS 데이터 분석 비용

NGS 데이터 보관 및 분석 비용은 초보자가 가장 많이 묻는 질문 중 하나입니다. 데이터 분석 예산에는 다음의 세 요소가 영향을 미칩니다.

  • 데이터 분석 소프트웨어 플랫폼 라이선싱
  • 데이터 보관(흔히 라이선싱 비용에 포함됨)
  • 데이터 분석 앱 실행(컴퓨팅 비용이라고도 함)

컴퓨팅 비용은 분석하는 시퀀싱 데이터의 양에 따라 달라질 수 있습니다. 연구를 위한 NGS 데이터 분석 비용을 계산하는 데 도움이 되도록 일반적인 방법에 대해 생성된 데이터 양을 추정했습니다.

일반 NGS 애플리케이션을 위한 데이터 출력
애플리케이션 예상 데이터 출력
인간 전장 유전체 시퀀싱(30배 커버리지일 때) 약 120 Gb
인간 엑솜 시퀀싱(100배 커버리지일 때) 약 8 Gb
미생물 전장 유전체 시퀀싱 약 300 Mb
16S rRNA 시퀀싱 약 60 Mb

1메가베이스(Mb) = 1M 개 염기
1기가베이스(Gb) = 1B 개 염기

생성된 데이터의 양은 실험의 시퀀싱 커버리지 수준과 관련이 있습니다.

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NGS 실험 디자인

첫 번째 시퀀싱 런에 필요한 리드 길이, 시퀀싱 커버리니 등 모든 것에 대해 알아보세요.

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NGS 비용 관련 FAQ

시퀀서를 위한 검사실 공간을 따로 마련할 때 공간이 과도한 진동이나 온도 변동으로부터 보호되는지 확인하시기 바랍니다. 검사실에 pre-PCR 및 post-PCR 영역이 없는 경우 NGS 실험에서 PCR 오염을 방지하기 위해 두 개의 별도 공간 또는 별도의 실험실 벤치를 설치하는 것을 고려해 보세요.
교육 및 설치 서비스는 옵션이지만 전문 검사실 직원은 기기 유지 관리에 필수가 아닙니다. Illumina의 가장 저렴한 시퀀서인 iSeq 100 시스템은 자체 설치가 간단하도록 설계되었습니다. Illumina의 기기는 품질 관리 기능이 내장되어 있으며 시스템 검사 실행을 안내할 수 있습니다. Illumina는 또한 포괄적인 서비스 계획을 제공하며, Illumina의 과학자와 엔지니어가 추가 지원을 제공하고 질문에 답변할 수 있습니다.

iSeq 100 시스템용으로 설계된 이 보조금 작성 지원 문서는 보조금 신청 시 자금 지원을 정당화하는 데 도움이 될 수 있습니다.
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멀티플렉스 시퀀싱을 사용하면 여러 라이브러리를 함께 풀링하고 동시에 시퀀싱할 수 있습니다. 멀티플렉싱은 비용이나 시간을 크게 늘리지 않고 한 번의 런으로 분석되는 샘플 수를 기하급수적으로 늘립니다.
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NGS를 시작하는 데 도움이 되는 장비 보상 판매 프로그램, 임대 옵션 및 번들이 있습니다. 다양한 구매 옵션을 탐색하여 자신의 필요에 가장 적합한 것을 찾아보세요.
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BaseSpace 또는 DRAGEN Cloud 앱 실행에 관심이 있는 경우 BaseSpace Sequence Hub 구독과 데이터 보관 및 분석을 위한 iCredit가 필요합니다. iCredit에 대해 자세히 알아보고 인간 전장 유전체 시퀀싱, 엑솜 시퀀싱 및 16S 메타지노믹을 포함한 다양한 애플리케이션의 데이터 분석 비용 추정 관련 지침은 "Predicting Analysis Costs" 표를 참조하시기 바랍니다.