NGS 워크플로우 단계

NGS 워크플로우 준비하기

차세대 시퀀싱 워크플로우는 핵산 분리 후 라이브러리 준비로 시작합니다. 다양한 어플리케이션과 처리량을 지원하도록 설계된 Illumina 시퀀싱 시스템에서 라이브러리의 데이터가 생성됩니다. 그 다음으로, 생성된 데이터를 분석하여 인사이트를 얻습니다.

각 단계의 기본사항에 대해 알아보고 귀하의 NGS 워크플로우를 계획해 보세요.

1단계: 핵산 추출

NGS 실험을 위한 워크플로우의 시작은 유전 물질을 분리하는 것으로부터 시작됩니다. 벌크 조직, 개별 세포 또는 생체액과 같은 샘플에서 핵산을 분리합니다. 추출 후, 대부분의 NGS 워크플로우에는 QC 단계가 필요합니다. Illumina는 순도 평가를 위한 UV 분광측광법 및 핵산 정량을 위한 형광분석 방법 사용을 권장합니다.

2단계: 라이브러리 준비

라이브러리 제작은 유전체 DNA 샘플(또는 cDNA 샘플)을 NGS 기기에서 시퀀싱될 수 있는 절편 라이브러리로 변환하는 작업입니다.

라이브러리 준비에 대해 더 알아보기

3단계: 시퀀싱

뉴클레오타이드는 특정 사용 사례에 권장되는 리드 길이(read length)(시퀀서에서 리드되는 DNA 절편의 길이)와 뎁스(샘플당 얻은 "리드" 수)로 Illumina 시퀀서에서 판독됩니다.

Illumina는 DNA 가닥에 단일 염기를 합성하며 base를 판독하는 입증된 SBS(sequencing by synthesis) 화학 반응을 사용합니다. 다양한 처리량과 어플리케이션을 지원하는 여러 시퀀싱 플랫폼에 적용된 버튼형 워크플로우를 통해, 더 빠르게 연구에대한 답을 얻을 수 있습니다.

더 자세히 알아보려면 아래 리소스를 살펴보세요

SBS 기술 소개

대규모 병렬형 시퀀싱을 가능하게 하는 Illumina 차세대 시퀀싱 기술에 대해 알아보세요.

XLEAP-SBS chemistry

NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 System은 현재까지 출시된 기기 중 가장 빠르고, 품질이 우수하며, 가장 강력한 sequencing by synthesis(SBS) chemistry인 XLEAP-SBS chemistry를 기반으로 합니다.

벤치탑 시퀀서

벤치탑 시퀀서를 비교하여 연구 목표에 가장 적합한 플랫폼이 무엇인지 알아보세요.

4단계: 데이터 분석 및 해석

바이오인포매틱스 도구는 Illumina 시퀀서에서 나오는 일련의 A, T, G, C 또는 리드를 이해하는 데 사용됩니다.

NGS 분석은 이제 매우 쉽게 접근할 수 있습니다. 일부 기기는 사용자 편의성이 강화된 온보드 데이터 분석 기능이 내장되어 있어, 바이오인포매틱스 배경 지식이 없거나 검사실 직원을 추가로 고용할 예산이 없는 신규 사용자도 쉽게 사용할 수 있습니다. Illumina 연결 소프트웨어 포트폴리오는 영향력 있는 연구를 추진할 수 있는 다목적성, 무결성, 그리고 접근성 높은 데이터 분석 솔루션을 제공합니다.

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주요 워크플로우: RNA 시퀀싱

RNA 분리

샘플의 종류에 따라 RNA 분리 키트를 위한 여러 제3자 옵션이 있습니다.

시퀀싱

MiSeq® System

작은 패널용: 표적 재시퀀싱, 메타지노믹스, 작은 유전체 시퀀싱, 표적 유전자 발현 프로파일링 등.

NextSeq 1000 및 2000 시스템

대형 패널용: 표적 시퀀싱, RNA-Seq, 단일세포 방법, 엑솜 시퀀싱 등.

Partek

추가 리소스

NGS 튜토리얼

비디오, 온라인 교육, 그리고 기술 게시판을 통하여, 라이브러리 준비, 시퀀싱, 데이터 분석과 관련된 요령 및 모범 사례에 대한 Illumina의 NGS 튜토리얼을 살펴보세요.

NGS 애플리케이션

연구의 초점이 무엇이든, NGS는 다양한 샘플의 종류에 대해 공개된 광범위한 방법을 사용하여 다양한 생물학적 질문에 대한 해답을 찾는 데 중요한 역할을 할 수 있습니다.

NGS 사용에 대해 질문이 있으신가요?

특정 연구 분야에 대한 NGS에 대해 궁금한 점이 있으시면 언제든지 도와드리겠습니다. 전문가가 모든 질문에 답변해 드리고 설정에 가장 적합한 솔루션을 추천해 드릴 수 있습니다.

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