TruSight Tumor 15

간단하고 빠른 워크플로우로 고형 종양에서 일반적으로 돌연변이되는 15개 유전자를 평가하는 데 초점을 맞춘 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 패널입니다.

7시간

Assay 시간

3.5시간

수작업 시간

20 ng FFPE DNA 

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

TruSight Tumor 15는 고형 종양에서 흔히 돌연변이된 15개의 유전자를 평가하는 NGS 분석입니다. 

  • 단일 assay에서 15개의 유전자에 대한 정확하고 경제적이며 신속한 평가 1 

  • FFPE 조직에서 20 ng DNA를 사용하여 5% 대립유전자 빈도로 체세포 변이체 검출1

  • 최소한의 생물정보학 자원을 필요로 하는 해석하기 쉬운 보고서 

  • 기존 실험실 관행에 완벽하게 통합 

관련 유전자 함량

함량은 산업 단체가 인용하고 독립 컨소시엄 출판물 및 후기 제약 연구에 의해 알려진 유전자 및 유전자 영역을 포함하도록 신중하게 선택됩니다. 함량에는 단일 염기서열 변이(single nucleotide variants, SNV) 및 고형 종양에 관여하는 것으로 입증된 삽입/결실을 포함됩니다.

포괄적인 워크플로우

TruSight Tumor 15는 단일 반복 유전자 검사를 중합효소 연쇄 반응(polymerase chain reaction, PCR)으로 대체하는 간단하고 신속한 워크플로우에서 15개의 유전자를 평가합니다. 기기 내 보고 소프트웨어 또는 TruSight Tumor 15 BaseSpace Sequence Hub 앱으로 데이터를 분석합니다.  

가속 종양 프로파일링

3.5시간의 수작업 시간으로 최대 36시간 내에 DNA에서 데이터가 됩니다. 제한된 검체와 자원을 보존하기 위해 여러 종양 유형에서 검체 성공률을 극대화합니다. 


사양


필수 제품

TruSight Tumor 15 MiSeq 또는 MiniSeq Kit를 구매하거나 TruSight Tumor 15 라이브러리 준비만 구입해야 합니다. 모든 제품은 24개의 샘플에 충분합니다. TruSight 종양 15 라이브러리 준비만 구입하기로 선택하는 경우, 또한 귀하의 시스템에 대한 시퀀싱 시약을 별도로 구입해야 합니다. 

TruSight Tumor 15 MiSeq Kit에는 MiSeq 소프트웨어 v2.6 이상 및 Illumina 주석 엔진이 필요합니다. 파일 다운로드

/ 결과

애플리케이션

TruSight Tumor 15는 단일 분석에서 고형 종양과 흔히 연관된 15개 유전자의 체세포 변이를 평가하는 포괄적인 워크플로 솔루션으로, 실험실이 NGS의 힘을 사용하여 종양형성에 역할을 할 가능성이 가장 높은 유전자에 초점을 맞추고 FFPE DNA의 저주파 변이를 자신 있게 분석할 수 있도록 합니다. 

예시 워크플로우


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System

Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 93.5% of the bases covered at 500x minimum)

2 × 150 bp(최대 권장)

MiSeq System

8 samples per run with v3 reagents (based on 93.5% of the bases covered at 500x minimum)

2 × 151 bp(최대 권장)


관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

TruSight Tumor 15
Assay 시간 7시간
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
Cancer type Pan-cancer, Solid tumor
콘텐츠 사양 고형 종양과 관련된 15개의 유전자로부터 250개의 앰플리콘을 증폭
설명 20 ng DNA를 사용하여 고형암에서 흔히 돌연변이된 15개 유전자에 대한 NGS 분석. 
수작업 시간 3.5시간
사용량 20 ng FFPE DNA 
Instruments MiSeq System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System
방법 Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing
멀티플렉싱 1~24플렉스
Nucleic acid type DNA
특수 샘플의 종류 FFPE tissue
Species category Human
Technology Sequencing
변이 클래스 Somatic variants, Insertions-deletions (indels)

선택 도구:

그림 자료

TruSight Tumor 15 chemistry

TruSight Tumor 15 assay는 멀티플렉스 PCR 접근법을 사용하여 높은 정확도와 민감도를 제공합니다.

TruSight 종양 15 유전자 목록
AKT1 GNA11 NRAS
BRAF GNAQ PDGFRA
EGFR KIT PIK3CA
ERBB2 KRAS RET
FOXL2 MET TP53

TruSight Tumor 15 MiSeq Kit

OP-101-1001

1개의 라이브러리 준비 키트와 24개의 샘플에 충분한 3개의 MiSeq 시약이 포함되어 있습니다.

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TruSight Tumor 15 (Library Prep Only)

OP-101-1002

24개의 샘플에 충분한 1개의 라이브러리 준비 키트 포함.

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TruSight Tumor 15 MiniSeq Kit

20005610

1개의 라이브러리 준비 키트와 24개의 샘플에 충분한 3개의 MiniSeq 시약이 포함되어 있습니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

Unit Price

FAQ

TruSight Tumor 15는 MiniSeq System 및 MiSeq System(v3 chemistry)과 MiSeqDx 기기(연구 모드, v3 chemistry)에서 지원됩니다. 다른 Illumina 시스템에서의 시퀀싱은 가능하지만 테스트되지 않았습니다.

TruSight Tumor 15 키트와 함께 사용할 것을 권장하는 열 순환기는 다음과 같습니다. TruSight Tumor 15 참조 가이드에 나와 있는 권장 램프 속도 설정을 따르세요.

  • Bio-Rad C1000

  • Bio-Rad S1000 

  • Applied Biosystems GeneAmp PCR 시스템 9700

  • Applied Biosystems Veriti 열 순환기 

  • Eppendorf Mastercycler ep Gradient

  • 에펜도르프 마스터사이클러 에프 그레이디언트-에스 

  • Bio-Rad C1000, Applied Biosystems GeneAmp PCR System 9700 및 Eppendorf MasterCycler ep Gradient는 내부적으로 검증됨

TruSight Tumor 15는 MiniSeq, MiSeq 및 MiSeq Dx(v3 chemistry) 시스템에서 앰플리콘 시퀀싱 및 표적 DNA 시퀀싱을 사용하여 고형암에서 일반적으로 돌연변이되는 15개의 유전자를 표적으로 합니다. TruSight Tumor 170은 NextSeq 500 및 NextSeq 550 시스템에서 표적 농축과 표적 DNA 및 RNA 염기서열분석을 사용하여 170개의 유전자를 표적으로 합니다. 

예, 샘플 실행샘플 프로젝트 를 볼 수 있습니다.  이 데이터에 액세스하려면 BaseSpace Sequence Hub 로그인이 필요합니다.

/ 결과

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

참고 문헌

1. Data calculations on file. 일루미나 2016년.

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