NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
Urinary Pathogen ID/AMR Panel(UPIP)은 요로 감염(UTI) 및 동시 감염을 담당하는 170개 이상의 요로병원균을 검출하고 정량화할 수 있는 차세대 염기서열분석(NGS) 연구 패널로, 항균 내성(AMR)과 관련된 3700개 이상의 표지자와 그 대립유전자를 포함합니다.
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit
일반 및 미인식 요로병원균과 AMR 유전자의 민감하고 배양이 필요 없는 검출 및 분석을 가능하게 하는 라이브러리 준비 및 인리치먼트 키트입니다.
< 9시간 라이브러리 준비 및 증균 시간
Assay 시간
< 2시간 라이브러리 준비 및 증균 시간
수작업 시간
용량 기준(농도 의존적 아님)
사용량
개요
주요 기능
간소화된 워크플로우
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit에는 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation)을 위한 모든 라이브러리 준비 및 농축 시약, 인덱스 및 패널 프로브가 포함되어 있으며, 그 다음 농축 라이브러리를 생성하기 위한 단일 혼성화 단계가 이어집니다. 증균 키트를 DNA 추출, 시퀀싱 및 Explify UPIP 데이터 분석과 통합하면 UTI의 검출 및 식별을 위한 포괄적이고 간단한 워크플로우가 가능합니다.
사양
| Assay 시간 | < 9시간 라이브러리 준비 및 증균 시간 |
|---|---|
| 자동화 기능 | Liquid handling robots |
| Analytical sensitivity | 120개 이상의 세균, 14개 진균, 35개 바이러스, 27개 성병 병원체를 포함한 4개 기생충, > 3700개의 항균제 내성 표지자 검출 |
| 설명 | 다양한 샘플 유형에서 비뇨기 병원균 및 항균 내성 표지자의 검출 및 식별을 위해 DNA 추출, Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit를 사용한 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 Explify UPIP 데이터 분석을 통합하는 간소화된 워크플로우. |
| 수작업 시간 | < 2시간 라이브러리 준비 및 증균 시간 |
| 사용량 | 용량 기준(농도 의존적 아님) |
| Instruments | MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode |
| 작용 기전 | 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 |
| 방법 | Targeted DNA sequencing, Target enrichment |
| 멀티플렉싱 | 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 |
| Nucleic acid type | DNA |
| Analytical sensitivity | 인간 소변 임상시험 샘플 및 폐수와 같은 기타 감시 관련 샘플에서 추출한 DNA |
| 특수 샘플의 종류 | Not FFPE-compatible |
| Species category | Other, Human, Virus, Bacteria |
| 종 세부 사항 | 진균, 기생충 |
| Technology | Sequencing |
필수 제품
액세서리가 필요하지 않습니다.
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결과
애플리케이션
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit는 임상 비뇨기 연구, 환경 및 기타 샘플 유형을 포함한 다양한 샘플 유형에서 170개 이상의 비뇨기 병원체와 3,700개 이상의 항균제 내성 표지자 및 그 대립유전자를 검출하고 식별하는 데 사용됩니다.
주요 워크플로
준비
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit
프로젝트 권장 사항
관련 애플리케이션 및 방법
As a hypothesis-free method, NGS can distinguish between infectious disease strains that differ by as little as one SNP, and replace multiple tests.
표적 인리치먼트는 하이브리드화(Hybridization)를 통해 관심 유전체 영역을 캡처하는 작업입니다. 표적 인리치먼트란 무엇이며, 여러 개의 샘플을 한꺼번에 연구하는 데 어떻게 활용할 수 있는지에 대해 알아보세요.
Comprehensively sample all genes in all organisms present in a given complex sample to evaluate bacterial diversity and detect unculturable microorganisms.
비교하기
선택 도구:
Library Prep and Array Kit Selector
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그림 자료
비뇨기 병원체 ID/AMR 패널에서 다루는 미생물
비뇨기 병원체 ID/AMR 패널 키트는 흔하고 덜 흔한 요로 병원체와 27개의 성병 병원체를 포함한 174개의 유기체를 검출하고 정량화할 수 있다.
민감한 병원체 검출
Urinary Pathogen ID/AMR Panel(UPIP) 키트는 샷건 메타지노믹스(SM) 및 배양 방법보다 더 민감한 병원체 식별을 제공합니다. UPIP에 의해 소변 검체 342/399개(86%), SM에 의해 검체 262/399개(66%), 소변 배양에 의해 검체 205/399개(51%)에서 하나 이상의 요로병원균이 검출되었다.
분석 민감도 향상
UPIP로 측정한 세균 부하는 SM 음성 검체에서보다 SM 양성에서 더 높았으며(p < 0.0001), 이는 SM과 비교해 표적 농축 시퀀싱의 개선된 분석 민감도 예측과 일치한다. SM 음성 샘플에서 박테리아 검출은 샷건 메타지노믹스와 비교하여 향상된 증균 감도를 추가로 입증합니다.
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set A (RUO) (96 indexes,96 samples)
20090308
96개의 샘플에서 라이브러리를 준비한 후 32개의 3-플렉스 농축 반응을 준비하기 위한 태그멘테이션 및 PCR 시약, Illumina DNA/RNA UD 인덱스 세트 A용 IDT, 요 병원체 ID/AMR 패널을 포함하여 라이브러리 준비 및 농축에 필요한 모든 시약이 포함됩니다.
List Price:
Discounts:
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set B (RUO) (96 indexes, 96 samples)
20090309
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit(UPIP)에는 3,500개의 항미생물 내성(AMR) 표지자, 121개의 세균, 14개의 진균, 35개의 바이러스 및 4개의 기생충을 표적으로 하는 데 사용되는 모든 라이브러리 준비 시약, 인덱스 및 패널이 포함되어 있습니다. UPIP 증균 패널은 Illumina DNA 준비와 Enrichment 키트 및 분석과 BaseSpace Sequence Hub의 UPIP Explify 앱과 결합하여 광범위한 소변 병원체 검출 및 AMR 프로파일링을 가능하게 하여 혼합된 동시 감염을 식별할 수 있습니다. 키트에는 라이브러리 준비 시약, 인덱스(세트 B) 및 패널이 포함되어 있어 3-플렉스에서 96개의 샘플을 준비하고 UPIP Explify 앱을 사용하여 분석합니다.
List Price:
Discounts:
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set C (RUO) (96 indexes, 96 samples)
20090310
96개의 샘플에서 라이브러리를 준비한 후 32개의 3-플렉스 농축 반응을 준비하기 위한 태그멘테이션 및 PCR 시약, Illumina DNA/RNA UD 인덱스 세트 C용 IDT, 요 병원체 ID/AMR 패널을 포함하여 라이브러리 준비 및 농축에 필요한 모든 시약이 포함됩니다.
List Price:
Discounts:
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set D (RUO) (96 indexes, 96 samples)
20090311
96개의 샘플에서 라이브러리를 준비한 후 32개의 3-플렉스 농축 반응을 준비하기 위해 태그멘테이션 및 PCR 시약, Illumina DNA/RNA UD 인덱스 세트 D용 IDT, 요 병원체 ID/AMR 패널을 포함한 라이브러리 준비 및 농축에 필요한 모든 시약이 포함됩니다.
List Price:
Discounts:
표시 /
선택 품목 요약
제품
수량
Unit Price
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요약
제품
카탈로그 ID
수량
단가
-
카탈로그 ID:수량:
FAQ
아니요, DNA 추출 전에 샘플을 배양할 필요는 없습니다. Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit에는 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation)을 위한 모든 라이브러리 준비 및 농축 시약, 인덱스 및 패널 프로브가 포함되어 있으며, 그 다음 단일 혼성화 단계를 통해 시퀀싱을 위한 풍부한 라이브러리를 생성할 수 있는 신속한 워크플로우를 제공합니다.
스핀 컬럼 키트는 가장 신뢰할 수 있고 차세대 시퀀싱(NGS)에 흔히 사용되므로 DNA를 분리하는 것이 좋습니다. 비뇨기 병원체 ID/AMR 농축 키트에 대한 DNA 추출 프로토콜은 여기에서 확인할 수 있습니다.
라이브러리 준비 및 시퀀싱 단계는 병원체 유형에 관계없이 벤치탑 시퀀싱 시스템에서 2일 내에 완료될 수 있습니다. 그러나, 시퀀싱 과정 중에 MiniSeq 시퀀싱 시스템 및 MiniSeq 신속 시약 키트를 사용할 때 < 24시간 내에 검출을 완료할 수 있습니다.
이 키트의 패널에는 10가지 다른 상용 대조군을 인식하는 프로브가 포함되어 있습니다. 그러나 이러한 대조군은 이 키트의 일부로 제공되지 않으며, 별도로 구매한 후 DNA 및 RNA 추출 전에 샘플에 스파이크인해야 합니다. 각 실험/샘플에 대해 하나의 스파이크인 대조군만 필요합니다.
당사는 일반적으로 최소 1 × 100 bp 또는 2 × 100 bp 시퀀싱 화학물질을 사용하여 샘플당 1M 싱글 리드 또는 2M 페어드 엔드 리드로 시작하는 것을 권장합니다. 이러한 수치는 시작점에 불과하며 샘플 유형과 표적 존재비를 기준으로 최적화되어야 합니다.
예. 이 패널에서 다루는 표적이 실험 목표와 일치하는 경우, 다양한 샘플 유형에서 추출한 DNA를 사용할 수 있습니다. 폐수 샘플은 종종 이러한 병원균 및 관련 AMR의 감시를 위해 이 키트를 사용하여 검사됩니다. 폐수 샘플의 경우, 일반적으로 리드 수를 10M 단일 리드 또는 20M 쌍 단부 리드로 늘리는 것이 좋습니다.
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결과
MiSeq Reagent Kit v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.
TruSight Oncology 500
FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.
Illumina DNA Prep
광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.
NextSeq 500/550 v2.5 Kits
Reagent v2.5 키트는 시작 형광 강도를 유지하는 탄성 플로우 셀을 사용하여 이전 버전에 비해 안정성과 성능을 개선합니다.
MiniSeq Reagent Kit
MiniSeq System Reagent 키트에는 샘플 수가 적더라도 비용 효율적인 시퀀싱을 위한 2채널 SBS 화학 물질이 포함된 즉시 사용 가능한 카트리지가 있습니다.
MiSeq Reagent Kit v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
고도로 민감하고 포괄적인 호흡기 병원체 식별 및 항균제 내성 통찰력을 제공하는 라이브러리 준비 및 강화 키트입니다.
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