DRAGEN Array

Infinium 마이크로어레이에 대한 정확하고 포괄적이며 효율적인 유전형 분석, PGx CNV 검출 및 스타 대립유전자(star allele) 어노테이션을 지원합니다.

DRAGEN Array v1.0 | 기능은 다음과 같습니다.

  • 인간 Infinium 마이크로어레이의 단일 염기서열 변이(SNV) 유전형 분석.
  • Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx BeadChip에 대한 PGx CNV(유전자 복제수 변이) 검출, 스타 대립유전자 검출 및 대사자 상태를 포함한 약물유전체학(PGx) 분석 파이프라인.
  • 추가 정보와 전체 기능 목록은 릴리스 정보 에서 확인할 수 있습니다.

개요

DRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics) 어레이 2차 분석은 Infinium 어레이 기반 assay를 위한 고성능 바이오인포매틱스 소프트웨어입니다. DRAGEN Array는 최첨단 데이터 분석 도구를 사용하여 정확하고 포괄적이며 매우 효율적인 2차 분석을 제공하여 유전체 통찰력을 극대화하고 연구 요구 사항을 충족합니다.

정확한 결과

99.5% 이상의 유전형 분석 정확도 및 95% PGx CNV 정확도1. 또한 몇 가지 간단한 명령을 사용하면 98% 이상의 콜 비율로 CYP2D6와 같이 식별하기 어려운 약물유전체학(PGx) 유전자를 정확하게 확인할 수 있습니다.2

포괄적인 커버리지(coverage)

9개 표적 영역에 걸쳐 6개 표적 유전자에 대한 PGx CNV 커버리지. 50개 이상의 유전자에 대한 1700개 이상의 표적에 걸쳐 PGx 스타 대립유전자 및 변이 커버리지 – 하이브리드 및 대립유전자별 복제수를 검출합니다.

효율적인 분석

단일 플랫폼에서 유전형 분석, PGx CNV 검출 및 스타 대립유전자 검출이 가능합니다. 샘플당 35초3 만에 VCF(variant call format) 파일을 유전형 분석하여 대규모 실험에 소요되는 시간을 절약합니다.

클라우드 및 로컬 배포

DRAGEN Array는 로컬 명령줄 패키지(전문 FPGA(Field Programmable Gate Array) 서버나 하드웨어가 필요하지 않음)와 직관적인 그래픽 사용자 인터페이스(GUI)를 갖춘 클라우드 기반 패키지를 제공합니다.


사양

애플리케이션

예시 워크플로우

2
처리 및 스캔
3
추적, 분석 및 보고

관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료

그림 자료

여러 출력 옵션을 생성하는 단일 플랫폼에서 유전형 분석, PGx CNV 검출 및 스타 대립유전자 어노테이션을 생성합니다.

DRAGEN Array 클라우드 분석, 1단계:

'Runs – Microarray Analysis Setup'(실행 - 마이크로어레이 분석 설정)으로 이동하여 분석 시작

DRAGEN Array 클라우드 분석, 2단계:

분석 구성 설정

DRAGEN Array 클라우드 분석, 3단계:

샘플 시트 가져오기, BeadChip 선택 또는 IDAT 파일 가져오기를 사용하여 분석할 샘플 선택

DRAGEN Array 클라우드 분석, 4단계:

결과 확인

다운스트림 처리에 사용되는 스타 대립유전자 어노테이션 JSON 파일의 예. 지원 변이, 누락 변이 및 테스트한 대립유전자를 제공합니다.

Local analysis (1)

DRAGEN Array Local – star allele annotation

20109885

분석 비용은 샘플별로 계산합니다.

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Cloud analysis (2)

DRAGEN Array Cloud – star allele annotation

20109886

분석 비용은 샘플별로 계산합니다.

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ICA Basic Annual Subscription

20044874

Illumina Connected Analytics(ICA) 기본 연간 구독. 이 제품에는 시퀀싱 장비 연결, 데이터 관리 기능, 사전 패키지 도구에 대한 액세스 등 TSO500 고객을 위한 ICA 무료 액세스 1년이 포함됩니다.

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ICA Professional Annual Subscription

20044876

Illumina Connected Analytics(ICA) Professional Annual Subscription. 이 제품에는 시퀀싱 기기 연결, 데이터 관리 기능, 사전 패키지된 도구에 대한 액세스, 도구, 파이프라인, 데이터 웨어하우스 및 노트북으로 구성된 맞춤형 워크플로우를 생성하는 기능 등 1년 동안 ICA에 대한 액세스가 포함됩니다.

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ICA Enterprise Annual Subscription

20038994

Illumina Connected Analytics(ICA) Enterprise Annual Subscription. 이 제품에는 시퀀싱 기기 연결, 데이터 관리 기능, 맞춤형 및 사전 패키지 분석 도구, 데이터 웨어하우징 및 마이닝을 위한 기본 모듈을 포함한 ICA Enterprise에 대한 1년 액세스가 포함됩니다. ICA Enterprise에는 옵션인 HIPPAA BAA(미국만 해당), 싱글 사인온(SSO) 및 서비스 수준 계약(SLA)도 포함됩니다.

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Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

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Illumina Analytics  Starter Pack - 1,000 iCredits

20042039

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

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Illumina Analytics  - 5,000 iCredits

20042040

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

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Illumina Analytics  - 50,000 iCredits

20042041

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

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Illumina Analytics - 100,000 iCredits

20042042

iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.

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선택 품목 요약

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

참고 문헌

1,2,3 - Illumina data on file, 2023.

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