AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel

T 세포 수용체 베타 사슬 재배열을 시퀀싱하여 종양 검체에서 T 세포 다양성 및 클론 확장을 측정하기 위한 FFPE 호환 패널입니다.

5.5~7.5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음)

Assay 시간

<1.5시간

수작업 시간

1 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR(Short Read) 패널은 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 종양 검체를 포함한 여러 검체 유형과 함께 사용하도록 설계된 고도로 다중화된 표적 염기서열분석 패널입니다. 이는 T 세포 수용체(TCR) 베타 사슬 재배열의 염기서열분석을 통해 T 세포 다양성 및 클론 확장을 측정하도록 설계되었다. 다중 PCR 프라이머, 라이브러리 시약 및 샘플 바코드의 단일 풀을 사용하여 FFPE, 전혈, 신선 동결 조직 또는 형광 활성화 세포 분류(FACS) 정렬 세포에서 추출한 DNA/RNA에서 라이브러리를 생성할 수 있습니다.

주요 기능은 다음과 같습니다.

  • 고부가가치 콘텐츠 - TCR 베타 사슬 서열에 대한 포괄적인 커버리지 확보

  • 간단하고 간소화된 워크플로우 - FFPE, 전혈, 신선/동결 조직 또는 형광 활성화 세포 분류(FACS) 세포에서 하루에 시퀀싱 준비 라이브러리 준비

  • 낮은 입력 요구 사항최소 10ng의 입력 RNA에서 고품질 시퀀싱 라이브러리 생성

Illumina TCR 베타-SR 패널용 AmpliSeq는 Illumina 중합효소 연쇄반응(PCR) 기반 라이브러리 준비, 합성에 의한 Illumina 염기서열분석(SBS) 화학 및 차세대 염기서열분석(NGS) 기술, 자동 분석을 위한 AmpliSeq를 포함하는 통합 워크플로우의 일부입니다.

바로 사용할 수 있는 이 패널은 표적을 식별하고, 프라이머를 설계하고, 패널을 최적화하는 데 드는 시간과 노력을 절약해 줍니다. 이는 TCR 베타 사슬의 초가변 상보적 결정 영역 3(CDR3)의 특성화를 가능하게 한다. 이 정보는 면역학 연구자들이 면역 기능, 자가면역 질환, 면역 매개 이상반응을 이해하는 데 도움이 될 수 있습니다.

AmpliSeq for Illumina에 대해 자세히 알아보기


사양


필수 제품

AmpliSeq for Illumina 라이브러리 준비 워크플로우에는 패널, 라이브러리 준비 시약(Library PLUS) 및 인덱스가 필요합니다. cDNA 합성, 검체 식별 및 FFPE 검체 준비에 사용할 수 있는 제품은 다음과 같습니다.

  • AmpliSeq for Illumina RNA Panel로 작업할 때 Total RNA를 cDNA로 변환하려면 AmpliSeq cDNA Synthesis for Illumina가 필요합니다.
  • AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®는 AmpliSeq for Illumina 라이브러리 준비 방법을 사용하는 동안 라이브러리를 표준화할 수 있는 사용하기 쉬운 솔루션입니다.
  • AmpliSeq for Illumina Direct FFPE DNA를 사용하면 탈파라핀화(deparaffinization) 또는 DNA 정제를 할 필요 없이 없이 AmpliSeq for Illumina 프로토콜을 사용하여 FFPE 조직에서 DNA 준비 및 라이브러리 구성이 가능합니다.
/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우

1
준비

Illumina TCR 베타-SR 패널 전용 AmpliSeq

AmpliSeq for Illumina Library PLUS

AmpliSeq for Illumina CD Indexes

Illumina cDNA 합성을 위한 AmpliSeq


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System

Samples per run will depend on sample type.

2 × 151 bp

MiSeq System

Samples per run will depend on sample type.

2 × 151 bp

NextSeq 550 System

Samples per run will depend on sample type.

2 × 151 bp


관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료
지원 문서

해당 제품 전용 지원 섹션은 현재 제공되지 않습니다

비교하기

AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel
Assay 시간 5.5~7.5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음) 5.5~7.5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음)
자동화 기능 Liquid handling robots
Cancer type Solid tumor
콘텐츠 사양 CDR3의 특성 규명을 위해 최대 80 bp 리드 길이 앰플리콘으로 TCR 베타 사슬 재배열을 시퀀싱함. CDR1, CDR2 및 CDR3 등 TCRβ 사슬 재배열의 RNA 평가(최대 400 bp의 리드 길이 앰플리콘)
수작업 시간 <1.5시간 < 1.5시간
사용량 1 ng 10~1,000 ng
Instruments MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System
작용 기전 Multiplex PCR Multiplex PCR
방법 Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing, Targeted RNA sequencing Amplicon sequencing, Targeted RNA sequencing
Nucleic acid type DNA, RNA RNA
앰플리콘 수 다양함
특수 샘플의 종류 Blood, FFPE tissue Blood
Species category Human Human
표적 단편 크기 80 bp
Technology Sequencing Sequencing
변이 클래스 Transcript variants Transcript variants

선택 도구:

그림 자료

패널 (1)

AmpliSeq™ for Illumina® TCR beta-SR Panel

20031675

AmpliSeq Library PLUS for Illumina와 페어링 시 24개의 DNA 또는 RNA 샘플에 충분합니다. AmpliSeq dNTP Mix for Illumina를 포함합니다. 라이브러리 준비, 인덱스 어댑터 및 액세서리 제품을 별도로 구입하십시오.

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라이브러리 프렙 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

24개의 검체 라벨링에 충분한 24개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 8 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 시약과 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

Illumina, 세트 A, 세트 B, 세트 C 및 세트 D용 AmpliSeq CD 인덱스 4세트가 포함됩니다. 각 세트에는 96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 8bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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액세서리 제품 (3)

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

Illumina RNA 패널(예: AmpliSeq for Illumina Immune Response, Immune Repertoire Plus, TCR 베타 패널, 골수, 전사체 인간 유전자 발현, 포커스, 종합 패널 v3 및 맞춤형 또는 커뮤니티 RNA 패널)용 AmpliSeq로 작업할 때 총 RNA를 cDNA로 변환하기 위한 반응 혼합물 및 효소 혼합물 포함. 반응 수는 패널에 따라 다르다(예: Illumina 면역반응에 대한 AmpliSeq, 포커스, 종합 패널 v3, 맞춤형 패널에 대한 키트당 100건의 반응, Illumina 전사체 인간 유전자 발현, 골수, 면역 레퍼토리 플러스, TCR 베타 패널에 대한 AmpliSeq 키트당 200건의 반응).

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

시퀀싱을 위해 Illumina 라이브러리용 AmpliSeq를 준비할 때 라이브러리 정규화를 위한 비드 및 시약이 포함됩니다.

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AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

파라핀 제거 또는 DNA 정제 없이 Illumina 프로토콜용 AmpliSeq를 사용하여 라이브러리 구성을 위해 비염색 슬라이드 장착 FFPE 조직으로부터 DNA를 준비하는 24가지 반응을 포함합니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

Unit Price

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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