TruSight Cancer

이러한 전문가 정의 시퀀싱 연구 패널은 다양한 암에 대한 소인과 연관된 94개의 유전자 및 284개의 SNP를 표적화합니다.

1.5일

Assay 시간

5시간

수작업 시간

DNA 50 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

암 유전체학 전문가와 협력하여 개발된 이 사전 설계된 바로 사용할 수 있는 올리고는 연구자들이 이전에 암 소인과 관련이 있었던 다양한 유전자와 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP)의 염기서열을 분석할 수 있게 해줍니다.

  • 암에 대한 소인과 연관된 94개의 유전자 및 284개의 SNP를 표적화함

TruSight 암에는 흔한 암(예: 유방암, 결장직장암)과 희귀한 암 모두와 관련된 유전자가 포함됩니다. 또한, 세트는 게놈-와이드 연관성 연구(GWAS)를 통해 암과 상관관계가 있는 것으로 확인된 284개의 SNP를 포함한다. 콘텐츠 선택은 과학 문헌 및 기타 고품질 리소스의 전문가 큐레이션을 기반으로 했습니다.

TruSight 암 시퀀싱 패널은 식별된 관심 영역을 표적으로 하는 맞춤형 올리고를 제공합니다. 4가지 증균 반응에 충분한 제품이 공급됩니다. TruSight 암은 TruSight Rapid Capture 와 호환됩니다.

TruSight 암 샘플 데이터 세트

TruSight 암 염기서열분석 패널을 사용하여 6개의 인간 참조 검체를 준비했다. 이러한 라이브러리는 이중 인덱싱이 있는 2 x 100 bp 읽기 길이 구성에서 고출력 키트를 사용하여 MiniSeq 시스템에서 시퀀싱되었습니다. 총 수율은 5.2Gb였으며 염기의 95.8%가 Q30 이상이었습니다.

이 제품은  Illumina Advantage(TG) 제품으로 제공됩니다. Illumina Advantage 대규모 시퀀싱 제품은 로트별 배송 및 검사, 연장된 유통 기한, 더 큰 검사실 효율성을 위한 고급 변경 사항 알림을 특징으로 합니다.


사양


필수 제품

필수 액세서리

또한 다음 증균 제품 중 하나 이상이 필요합니다.

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System

Samples per run: mid output: 12, high output: 24 (based on > 20x coverage per target)

최대 2 × 150 bp

MiSeq System

Samples per run (by reagent kit version): v2: 12, v3: 24 (based on > 20x coverage per target)

최대 2 × 150 bp

NextSeq 550 System

Samples per run: mid output: 96, high output: 96 (based on > 20x coverage per target)

최대 2 × 150 bp


관련 애플리케이션 및 방법

다른 사람들이 이 제품을 사용하는 방법

MGZ Medical Genetic Center의 연구자들은 Infinium CytoSNP-850K BeadChip과 TruSight 암 패널을 사용하여 염색체 이상을 분석하고 있습니다.

문서

제품 관련 자료

비교하기

TruSight Cancer TruSight Hereditary Cancer Panel AmpliSeq for Illumina BRCA Panel
Assay 시간 1.5일 ~48 hr from DNA to data 5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음)
Cancer type Pan-cancer Pan-cancer, Solid tumor Solid tumor
콘텐츠 사양 일반 및 희귀 암과 연관된 94개 유전자와 284개 SNP에 대해 인리치하는 고정된 프로브 세트. Targets 113 cancer risk-associated genes BRCA1BRCA2의 엑손 영역 및 플랭킹 인트론 시퀀스
설명 일반 및 희귀 암에 대한 생식세포 돌연변이 검출 연구입니다. The TruSight Hereditary Cancer Panel is a targeted sequencing panel designed to assess germline mutations across 113 genes and 125 single nucleotide polymorphisms (SNPs) for identification purposes and polygenic risk scoring.  BRCA1BRCA2에 대한 생식세포 및 체세포 분석 연구용입니다.
수작업 시간 5시간 ~2 hr <1.5시간
사용량 DNA 50 ng 50–1000 ng DNA  1~100 ng(풀당 10 ng 권장)
Instruments MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 System MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500 System MiSeq System, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System
방법 Targeted DNA sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing
멀티플렉싱 최대 96플렉스 이중 인덱스 조합 96개
Nucleic acid type DNA DNA DNA
특수 샘플의 종류 Not FFPE-compatible, Not FFPE-compatible Blood, Saliva Blood, FFPE tissue
Species category Human Human Human
Technology Sequencing Sequencing Sequencing
변이 클래스 Germline variants Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels)

인리치먼트 패널 (12)

TruSight Cancer – Enrichment Oligos only (4 or 8 Enrichment Reactions)

FC-121-0202

TruSight Cancer는 다양한 암에 대한 소인과 관련된 94개 유전자 및 284개 SNP를 표적으로 하며, 단일 하이브리드화 워크플로우로 인해 Nextera Flex for Enrichment와 함께 사용하면 8가지 인리치먼트 반응에 충분하고 TruSight Rapid Capture와 함께 사용하면 4가지 인리치먼트 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비, 인리치먼트 및 인덱스 어댑터 시약은 별도로 주문해야 합니다.

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025524

96개의 라이브러리(8개의 12-플렉스 증균 반응)를 준비하고 증균하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널, Illumina 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025523

16개의 라이브러리(16개의 1-플렉스 증균 반응)를 준비하고 증균하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널, Illumina 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025520

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 시약은 포함되어 있지 않습니다. 증균 프로브 패널, Illumina 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오. 인리치먼트 시약은 라이브러리 준비 시약(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 samples))과 함께 주문하는 것만 가능합니다.

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025519

16개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 시약은 포함되어 있지 않습니다. 증균 프로브 패널, Illumina 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오. 인리치먼트 시약은 라이브러리 준비 시약(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 samples))과 함께 주문하는 것만 가능합니다.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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TruSight Rapid Capture (1 index, 8 samples, 8 enrichments)

FC-140-1101

8개의 1-플렉스 증균을 통해 최대 8개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 1개의 고유 인덱스 조합을 포함합니다.

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TruSight Rapid Capture (2 indexes, 8 samples, 4 enrichments)

FC-140-1102

4개의 2-플렉스 증균을 통해 최대 8개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 2개의 고유한 인덱스 조합을 포함합니다.

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TruSight Rapid Capture (4 indexes, 16 samples, 4 enrichments)

FC-140-1103

4개의 4-플렉스 증균을 통해 최대 16개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 4가지 고유 인덱스 조합 포함.

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TruSight Rapid Capture (24 indexes, 48 samples, 4 enrichments)

FC-140-1104

4개의 12-플렉스 증균을 통해 최대 48개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 24가지 고유 인덱스 조합 포함.

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TruSight Rapid Capture (24 indexes, 96 samples, 8 enrichments)

FC-140-1105

8개의 12-플렉스 증균을 통해 최대 96개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 24가지 고유 인덱스 조합 포함.

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TruSight Rapid Capture (96 indexes, 288 samples, 24 enrichments)

FC-140-1106

24개의 12-플렉스 증균을 통해 최대 288개의 라이브러리를 준비하는 시약이 들어 있습니다. 96개의 고유한 인덱스 조합이 포함됩니다.

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Illumina Advantage 제품 (1)

TG TruSight™ Cancer Sequencing Panel

TG-141-1002

암 소인 및 관련 질환과 관련된 유전자에 초점을 맞춘 암 유전자에 대한 올리고가 포함되어 있습니다. 4가지 증균 반응에 충분한 양.

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

생체표지자 특허 및 제품의 특정 용도에 고유한 기타 특허에 관한 참고사항:
일부 핵산 서열을 포함하는 일부 게놈 변이체, 및 특정 응용에서 이들의 사용은 특허에 의해 보호될 수 있다. 고객은 고객의 특정 응용 분야에서 제품을 사용하기 위해 해당 특허를 소유하거나 관리하는 당사자로부터 라이선스를 취득해야 하는지 여부를 결정해야 합니다.

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