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AmpliSeq for Illumina BRCA Panel

BRCA1 및 BRCA2에서 체세포 및 생식세포 변이를 조사하는 표적 연구 패널.

5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음)

Assay 시간

<1.5시간

수작업 시간

1~100 ng(풀당 10 ng 권장)

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina  BRCA 패널용 AmpliSeq는 BRCA1 및 BRCA2 유전자 전반에 걸친 체세포 및 생식세포 변이체 연구를 위한 표적 재서열분석법  이다.BRCA1  BRCA2

주요 기능

  • 관련 유전자 함량 -  BRCA1 및  BRCA2의 모든 엑손 부위 및 측면 인트론 서열을 표적으로 함

  • 빠르고 간소화된 워크플로우 - 1 ng의 고품질 또는 10 ng의 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 입력 검체로부터 하루 만에 시퀀싱 준비 라이브러리 준비

  • 정확한 데이터 - 로컬 또는 클라우드 기반 분석을 사용하여 체세포 돌연변이를 최소 5%의 변이 대립유전자 빈도로 검출

 BRCA 패널은 Illumina 중합효소 연쇄반응(PCR) 기반 라이브러리 준비를 위한 AmpliSeq, 합성에 의한 Illumina 염기서열분석(SBS) 차세대 염기서열분석(NGS) 기술, 자동화 분석을 포함하는 통합 워크플로우의 일부입니다.

BRCA1 및  BRCA2 는 특정 돌연변이를 보유할 때 유방암 및 난소암의 위험 증가에 관여하는 인간 종양 억제 유전자이다. 이 즉시 사용 가능한 패널은 연구자들이 표적을 식별하고, 프라이머를 설계하고, 패널을 최적화하는 데 드는 시간과 노력을 절약해 줍니다.

AmpliSeq for Illumina에 대해 더 알아보기

사양

Assay 시간 5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음)
암 종류 고형암
콘텐츠 사양 BRCA1 및 BRCA2의 엑손 영역 및 플랭킹 인트론 시퀀스
설명 BRCA1 및 BRCA2에 대한 생식세포 및 체세포 분석 연구용입니다.
수작업 시간 <1.5시간
사용량 1~100 ng(풀당 10 ng 권장)
기기 MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템
작용 기전 Multiplex PCR
방법 표적 DNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱
멀티플렉싱 이중 인덱스 조합 96개
핵산 종류 DNA
앰플리콘 수 총 265개. 풀 2개. (풀 1: 132개 앰플리콘. 풀 2: 133개 앰플리콘).
특수 샘플의 종류 혈액, FFPE 조직
종 카테고리 인간
기술 시퀀싱
변이 클래스 단일 염기 다형성(SNP), 체세포 변이, 생식세포 변이, 삽입 결실(Indel)

필수 제품

AmpliSeq for Illumina  BRCA 패널 워크플로우에는  BRCA 패널, 라이브러리 플러스 키트 및 인덱스 어댑터가 필요합니다.

/ 건

애플리케이션

예시 워크플로우

1
준비

Illumina  BRCA 패널 전용 AmpliSeq

2
시퀀스
3
분석

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
iSeq 100 시스템

12 samples per run (assumes minimum coverage of 500×)
96 samples per run (assumes minimum coverage of 50x)

2 × 150 bp
2 × 150 bp
MiniSeq 시스템

Samples per run: mid output: 24, high output: 80 (assumes minimum coverage of 500×)

2 × 150 bp
MiSeq 시스템

Samples per run at 500x minimum coverage (by reagent kit version): v2 nano: 3, v2 micro: 12, v2: 48, v3: 80
Samples per run at 50x minimum coverage (by reagent kit version): v2 nano: 32, v2 micro: 96

2 × 150 bp
2 × 150 bp

관련 애플리케이션 및 방법

타겟 재시퀀싱

표적 재시퀀싱을 통해 유전자 또는 유전체 영역의 부분집합을 분리하고 시퀀스를 분석하며, 이를 통해 검사실의 리소스를 절약할 수 있습니다.

병리학 및 임상 암 연구

Illumina의 임상 암 연구 솔루션은 정확한 유전체 정보를 제공하고 실험실에서 단일 검사를 통해 여러 유전자를 분석할 수 있습니다.

문서

제품 관련 자료
지원 문서

비교하기

AmpliSeq for Illumina BRCA Panel TruSight Cancer
Assay 시간 5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음) 1.5일
암 종류 고형암 전체 고형암
콘텐츠 사양 BRCA1 및 BRCA2의 엑손 영역 및 플랭킹 인트론 시퀀스 일반 및 희귀 암과 연관된 94개 유전자와 284개 SNP에 대해 인리치하는 고정된 프로브 세트.
설명 BRCA1 및 BRCA2에 대한 생식세포 및 체세포 분석 연구용입니다. 일반 및 희귀 암에 대한 생식세포 돌연변이 검출 연구입니다.
수작업 시간 <1.5시간 5시간
사용량 1~100 ng(풀당 10 ng 권장) DNA 50 ng
기기 MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 500 시스템
작용 기전 Multiplex PCR
방법 표적 DNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱 표적 DNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트
멀티플렉싱 이중 인덱스 조합 96개 최대 96플렉스
핵산 종류 DNA DNA
앰플리콘 수 총 265개. 풀 2개. (풀 1: 132개 앰플리콘. 풀 2: 133개 앰플리콘).
특수 샘플의 종류 혈액, FFPE 조직 FFPE 호환 불가, FFPE 호환 불가
종 카테고리 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 단일 염기 다형성(SNP), 체세포 변이, 생식세포 변이, 삽입 결실(Indel) 생식세포 변이

선택 도구:

Library Prep and Array Kit Selector

요구 사항에 적합한 시퀀싱 Library Prep Kit 또는 마이크로어레이를 찾아보세요. 방법, 종 등을 기준으로 필터링할 수 있습니다. 키트를 비교 및 공유하고 주문할 수 있습니다.

패널 (1)

AmpliSeq™ BRCA Panel for Illumina®

20019168

BRCA1 및 BRCA2 유전자의 모든 엑손을 평가하는 표적 패널. 키트에는 24개의 반응이 포함되어 있습니다. Library PLUS 및 인덱스 별도 판매.

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라이브러리 프렙 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

24개의 검체 라벨링에 충분한 24개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 8 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 시약과 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

Illumina, 세트 A, 세트 B, 세트 C 및 세트 D용 AmpliSeq CD 인덱스 4세트가 포함됩니다. 각 세트에는 96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 8bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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액세서리 제품 (2)

AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

파라핀 제거 또는 DNA 정제 없이 Illumina 프로토콜용 AmpliSeq를 사용하여 라이브러리 구성을 위해 비염색 슬라이드 장착 FFPE 조직으로부터 DNA를 준비하는 24가지 반응을 포함합니다.

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

시퀀싱을 위해 Illumina 라이브러리용 AmpliSeq를 준비할 때 라이브러리 정규화를 위한 비드 및 시약이 포함됩니다.

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선택 품목 요약

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

TruSight Oncology 500

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.

iSeq 100 Reagents

iSeq 100 System용 시약은 간단하고 저렴한 시퀀싱을 위한 1채널 SBS 화학 및 CMOS 기술을 갖춘 즉시 사용 가능한 카트리지가 특징입니다.

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