AmpliSeq for Illumina BRCA Panel

BRCA1BRCA2에서 체세포 및 생식세포 변이를 조사하는 표적 연구 패널.

5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음)

Assay 시간

<1.5시간

수작업 시간

1~100 ng(풀당 10 ng 권장)

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina  BRCA 패널용 AmpliSeq는 BRCA1 및 BRCA2 유전자 전반에 걸친 체세포 및 생식세포 변이체 연구를 위한 표적 재서열분석법  이다.BRCA1  BRCA2

주요 기능

  • 관련 유전자 함량 -  BRCA1 및  BRCA2의 모든 엑손 부위 및 측면 인트론 서열을 표적으로 함

  • 빠르고 간소화된 워크플로우 - 1 ng의 고품질 또는 10 ng의 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 입력 검체로부터 하루 만에 시퀀싱 준비 라이브러리 준비

  • 정확한 데이터 - 로컬 또는 클라우드 기반 분석을 사용하여 체세포 돌연변이를 최소 5%의 변이 대립유전자 빈도로 검출

 BRCA 패널은 Illumina 중합효소 연쇄반응(PCR) 기반 라이브러리 준비를 위한 AmpliSeq, 합성에 의한 Illumina 염기서열분석(SBS) 차세대 염기서열분석(NGS) 기술, 자동화 분석을 포함하는 통합 워크플로우의 일부입니다.

BRCA1 및  BRCA2 는 특정 돌연변이를 보유할 때 유방암 및 난소암의 위험 증가에 관여하는 인간 종양 억제 유전자이다. 이 즉시 사용 가능한 패널은 연구자들이 표적을 식별하고, 프라이머를 설계하고, 패널을 최적화하는 데 드는 시간과 노력을 절약해 줍니다.


사양


필수 제품

AmpliSeq for Illumina  BRCA 패널 워크플로우에는  BRCA 패널, 라이브러리 플러스 키트 및 인덱스 어댑터가 필요합니다.

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
iSeq 100 System

12 samples per run (assumes minimum coverage of 500×)
96 samples per run (assumes minimum coverage of 50x)

2 × 150 bp
2 × 150 bp

MiniSeq System

Samples per run: mid output: 24, high output: 80 (assumes minimum coverage of 500×)

2 × 150 bp

MiSeq System

Samples per run at 500x minimum coverage (by reagent kit version): v2 nano: 3, v2 micro: 12, v2: 48, v3: 80
Samples per run at 50x minimum coverage (by reagent kit version): v2 nano: 32, v2 micro: 96

2 × 150 bp
2 × 150 bp


관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

AmpliSeq for Illumina BRCA Panel TruSight Cancer
Assay 시간 5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음) 1.5일
Cancer type Solid tumor Pan-cancer
콘텐츠 사양 BRCA1BRCA2의 엑손 영역 및 플랭킹 인트론 시퀀스 일반 및 희귀 암과 연관된 94개 유전자와 284개 SNP에 대해 인리치하는 고정된 프로브 세트.
설명 BRCA1BRCA2에 대한 생식세포 및 체세포 분석 연구용입니다. 일반 및 희귀 암에 대한 생식세포 돌연변이 검출 연구입니다.
수작업 시간 <1.5시간 5시간
사용량 1~100 ng(풀당 10 ng 권장) DNA 50 ng
Instruments MiSeq System, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 System
작용 기전 Multiplex PCR
방법 Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing Targeted DNA sequencing, Target enrichment
멀티플렉싱 이중 인덱스 조합 96개 최대 96플렉스
Nucleic acid type DNA DNA
앰플리콘 수 총 265개. 풀 2개. (풀 1: 132개 앰플리콘. 풀 2: 133개 앰플리콘).
특수 샘플의 종류 Blood, FFPE tissue Not FFPE-compatible, Not FFPE-compatible
Species category Human Human
Technology Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels) Germline variants

선택 도구:

패널 (1)

AmpliSeq™ BRCA Panel for Illumina®

20019168

BRCA1 및 BRCA2 유전자의 모든 엑손을 평가하는 표적 패널. 키트에는 24개의 반응이 포함되어 있습니다. Library PLUS 및 인덱스 별도 판매.

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라이브러리 프렙 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

24개의 검체 라벨링에 충분한 24개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 8 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 시약과 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

Illumina, 세트 A, 세트 B, 세트 C 및 세트 D용 AmpliSeq CD 인덱스 4세트가 포함됩니다. 각 세트에는 96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 8bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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액세서리 제품 (2)

AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

파라핀 제거 또는 DNA 정제 없이 Illumina 프로토콜용 AmpliSeq를 사용하여 라이브러리 구성을 위해 비염색 슬라이드 장착 FFPE 조직으로부터 DNA를 준비하는 24가지 반응을 포함합니다.

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

시퀀싱을 위해 Illumina 라이브러리용 AmpliSeq를 준비할 때 라이브러리 정규화를 위한 비드 및 시약이 포함됩니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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