AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel

40개의 DNA 유전자, 29개의 RNA 융합 동인 유전자, 골수암과 관련된 5개의 유전자 발현 수준을 조사하기 위한 표적 패널.

5.5~7.5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음)

Assay 시간

< 1.5시간

수작업 시간

고품질 DNA 20 ng, 고품질 RNA 10 ng (풀당 10 ng 권장)

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

골수 패널은 혈액암과 관련된 생체표지자를 연구하기 위해 혈액과 골수 검체로부터 채취한 DNA와 RNA를 단일 분석으로 동시에 분석할 수 있게 한다. 패널은 급성 골수성 백혈병(AML), 골수 형성이상 증후군(MDS), 골수증식 종양(MPN), 만성 골수성 백혈병(CML), 만성 골수단핵구성 백혈병(CMML), 소아 골수단핵구성 백혈병(JMML)과 같은 주요 골수 장애의 관련 표적을 다룬다. 주요 기능은 다음과 같습니다.

주요 기능

  • 고부가가치 함량 - CEBPA 및 FLT3-ITD와 같은 까다로운 표적을 포함하여 69개 유전자 전반에 걸쳐 생체표지자를 표적으로 함 FLT3-ITDs

  • 빠르고 간소화된 워크플로우 - 10 ng의 고품질 DNA 및 RNA로 하루 만에 시퀀싱 준비 라이브러리 준비

  • 정확한 데이터 - 로컬 또는 클라우드 기반 분석을 사용하여 체세포 돌연변이를 5%의 빈도로 탐지

골수 패널은 Illumina 중합효소 연쇄반응(PCR) 기반 라이브러리 준비를 위한 AmpliSeq, 합성에 의한 Illumina 염기서열분석(SBS), NGS 기술 및 자동 분석을 포함하는 통합 워크플로우의 일부입니다.

바로 사용할 수 있는 패널은 표적을 식별하고, 프라이머를 설계하고, 패널을 최적화하는 데 드는 시간과 노력을 절약해 줍니다.


사양


필수 제품

AmpliSeq for Illumina 골수 패널 워크플로우에는 골수 패널 올리고, AmpliSeq 라이브러리 플러스 키트 중 하나, 최소 하나의 AmpliSeq 인덱스 키트가 필요합니다. 총 RNA를 cDNA로 변환하려면 cDNA 합성이 필요합니다.

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System

Samples per run (mid output): 4 DNA, 32 RNA, 3 combined samples (based on >95% at 500x minimum coverage)
Samples per run (high output): 12 DNA, 96 RNA, 11 combined samples (based on >95% at 500x minimum coverage)

2 x 151 bp
2 x 151 bp

MiSeq System

Samples per run with v2 reagents: 7 DNA, 60 RNA, 6 combined samples
Samples per run with v3 reagents: 12 DNA, 96 RNA, 11 combined samples

2 x 151 bp
2 x 151 bp


관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 TruSight Myeloid Sequencing Panel
Assay 시간 5.5~7.5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음) 5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음) 8시간
Cancer type Hematologic Pan-cancer, Solid tumor Hematologic
콘텐츠 사양 69개 유전자 전반의 생체표지자를 표적으로 함(주요 DNA 표적 유전자 40개, RNA 유전자 융합 유발 유전자 29개 및 유전자 발현 수준 5개) 암과의 연관성이 알려져 있는 50개 유전자의 핫스팟 영역 골수 악성 종양과 연관된 54개 유전자를 표적으로 함. 프로브는 종양 억제인자 유전자 및 돌연변이 핫스팟의 앰플리콘 568개를 증폭함.
설명 골수암과 관련된 DNA 유전자 40개, RNA 유전자 융합 유발 유전자 29개 및 유전자 발현 수준 5개를 연구하기 위한 표적 패널입니다. 50개 암 관련 유전자의 핫스팟 영역에 대한 체세포 분석 연구. 골수 악성 종양에 대한 체세포 돌연변이 검출 연구용입니다.
수작업 시간 < 1.5시간 < 1.5시간 3시간
사용량 고품질 DNA 20 ng, 고품질 RNA 10 ng
(풀당 10 ng 권장)
1~100 ng(풀당 10 ng 권장) 50 ng
Instruments MiSeq System, MiniSeq System MiSeq System, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System MiSeq System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 System
방법 Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing, Targeted RNA sequencing Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing
멀티플렉싱 최대 96플렉스 이중 인덱스 조합 96개 최대 96플렉스
Nucleic acid type DNA, RNA DNA DNA
특수 샘플의 종류 Blood, Not FFPE-compatible, Bone marrow FFPE tissue Not FFPE-compatible, Not FFPE-compatible
Species category Human Human Human
Technology Sequencing Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Somatic variants, Insertions-deletions (indels) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Insertions-deletions (indels) Somatic variants, Insertions-deletions (indels)

선택 도구:

그림 자료

CEBPA 유전자에 대한 높은 커버리지

AmpliSeq for Illumina 골수 패널로 평가한 DNA는 유전자의 전체 전사에 걸쳐 높은 판독 깊이 범위를 보여줍니다.

 

패널 (1)

AmpliSeq™ for Illumina® Myeloid Panel

20024478

고정 패널에는 혈액암과 관련된 74개의 유전자가 포함된다. 키트에는 24개의 반응(24개의 DNA 라이브러리와 24개의 RNA 라이브러리)이 포함되어 있습니다. LP PLUS의 48가지 반응이 필요합니다. Library PLUS, 인덱스 및 cDNA 합성은 별도로 판매됩니다.

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라이브러리 프렙 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

24개의 검체 라벨링에 충분한 24개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 8 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 시약과 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

Illumina, 세트 A, 세트 B, 세트 C 및 세트 D용 AmpliSeq CD 인덱스 4세트가 포함됩니다. 각 세트에는 96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 8bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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액세서리 제품 (2)

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

Illumina RNA 패널(예: AmpliSeq for Illumina Immune Response, Immune Repertoire Plus, TCR 베타 패널, 골수, 전사체 인간 유전자 발현, 포커스, 종합 패널 v3 및 맞춤형 또는 커뮤니티 RNA 패널)용 AmpliSeq로 작업할 때 총 RNA를 cDNA로 변환하기 위한 반응 혼합물 및 효소 혼합물 포함. 반응 수는 패널에 따라 다르다(예: Illumina 면역반응에 대한 AmpliSeq, 포커스, 종합 패널 v3, 맞춤형 패널에 대한 키트당 100건의 반응, Illumina 전사체 인간 유전자 발현, 골수, 면역 레퍼토리 플러스, TCR 베타 패널에 대한 AmpliSeq 키트당 200건의 반응).

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

시퀀싱을 위해 Illumina 라이브러리용 AmpliSeq를 준비할 때 라이브러리 정규화를 위한 비드 및 시약이 포함됩니다.

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선택 품목 요약

제품

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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