이 시퀀싱 연구 패널은 AML, MDS, MPN, CML, CMML 및 JMML과 같은 골수 악성 종양과 관련된 변이를 표적으로 합니다.
Assay 시간
수작업 시간
사용량
TruSight Myeloid Sequencing Panel은 전문가가 정의한 콘텐츠와 입증된 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 기술을 사용하여 골수 악성 종양의 체세포(somatic) 변이를 식별합니다.
패널 콘텐츠는 혈액암과 혈액질환 분야에서 인정 받는 전문가로 구성된 컨소시엄에 의해 설계되었으며 다음과 같은 질환에서 흔히 돌연변이를 일으키는 유전자를 표적으로 합니다.
TruSight Myeloid Sequencing Panel은 15개의 전체 유전자(엑손만 해당) 및 발암성 핫스팟이 커버되는 39개의 추가 유전자를 커버하여, 단일 검사로 골수 악성 종양과 관련된 것으로 알려져 있는 주요 유전자에 대한 포괄적인 평가를 제공합니다. 그 결과, 연구자들이 액체 생검을 통해 순환 종양을 프로파일링할 수 있도록 지원하는 정확하고 비용 효율적인 솔루션을 얻을 수 있습니다. "그림" 섹션에서 유전자 목록을 보세요.
TruSight Myeloid 라이브러리는 데스크탑 시퀀서에서 실행하고 Somatic Variant Caller를 사용하는 MiSeq Reporter 또는 Local Run Manager 앰플리콘 워크플로우로 정렬 및 변이 검출(variant calling)을 수행하는 데 매우 적합합니다. 이후, 필터링과 어노테이션을 변이 분석 소프트웨어를 사용하여 수행할 수 있습니다.
| Assay 시간 | 8시간 |
|---|---|
| Cancer type | Hematologic |
| 콘텐츠 사양 | 골수 악성 종양과 연관된 54개 유전자를 표적으로 함. 프로브는 종양 억제인자 유전자 및 돌연변이 핫스팟의 앰플리콘 568개를 증폭함. |
| 설명 | 골수 악성 종양에 대한 체세포 돌연변이 검출 연구용입니다. |
| 수작업 시간 | 3시간 |
| 사용량 | 50 ng |
| Instruments | MiSeq System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 System |
| 방법 | Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing |
| 멀티플렉싱 | 최대 96플렉스 |
| Nucleic acid type | DNA |
| 특수 샘플의 종류 | Not FFPE-compatible, Not FFPE-compatible |
| Species category | Human |
| Technology | Sequencing |
| 변이 클래스 | Somatic variants, Insertions-deletions (indels) |
각 TruSight Myeloid library preparation kit (96 samples)에는 다음 액세서리 키트가 필요합니다.
TruSight Myeloid Sequencing Panel
| 기기 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| MiniSeq System | Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 95% amplicons at > 500x coverage) |
2 × 150 bp(최대 권장) |
| MiSeq System | 8 samples per run with v3 reagents (based on 95% amplicons at > 500x coverage) |
2 × 150 bp(최대 권장) |
| NextSeq 550 System | Samples per run: mid output: 48, high output: 96 (based on 95% amplicons at > 500x coverage) |
2 × 150 bp(최대 권장) |
Our clinical cancer research solutions deliver accurate genomic information, and enable labs to analyze multiple genes in a single test.
PCR 앰플리콘의 울트라 딥 시퀀싱을 통해 특정 관심 유전체 영역을 분석할 수 있습니다. 앰플리콘 시퀀싱에 대해 자세히 알아보고 포괄적인 솔루션을 찾아보세요.
NGS-based cancer sequencing methods provide more information in less time compared to single-gene and array-based approaches.
| TruSight Myeloid Sequencing Panel | AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | |
|---|---|---|---|
| Assay 시간 | 8시간 | 5.5~7.5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음) | 5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음) |
| Cancer type | Hematologic | Hematologic | Pan-cancer, Solid tumor |
| 콘텐츠 사양 | 골수 악성 종양과 연관된 54개 유전자를 표적으로 함. 프로브는 종양 억제인자 유전자 및 돌연변이 핫스팟의 앰플리콘 568개를 증폭함. | 69개 유전자 전반의 생체표지자를 표적으로 함(주요 DNA 표적 유전자 40개, RNA 유전자 융합 유발 유전자 29개 및 유전자 발현 수준 5개) | 암과의 연관성이 알려져 있는 50개 유전자의 핫스팟 영역 |
| 설명 | 골수 악성 종양에 대한 체세포 돌연변이 검출 연구용입니다. | 골수암과 관련된 DNA 유전자 40개, RNA 유전자 융합 유발 유전자 29개 및 유전자 발현 수준 5개를 연구하기 위한 표적 패널입니다. | 50개 암 관련 유전자의 핫스팟 영역에 대한 체세포 분석 연구. |
| 수작업 시간 | 3시간 | < 1.5시간 | < 1.5시간 |
| 사용량 | 50 ng |
고품질 DNA 20 ng, 고품질 RNA 10 ng (풀당 10 ng 권장) |
1~100 ng(풀당 10 ng 권장) |
| Instruments | MiSeq System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 System | MiSeq System, MiniSeq System | MiSeq System, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System |
| 방법 | Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing | Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing, Targeted RNA sequencing | Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing |
| 멀티플렉싱 | 최대 96플렉스 | 최대 96플렉스 | 이중 인덱스 조합 96개 |
| Nucleic acid type | DNA | DNA, RNA | DNA |
| 특수 샘플의 종류 | Not FFPE-compatible, Not FFPE-compatible | Blood, Not FFPE-compatible, Bone marrow | FFPE tissue |
| Species category | Human | Human | Human |
| Technology | Sequencing | Sequencing | Sequencing |
| 변이 클래스 | Somatic variants, Insertions-deletions (indels) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Somatic variants, Insertions-deletions (indels) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Insertions-deletions (indels) |
| ABL1 | CEBPA | HRAS | MYD88 | SF3B1 |
| ASXL1 | CSF3R | IDH1 | NOTCH1 | SMC1A |
| ATRX | CUX1 | IDH2 | NPM1 | SMC3 |
| BCOR | DNMT3A | IKZF1 | NRAS | SRSF2 |
| BCORL1 | ETV6/TEL | JAK2 | PDGFRA | STAG2 |
| BRAF | EZH2 | JAK3 | PHF6 | TET2 |
| CALR | FBXW7 | KDM6A | PTEN | TP53 |
| CBL | FLT3 | KIT | PTPN11 | U2AF1 |
| CBLB | GATA1 | KRAS | RAD21 | WT1 |
| CBLC | GATA2 | MLL | RUNX1 | ZRSR2 |
| CDKN2A | GNAS | MPL | SETBP1 |
TruSight Myeloid Sequencing Panel (96 samples)
FC-130-1010
골수 악성종양과 연관된 54개 유전자(전체 유전자 또는 표적 부위)에 대한 TruSeq 맞춤형 Amplicon 기반 라이브러리 준비 시약. 96개의 샘플에 충분한 라이브러리 준비 시약 및 TruSight 골수성 올리고가 포함됩니다.
List Price:
Discounts:
TruSeq Custom Amplicon Index Kit (96 indexes, 384 samples)
FC-130-1003
각 TruSeq 사용자 지정 암플리콘 인덱스 키트에는 최대 384개의 샘플 준비를 위한 96개의 고유 인덱스가 포함되어 있습니다.
List Price:
Discounts:
TruSeq Custom Amplicon Filter Plate (1 plate)
FC-130-1006
TruSeq Custom Amplicon assay와 함께 사용하기 위한 단일 교체 필터 플레이트가 포함되어 있습니다.
List Price:
Discounts:
TruSeq Index Plate Fixture & Collar Kit (2 each)
FC-130-1007
PCR 증폭 단계를 위한 인덱스 프라이머의 올바른 배치를 지원합니다. 두(2) 개의 TruSeq 인덱스 플레이트 고정장치와 두(2) 개의 플레이트 칼라가 포함됩니다.
List Price:
Discounts:
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발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.
FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.
광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.
DNA 투입 요구량이 적은 작은 유전체, PCR 앰플리콘, 플라스미드 및 cDNA 염기서열 분석을 위한 DNA 라이브러리를 준비하는 90분 워크플로우를 제공합니다.
Reagent v2.5 키트는 시작 형광 강도를 유지하는 탄성 플로우 셀을 사용하여 이전 버전에 비해 안정성과 성능을 개선합니다.
암과의 연관성이 알려진 50개 유전자의 핫스팟 영역을 조사하는 표적 연구 패널.
BRCA1 및 BRCA2에서 체세포 및 생식세포 변이를 조사하는 표적 연구 패널.
시퀀싱 특정 표적 또는 관심 대상 유전체 콘텐츠에 최적화된 맞춤형 표적 연구 패널입니다.
다양한 암 유형과 관련된 161개 유전자에 대한 변이를 조사하는 표적 DNA 및 RNA 연구 패널입니다.
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