Illumina Connected Analytics Cohorts

코호트를 신속하게 구축하고 탐색하기 위해 개인 데이터와 공개 데이터 세트를 결합하는 연구 설계 도구입니다.

개요

Illumina Connected Analytics에 통합된 Illumina Connected Analytics 코호트는 다중오믹 및 표현형 데이터를 한 곳에 통합하여 코호트를 더 잘 분석하고 새로운 연구 통찰력을 높일 수 있습니다. Illumina Connected Analytics 코호트는 다음을 제공합니다. 

  • TCGA, Broad RGP, DRAGEN 1kGP 및 GEO를 포함하여 고도로 큐레이션된 공개 데이터 세트에 대한 액세스 

  • 처음부터 시작할 필요 없이 기존 코호트에 대한 새로운 데이터 및 필터링 기준 

  • 코호트를 선택하고 시각화하는 간단한 시각적 도구로 복잡한 쿼리가 필요하지 않음 

  • 코호트 정의가 다운스트림 통계 분석(GWAS, PheWAS)을 위해 완료되도록 보장하기 위한 코호트의 타당성 분석 

데이터 구조화 간소화

유전체 및 표현형 데이터를 결합하기 위한 데이터 모델을 활용하고 맞춤형 로딩 및 조화에 대한 전문 서비스에 액세스합니다. 

코호트 기준을 신속하게 선택

브라우저를 사용하여 코호트에 적합한 시험대상자를 찾고 유전체 및 표현형 데이터를 통합하여 요약 통계를 검토합니다. 

워크플로를 원활하게 통합

DRAGEN 파이프라인을 포함한 워크플로에 쉽게 액세스하고 향상된 데이터 과학 연구를 위해 Illumina Connected Analytics Bench로 내보낼 수 있습니다. 


규정 준수 인증


소프트웨어 업데이트

Illumina Connected Analytics 코호트 v2.14.0 업데이트

  • 유전체 빌드 감지 및 들어올리기: 코호트 문서는 코호트로 가져오기 전에 hg19/GRCh37 VCF를 GRCh38로 변환하기 위한 설정 지침을 제공합니다. 

  • 속성 쿼리: 코호트를 정의할 때 수치 속성에 대한 다양한 값을 선택하는 사용자 경험 개선 

  • 코호트를 ICA 프로젝트 데이터로 내보내기: 추가 분석을 위해 코호트 정의 기준을 ICA 프로젝트에 일치시키는 시험대상자 목록을 내보내는 사용자 경험 개선 

  • 분석 시각화의 시험대상자 선택: 사용자는 바늘 그림의 시험대상자 수 링크를 따라 선택된 변이 또는 돌연변이를 보유한 시험대상자 목록을 볼 수 있습니다. 


필수 제품

Illumina Connected Analytics 라이선스가 필요합니다. ICA 코호트에 대한 iCredits, 보관 또는 소비에는 추가 비용이 없습니다.

 iCredits에 대해 자세히 알아보기 

/ 결과

애플리케이션

Illumina Connected Analytics 코호트는 피험자 및 샘플 수준의 메타데이터와 분자 데이터를 결합하여 신약 개발, 암 연구 등을 포함한 다양한 애플리케이션에 대해 선택된 개인 하위 집합에 대한 3차 분석을 수행합니다.

소프트웨어 제품 포트폴리오

1
연구실
2
런(Run)
3
분석
4
인사이트

관련 애플리케이션 및 방법


Illumina Connected Analytics 코호트를 이용한 발전

계획 및 가격 책정

Illumina Connected Analytics 라이선스가 필요합니다. Illumina 커넥티드 분석 코호트에 대한 iCredits, 스토리지 또는 소비에는 추가 비용이 없습니다.

다음 사항에 대해 더 알아보세요.

* 250 iCredit은 30일 초기 체험 기간이 지나면 만료됩니다. 
** Universal Copy Service를 지원하는 Control Software가 있는 시스템에서 사용 가능. 일부 레거시 시스템에서는 사용할 수 없습니다. 

문서

제품 관련 자료

그림 자료

코호트를 빠르고 쉽게 구축하고 탐색

Illumina 커넥티드 분석 코호트는 코호트의 유전체 및 표현형 데이터를 필터링하고 시각화하기 위한 친숙한 사용자 인터페이스를 제공합니다. 일부 코호트 정의에 대한 실행 가능성 분석을 위한 데이터 비교를 쉽게 평가할 수 있습니다. 

리소스

ICA Cohorts Annual Subscription

20065842

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FAQ

연구가 Illumina Connected Analytics 코호트에 로드된 경우, 고객 관리자는 공동 작업자와 연구를 공유할 수 있는 권한을 선택할 수 있습니다.

예. 개인 데이터는 Illumina Connected Analytics 코호트로 가져와 독립적으로 분석하거나 공공 데이터와 결합하여 코호트 분석을 확장할 수 있습니다.

Illumina Connected Analytics 코호트는 DNA 염기서열분석(예: 단일 뉴클레오티드 변화, CNV, 생식세포 및 체세포 호출) 및 RNA-Seq(예: TPM 및 차등 발현) 시험의 유전체 자료, 의학적 속성의 표현형 자료(예: 인구통계, 의학적 병력 및 치료적 중재), 공공 데이터베이스(예: TCGA, Broad RGP, DRAGEN 1kGP, GEO) 전반에서 27,000개 이상의 시험대상자 수준 자료 세트를 뒷받침한다.

/ 결과

NovaSeq X 시리즈 주문

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FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

* 250 iCredit은 30일 초기 체험 기간이 지나면 만료됩니다. 
** Universal Copy Service를 지원하는 Control Software가 있는 시스템에서 사용 가능. 일부 레거시 시스템에서는 사용할 수 없습니다. 

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