다양한 공중 보건 감시 시스템 및 미생물 연구 애플리케이션을 가능하게 하는 유연하고 효율적인 NGS 라이브러리 준비 키트입니다.
Assay 시간
수작업 시간
사용량
Illumina Microbial Amplicon Prep(iMAP)은 COVIDSeq와 동일한 화학적 성질을 기반으로 제작된 앰플리콘 기반 Library Prep Kit입니다. 거의 모든 Illumina 시퀀싱 시스템과 호환되는 라이브러리를 사용하여 라이브러리 준비가 빠르고 간단합니다. 바이러스 전장 유전체 시퀀싱, 항균제 내성 표지자 분석, 세균 및 진균 식별 등을 포함한 다양한 감염병, 공중 보건 감시 시스템 및 미생물 연구 애플리케이션에 사용할 수 있습니다.
짧은 수작업 시간으로 모든 규모에서 탁월한 데이터 품질과 정확성을 갖춘 시퀀싱 결과를 얻을 수 있습니다.
이 키트는 맞춤형 또는 발표되었거나 시판되는 프라이머 세트(프라이머 올리고는 포함되지 않음)에서 사용할 수 있으며 배양체, 면봉(비인두, 피부 및 비강), 폐수 등과 같은 출처에서 추출된 RNA 또는 DNA와 호환됩니다. 표적이 미리 로드된 Basespace Sequence Hub에서 DRAGEN Targeted Microbial 앱을 사용하여 분석을 수행할 수 있습니다. 파일을 쉽게 업로드하여 맞춤형 분석을 수행할 수도 있습니다.
*프로토콜은 정보 제공의 목적으로만 제공됩니다. 이는 해당 프로토콜이 Illumina에서 검증되거나 지원된다는 의미는 아닙니다.
1. Illumina. Accessed September 8, 2023, from Illumina Microbial Amplicon Prep for viral surveillance
2. DengueSeq: A pan-serotype whole genome amplicon sequencing protocol for dengue virus V.2. 2023년 9월 8일에 접속, https://www.protocols.io/view/dengueseq-a-pan-serotype-whole-genome-amplicon-seq-kqdg39xxeg25/v2
3. Bhatt L, Bhoyar RC, Jolly B, Israni R, Vignesh H, Scaria V, Sivasubbu S. The genome sequence of lumpy skin disease virus from an outbreak in India suggests a distinct lineage of the virus. Arch Virol. 2023 Feb 5;168(3):81. doi: 10.1007/s00705-023-05705-w.
4. Monkeypox virus multiplexed PCR amplicon sequencing (PrimalSeq) V.4. 2023년 9월 8일에 접속, https://www.protocols.io/view/monkeypox-virus-multiplexed-pcr-amplicon-sequencin-5qpvob1nbl4o/v4?step=2
5. Whole-Genome Amplification of Respiratory Syncytial Virus (RSV) using Illumina CovidSeq reagents for Next-Generation Sequencing V.2. 2023년 9월 8일에 접속, https://www.protocols.io/view/whole-genome-amplification-of-respiratory-syncytia-eq2lyjzbrlx9/v2
6. SARS-CoV-2 version 5.3.2 scheme release. 2023년 9월 12일에 접속, https://community.artic.network/t/sars-cov-2-version-5-3-2-scheme-release/462
7. Rabies Virus Bat-Clade Sequencing. 2023년 10월 30일에 접속, https://www.protocols.io/view/rabies-virus-bat-clade-sequencing-8epv5x3bng1b/v1
| Assay 시간 | < 9시간 |
|---|---|
| 자동화 기능 | 리퀴드 핸들링 로봇 |
| 설명 | Illumina 미생물 증폭기 준비(IMAP)는 48개 샘플에 대한 RT-PCR, 라이브러리 준비 및 인덱스를 포함하는 앰플리콘 기반 라이브러리 준비 솔루션입니다. COVIDSeq와 동일한 화학 물질을 기반으로 하며 DNA 및 RNA 검체와 함께 사용할 수 있습니다. 올리고 프라이머는 키트에 제공되지 않으며 별도로 공급됩니다. |
| 수작업 시간 | 48개 검체의 경우 약 3시간 |
| 사용량 | 샘플 공급원에 따라 다름 |
| 기기 | MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템 |
| 작용 기전 | Multiplex PCR |
| 방법 | 앰플리콘 시퀀싱 |
| 핵산 종류 | DNA, RNA |
| 샘플의 종류 세부 사항 | 비강 면봉부터 폐수까지 매우 다양한 샘플의 종류와 호환 |
| 종 카테고리 | 기타, 효모, 바이러스, 세균 |
| 기술 | 시퀀싱 |
| 변이 클래스 | 단일 염기 다형성(SNP), 단일 염기서열 변이(SNV) |
Illumina Microbial Amplicon Prep
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차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)은 코로나바이러스의 새로운 균주 및 기타 새로운 감염병 제제의 식별을 통해 효과적인 유전체 감시 시스템 전략을 제공합니다.
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Illumina Microbial Amplicon Prep
20097857
cDNA 변환, 라이브러리 준비 및 인덱스가 포함된 48개 샘플 앰플리콘 키트. 프라이머는 포함되지 않습니다.
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