COVIDSeq Assay (96개 샘플)

이 저처리량 내지 중간 처리량 NGS assay를 통해 모든 규모의 검사실은 새로운 SARS-CoV-2 변이의 출현 및 유병률을 식별하고 추적할 수 있습니다.

개요

COVIDSEQ Assay(96개 샘플)는 연구 검사실에서 새로운 SARS-CoV-2 변종을 식별하는 데 도움이 되도록 설계된 포괄적인 앰플리콘 기반 차세대 시퀀싱(NGS) assay입니다. 

  • ARTIC v5.4.2 프라이머를 사용하여 SARS-CoV-2 RNA의 유전체를 검출합니다

  • 원활하고 유연한 엔드투엔드 워크플로우를 지원합니다.

빠르고 비용 효율적인 시퀀싱

적은 수의 샘플을 실행하도록 설계된 COVIDSeq Assay(96개 샘플)는 Illumina 벤치탑 시퀀싱 시스템에 이상적인 저처리량 구성을 제공하여 소규모 검사실에서 새로운 변종에 대한 분산 감시 시스템을 수행할 수 있습니다.

균일한 유전체 커버리지

96개의 앰플리콘은 새로운 변이에 대한 심층적인 특성 규명을 위해 SARS-CoV-2 유전체 전반에 걸쳐 완전한 커버리지를 제공합니다

통합 솔루션

키트에는 cDNA 변환, 증폭, 라이브러리 준비를 위한 모든 시약이 포함되어 있습니다. PCR 중 63°C 어닐링 온도는 변이 분석 및 인사이트를 개선합니다.

간소화된 데이터 분석

베이스스페이스 시퀀스 허의 DRAGEN 미생물 앰플리콘 앱을 비롯한 오픈 소프트웨어 도구를 사용하여 계통을 평가하고 돌연변이에 주석을 달 수 있습니다.

사양

필수 제품

하나의 COVIDSeq Assay(96개 샘플)가 필요합니다. 네 가지 옵션을 사용할 수 있으며, 포함된 색인 플레이트를 제외하고 모두 동일합니다. 

  • 시퀀싱 시스템용 시퀀싱 시약 키트 및 플로우 셀
  • 바이러스 RNA 추출 키트(예: QIAamp Viral RNA Mini Kit)

COVIDSeq Positive Control은 선택 품목입니다.

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애플리케이션

COVIDSeq Assay(96개 샘플)를 통해 벤치탑 시퀀싱 시스템을 사용하는 검사실은 SARS-CoV-2 변종 및 계통에 대한 유전체 감시를 수행하여 새로운 균주를 식별하고 모니터링할 수 있습니다.

워크플로우 예시

1
준비

Illumina COVIDSeq Assay(96개 샘플)

관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료
지원 문서

해당 제품 전용 지원 섹션은 현재 제공되지 않습니다

비교하기

COVIDSeq Assay (96개 샘플) COVIDSeq 시험 (RUO 버전) Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit Pan-Coronavirus Panel
자동화 기능 리퀴드 핸들링 로봇 리퀴드 핸들링 로봇 리퀴드 핸들링 로봇 리퀴드 핸들링 로봇
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
Content specifications Whole viral genome coverage of SARS-CoV-2 including the spike protein locus  Whole viral genome coverage of SARS-CoV-2 including the spike protein locus  호흡기 병원체 DNA와 RNA를 동시에 검출하고 항균 내성(AMR) 유전자 발현을 동시에 프로파일링합니다.
설명 COVIDSeq Assay(96개 샘플)는 연구 애플리케이션을 위해 모든 Illumina 벤치탑 시퀀싱 시스템에서 처리되도록 고안된 저처리량 및 중간 처리량 NGS assay입니다. COVIDSeq 검사(RUO 버전)는 연구 응용 분야를 위한 확장 가능한 High-throughput NGS 분석(최대 3072개 샘플)입니다.   호흡기 감염 및 동시 감염을 식별하고, 항균제 내성 표지자를 검출하며, 바이러스 진화 및 전파를 연구하기 위해 주요 병원체(SARS-CoV-2 및 Flu A/B 바이러스)의 균주 유형 분석을 실시한다. Pan-Coronavirus 패널은 다양한 동물 숙주에서 200개 이상의 알려진 신종 코로나바이러스 균주를 검출하고 전장 유전체 염기서열분석을 가능하게 하는 통합 워크플로우의 일부입니다.
기기 MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiniSeq 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiniSeq 시스템
방법 앰플리콘 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱 앰플리콘 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 전장 유전체 시퀀싱, 표적 인리치먼트
멀티플렉싱 iSeq System의 8-플렉스 MiSeq System의 30–48 플렉스 MiniSeq 시스템의 48-plex NextSeq의 384-plex NovaSeq의 384-plex 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플
핵산 종류 RNA RNA DNA, RNA RNA
샘플 유형 세부 정보 비인두, 구인두, 중비갑개 비강 면봉 검체  비인두, 구인두, 중비갑개 비강 면봉 검체 
종 카테고리 바이러스 바이러스 진균, 바이러스, 세균 바이러스
종 세부 사항 SARS-CoV-2(SARS-CoV-2_ MN908947v3) SARS-CoV-2(SARS-CoV-2_ MN908947v3) 호흡기 병원체(180+ 세균, 50+ 진균, SARS-CoV-2를 포함한 40+ 바이러스) 및 항균 내성 대립유전자(1200+)를 검출한다.
가닥 특이성 비가닥(Non-stranded) 비가닥(Non-stranded) 비가닥(Non-stranded)
기술 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱

선택 도구:

그림

유전체 커버리지 성능

리드 길이 및 깊이의 함수로서 성능을 플롯팅하는 열 지도는 싱글 리드에 비해 페어드 엔드 리드(paired-end·reads)로 상당한 개선을 보여줍니다. 신뢰도가 >0.99인 유전체 비율을 보여주며, 1에 가까운 값은 SARS-CoV-2 유전체의 보다 완전한 커버리지를 나타냅니다.

라이브러리 프렙 (4)

COVIDSeq Assay (96 samples) index 1

20049393

SARS-CoV-2 검출을 위한 96개 검체 준비용 시약 포함. 96개의 고유한 이중 인덱스가 있는 인덱스 플레이트 1을 포함합니다. 선택적 양성 대조군 및 선택적 v4 프라이머 풀을 별도로 구매

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COVIDSeq Assay (96 samples) index 2

20051772

SARS-CoV-2 검출을 위한 96개 검체 준비용 시약 포함. 96개의 고유한 이중 인덱스가 있는 인덱스 플레이트 2를 포함합니다. 선택적 양성 대조군 및 선택적 v4 프라이머 풀을 별도로 구매

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COVIDSeq Assay (96 samples) index 3 RUO

20051773

SARS-CoV-2 검출을 위한 96개 검체 준비용 시약 포함. 96개의 고유한 이중 인덱스가 있는 인덱스 플레이트 3을 포함합니다. 선택적 양성 대조군 및 선택적 v4 프라이머 풀을 별도로 구매

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COVIDSeq Assay (96 samples) index 4 RUO

20051774

SARS-CoV-2 검출을 위한 96개 검체 준비용 시약 포함. 96개의 고유한 이중 인덱스가 있는 인덱스 플레이트 4를 포함합니다. 선택적 양성 대조군 및 선택적 v4 프라이머 풀을 별도로 구매

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액세서리 제품 (2)

COVIDSeq Positive Control

20051775

품질 관리를 지원하는 100uL의 COVIDSeq 양성 대조군 포함

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Illumina COVIDSeq v4 Primer Pools, 384 Samples RUO

20065135

최대 384개의 샘플에 충분한 선택적 ARTIC v4 프라이머 풀 시약이 포함되어 있습니다. COVIDSeq 검사(RUO) 및 COVIDSeq 분석에 포함된 v3 프라이머 풀을 대체합니다(96개 샘플).

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

자주 묻는 질문

주요 차이점은 각 assay가 실행할 수 있는 샘플 수입니다. COVIDSeq Assay(96개 샘플)는 소규모 연구 검사실을 수용하기 위해 Illumina 벤치탑 시퀀싱 시스템에서 최대 96개의 샘플을 실행합니다. 반면에, COVIDSeq Test(RUO)는 NovaSeq 6000 시스템 또는 NextSeq 시퀀싱 시스템 라인에서 최대 3,072개의 샘플을 실행합니다.

준비된 라이브러리는 임의의 Illumina 시퀀싱 시스템에서 시퀀싱될 수 있습니다. 그러나, COVIDSeq Assay(96) 샘플의 저처리량 구성은 iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, NextSeq 550, NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템을 포함한 Illumina 벤치탑 시퀀싱 시스템에 이상적입니다.

SARS-CoV-2에 변이가 일어나는 과정에서 유전체 전반에 걸친 완벽한 커버리지를 보장하고 SARS-CoV-2 변이 검출에 대한 분석 민감도를 향상시키기 위해 종종 프라이머 풀을 업데이트해야 합니다. v5.4.2 프라이머는 최근 오미크론 변종에 대한 커버리지를 강화합니다.

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

TruSight Oncology 500

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.

COVIDSeq 시험 (RUO 버전)

검사실에서는 이 고처리량 차세대 시퀀싱 assay를 통해 SARS-CoV-2 돌연변이를 검출하여 새로운 변이의 출현과 유행을 식별하고 추적할 수 있습니다.

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