NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
COVIDSeq 검사(RUO 버전)는 연구자들이 SARS-CoV-2의 새로운 변이를 검출하고 규명할 수 있는 차세대 염기서열분석(NGS) 분석입니다.
COVIDSeq Test(RUO 버전)
이 High-throughput NGS assay를 통해 실험실은 SARS-CoV-2 돌연변이를 검출하여 새로운 변종의 출현 및 유병률을 식별하고 추적할 수 있습니다.
이 제품은 연구용(RUO)으로만 제공됩니다. 이 제품의 체외 진단 버전은 일본, 필리핀 및 미국에서 각 국가의 각 허가 기관에 따라 사용할 수 있습니다.
개요
신속하고 확장 가능한 시퀀싱
Illumina COVIDSeq 테스트(RUO 버전)는 처리량 요구 사항에 따라 384~3072개의 샘플을 수용합니다.
균일한 유전체 커버리지
커버리지는 특히 스파이크 단백질 유전자좌에 집중된다. 상세한 시퀀싱을 위해, 선택적인 ARTIC v4 프라이머 풀은 새로운 변이체에 대한 심층적인 특성화를 제공합니다.
통합 솔루션
키트에는 cDNA 변환, 증폭 및 라이브러리 준비에 필요한 모든 시약이 포함되어 있습니다. PCR 중 63°C 어닐링 온도는 변이체 분석 및 통찰력을 개선합니다.
간소화된 데이터 분석
BaseSpace Sequence Hub의 Illumina DRAGEN COVID 계보 앱을 포함한 개방형 소프트웨어 도구로 계보를 평가하고 돌연변이에 주석을 달 수 있습니다.
사양
| 자동화 기능 | Liquid handling robots |
|---|---|
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
| 콘텐츠 사양 | 스파이크 단백질 유전자좌 전반에 걸쳐 균일한 바이러스 게놈 커버리지 |
| 설명 | COVIDSeq 검사(RUO 버전)는 연구 응용 분야를 위한 확장 가능한 High-throughput NGS 분석(최대 3072개 샘플)입니다. |
| Instruments | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System |
| 방법 | Amplicon sequencing, Targeted RNA sequencing |
| 멀티플렉싱 | NextSeq의 384-plex NovaSeq의 384-plex |
| Nucleic acid type | RNA |
| 샘플 유형 세부 정보 | 비인두, 구인두, 중비갑개 비강 면봉 검체 |
| Species category | Human, Virus |
| 종 세부 사항 | SARS-CoV-2(SARS-CoV-2_ MN908947v3) |
| Strand specificity | Non-stranded |
| Technology | Sequencing |
필수 제품
Illumina COVIDSeq 검사(검체 3072개) 외에 다음이 필요합니다.
Illumina PCR 인덱스 세트 1–4용 IDT(384 인덱스, 384 샘플)
시퀀싱 시스템용 플로우 셀
시퀀싱 시스템용 시퀀싱 시약 키트
바이러스 RNA 추출 키트(예: QIAamp Viral RNA Mini Kit)
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결과
애플리케이션
COVIDSeq 검사(RUO 버전)는 진단 절차 또는 환자 관리에 사용하기 위한 것이 아니라 SARS-CoV-2의 검출 및 규명을 위한 통합 NGS 연구 솔루션입니다.
예시 워크플로우
워크플로 관리
라이브러리 준비
Illumina COVIDSeq 검사(RUO 버전)
애플리케이션 노트
관련 애플리케이션 및 방법
NGS can identify novel coronavirus variants, track COVID-19 transmission, and more. Compare NGS methods for various coronavirus sequencing goals.
가설이 없는 방법으로서, NGS는 최소 하나의 SNP만큼 상이한 감염성 질환 균주를 구별할 수 있고, 다중 시험의 필요성을 대체할 수 있다.
SARS-CoV-2 바이러스에 대한 숙주의 유전적 차이와 개별 면역반응을 연구하면 COVID-19 질병 취약성과 중증도를 밝힐 수 있습니다.
문서
제품 관련 자료
지원 문서
- Illumina DRAGEN COVIDSeq Test Pipeline Software Guide (RUO)
- Illumina DRAGEN COVIDSeq Test App Guide (RUO)
- 인덱스 어댑터 풀링 가이드
- Illumina Adapter Sequences
- Illumina COVIDSeq RUO Kits Reference Guide
- Illumina DRAGEN COVID Pipeline Software Guide
- 모두 Illumina COVIDSeq 테스트 RUO Support
- 모두 Illumina COVIDSeq 테스트 RUO 문서 Support
비교하기
| COVIDSeq Test(RUO 버전) | COVIDSeq assay(샘플 96개) | Pan-Coronavirus Panel | Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit | |
|---|---|---|---|---|
| 자동화 기능 | Liquid handling robots | Liquid handling robots | Liquid handling robots | Liquid handling robots |
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | |
| 콘텐츠 사양 | 스파이크 단백질 유전자좌 전반에 걸쳐 균일한 바이러스 게놈 커버리지 | 스파이크 단백질 유전자좌 전반에 걸쳐 균일한 바이러스 게놈 커버리지 | 호흡기 병원체 DNA와 RNA를 동시에 검출하고 항균 내성(AMR) 유전자 발현을 동시에 프로파일링합니다. | |
| 설명 | COVIDSeq 검사(RUO 버전)는 연구 응용 분야를 위한 확장 가능한 High-throughput NGS 분석(최대 3072개 샘플)입니다. | COVIDSeq Assay(96개 샘플)는 연구 애플리케이션을 위해 모든 Illumina 벤치탑 시퀀싱 시스템에서 처리되도록 고안된 저처리량 및 중간 처리량 NGS assay입니다. | Pan-Coronavirus 패널은 다양한 동물 숙주에서 200개 이상의 알려진 신종 코로나바이러스 균주를 검출하고 전장 유전체 염기서열분석을 가능하게 하는 통합 워크플로우의 일부입니다. | 호흡기 감염 및 동시 감염을 식별하고, 항균제 내성 표지자를 검출하며, 바이러스 진화 및 전파를 연구하기 위해 주요 병원체(SARS-CoV-2 및 Flu A/B 바이러스)의 균주 유형 분석을 실시한다. |
| Instruments | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System | MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System | MiSeq System, NextSeq 550 System, MiniSeq System |
| 방법 | Amplicon sequencing, Targeted RNA sequencing | Amplicon sequencing, Targeted RNA sequencing | Whole-genome sequencing, Target enrichment | Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment |
| 멀티플렉싱 | NextSeq의 384-plex NovaSeq의 384-plex | iSeq System의 8-플렉스 MiSeq System의 30–48 플렉스 MiniSeq 시스템의 48-plex | 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 | 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 |
| Nucleic acid type | RNA | RNA | RNA | DNA, RNA |
| 샘플 유형 세부 정보 | 비인두, 구인두, 중비갑개 비강 면봉 검체 | 비인두, 구인두, 중비갑개 비강 면봉 검체 | ||
| Species category | Human, Virus | Human, Virus | Virus | Fungal, Virus, Bacteria |
| 종 세부 사항 | SARS-CoV-2(SARS-CoV-2_ MN908947v3) | SARS-CoV-2(SARS-CoV-2_ MN908947v3) | 호흡기 병원체(180+ 세균, 50+ 진균, SARS-CoV-2를 포함한 40+ 바이러스) 및 항균 내성 대립유전자(1200+)를 검출한다. | |
| Strand specificity | Non-stranded | Non-stranded | Non-stranded | |
| Technology | Sequencing | Sequencing | Sequencing | Sequencing |
선택 도구:
Library Prep and Array Kit Selector
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그림 자료
유전체 커버리지 성능
리드 길이 및 깊이의 함수로서 성능을 플롯팅하는 열 지도는 단일 리드에 비해 쌍 단부 리드로 상당한 개선을 보여준다. > 0.99의 유전체 분획이 자신 있게 나타나 있으며, 1에 가까운 값은 SARS-CoV-2 유전체의 보다 완전한 범위를 나타낸다.
FAQ
COVIDSeq 검사(RUO 버전)는 NovaSeq 6000 시퀀싱 시스템용입니다. 또한 연구 모드의 iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx, 연구 모드의 NextSeq 500, NextSeq 550, NextSeq 550Dx, 연구 모드의 NextSeq 1000 또는 NextSeq 2000 시스템에서 실행할 수 있습니다.
주요 차이점은 각 assay가 실행할 수 있는 샘플 수입니다. COVIDSeq Assay(96개 검체)는 소규모 연구 실험실을 수용하기 위해 Illumina 벤치탑 시퀀싱 시스템에서 96개의 검체를 실행합니다. 반면에, COVIDSeq Test(RUO)는 NovaSeq 6000 시스템 또는 NextSeq 시퀀싱 시스템 라인에서 최대 3,072개의 샘플을 실행합니다.
예, 체외 진단(IVD) 검사는 각 국가의 각 허가 기관에 따라 허가받은 국가(일본, 필리핀, 미국)에서 사용할 수 있습니다.
ARTIC v3 프라이머 풀은 COVIDSeq 검사(RUO) 키트에 포함되어 있습니다. 여기에는 SARS-CoV-2의 원래 균주에 대해 설계된 98개의 앰플리콘 및 11개의 인간 유전자에 대한 프라이머가 포함되어 있습니다. 선택적 ARTIC v4 풀에는 델타 변이에 대해 설계된 99개의 앰프리콘과 인간 대조물질이 포함되어 있지 않다. 스파이크 단백질 유전좌위 전반에 걸쳐 유전체 커버리지를 개선하고 SARS-CoV-2 변이 검출을 위한 분석 민감도를 개선합니다. 기술 노트 읽기.
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결과
MiSeq Reagent Kit v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.
TruSight Oncology 500
FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.
Illumina DNA Prep
광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.
COVIDSeq assay(샘플 96개)
이 저처리량 내지 중간 처리량 NGS assay를 통해 모든 규모의 검사실은 새로운 SARS-CoV-2 변종의 출현 및 유병률을 식별하고 추적할 수 있습니다.
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
고도로 민감하고 포괄적인 호흡기 병원체 식별 및 항균제 내성 통찰력을 제공하는 라이브러리 준비 및 강화 키트입니다.
Pan-Coronavirus Panel
이 패널은 인간과 동물 저장소에서 얻은 225종의 알려진 신종 코로나바이러스에 대한 특성 규명과 유전체 감시 시스템을 지원합니다.
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