MiSeq i100 시리즈 애플리케이션 및 방법

가장 간단한 워크플로우, 가장 빠른 결과

초보 사용자에 최적화된 유연한 출력 및 즉시 사용 가능 워크플로우를 통해 가장 빠르고 간단한 벤치탑 시퀀서에서 광범위한 애플리케이션 수행

Scientist starting a sequencing workflow on MiSeq i100 System

주요 애플리케이션 및 방법

사전 설계된 지원 워크플로우를 사용하든 아니면 자체 워크플로우를 구축하든 관계없이 워크플로우의 모든 단계를 지원할 수 있는 옵션이 있습니다.

지원되는 샘플에서 분석까지 워크플로우: MiSeq i100 및 MiSeq i100 Plus 시스템은 다양한 방법에 대해 지원되는 샘플에서 분석까지 워크플로우를 제공합니다. 이러한 워크플로우에는 라이브러리 준비 키트, 패널, MiSeq i100 시리즈의 시퀀싱, DRAGEN 2차 분석 및 데이터 해석(해당하는 경우)이 포함됩니다. 향후 추가 워크플로우가 지원될 예정입니다.

마이크로바이옴 및 병원체 발견

미생물 군집에 존재하는 세균 분류군을 식별하고 비교하기 위한 복잡한 생물학적 샘플의 표적, 무배양 시퀀싱.

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

16S 앰플리콘 시퀀싱

복잡한 샘플에서 미생물을 식별하는 무배양 차세대 시퀀싱 방법. 전통적인 방법을 사용하지 않는 박테리아 균주를 식별하기 위한 비용 효과적인 무배양 방법.

샷건 DNA 시퀀싱

복합 샘플에 존재하는 모든 미생물 유전체의 기능적 특성 분석. 신속한 통합 라이브러리 준비는 최소한의 수작업 시간으로 < 4시간 내에 완료됩니다.

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라이브러리 준비
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데이터 분석 및 해석

샷건 RNA 시퀀싱

복잡한 샘플에 존재하는 모든 코딩(coding) 및 비코딩 RNA의 기능적 정량화. 여러 종 및 샘플 유형 전반에서 리보솜 RNA 및 인간 글로빈 mRNA의 효율적인 고갈.

단일 유전체 미생물 시퀀싱

분리된 배양 세균 콜로니 또는 결정된 관심 병원체에 대해 조사되는 일차 샘플로부터 유래한 알려진 단일 유기체에 대한 미생물 시퀀싱 및 분석.

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

미생물 WGS

심층적인 통찰력을 위해 미생물 유전체를 매핑, 완성 또는 비교하는 포괄적인 방법. 신속한 통합 라이브러리 준비는 최소한의 수작업 시간으로 < 4시간 내에 완료됩니다.

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라이브러리 준비
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데이터 분석 및 해석

DRAGEN sWGS 온보드 MiSeq i100

리소스

결핵 ID 및 약제 내성 특성 규명

결핵균 복합체 균주 식별을 위한 표적 차세대 시퀀싱 패널. 최소 9 pg의 DNA로 시퀀싱 라이브러리를 준비합니다.

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

SARS-CoV-2 시퀀싱

SARS-CoV-2 바이러스의 특성 규명을 위한 포괄적인 앰플리콘 기반 분석. 저처리량에서 중간 처리량 차세대 시퀀싱 assay를 통해 모든 규모의 검사실이 새로운 SARS-CoV-2 변종을 조사할 수 있습니다.

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라이브러리 준비

라이브러리 준비

3
데이터 분석 및 해석

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

인플루엔자 시퀀싱

공중 보건 감시 시스템 및 임상시험을 위한 인플루엔자 A/B 바이러스의 WGS에 대한 다중, 앰플리콘 기반 assay. 인플루엔자 A/B 분석을 위한 자동화를 지원하는 RT-PCR 및 태그 기반 워크플로우.

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라이브러리 준비

패널 + 라이브러리 준비

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데이터 분석 및 해석

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

유연한 미생물 시퀀싱

특정 관심 미생물의 식별 및 특성 규명을 위한 사용자 정의 맞춤형 표적 시퀀싱. 관심 미생물을 표적으로 하는 맞춤형, 공개된 또는 상업적으로 이용 가능한 프라이머 세트와 호환됩니다.

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라이브러리 준비
3
데이터 분석 및 해석

다중병원체 시퀀싱

앰플리콘 기반 차세대 시퀀싱을 통한 다중병원체 시퀀싱은 PCR 앰플리콘의 매우 심층적인 시퀀싱으로 관심 유전체 영역을 분석하는 것을 포함합니다. 바이러스의 완전한 특성 규명을 가능하게 합니다.

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

바이러스성 공중 보건 위협 시퀀싱

SARS-CoV-2, 인플루엔자, poliovirus를 포함한 광범위한 바이러스의 특성 규명을 위한 WGS 자료를 획득합니다. 다양한 샘플의 종류와 호환되는 RNA 및 DNA 바이러스에 대한 동시 분석을 수행합니다.

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라이브러리 준비

패널 + 키트

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데이터 분석 및 해석

DRAGEN Microbial Enrichment Plus onboard MiSeq i100

공통 호흡기 바이러스 시퀀싱

SARS-CoV-2 및 인플루엔자 A/B와 같은 흔한 호흡기 바이러스의 표적, 간소화된 검출. 하이브리드 캡처 방법을 통한 표적 강화는 높은 리드 뎁스 없이도 매우 민감한 검출을 제공합니다.

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라이브러리 준비
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데이터 분석 및 해석

DRAGEN Microbial Enrichment Plus onboard MiSeq i100

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

호흡기 병원체 및 AMR 시퀀싱

간소화된 샘플-결과 간 작업 흐름으로 > 280개의 호흡기 병원체와 > 2000개의 항균제 내성 표지자를 표적으로 하는 NGS 기반 패널.

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라이브러리 준비
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데이터 분석 및 해석

DRAGEN Microbial Enrichment Plus onboard MiSeq i100

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

요로 병원체 및 AMR 시퀀싱

간소화된 샘플 대 결과 워크플로우를 통해 > 170개의 요로병원균 및 > 3700개의 항균제 내성 표지자를 표적으로 하는 차세대 시퀀싱 기반 패널.

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라이브러리 준비
3
데이터 분석 및 해석

DRAGEN Microbial Enrichment Plus onboard MiSeq i100

표적 암 시퀀싱

특정 암 유형 또는 경로와 관련된 유전자 중점 선별을 포함하는 표적 암 시퀀싱은 보다 광범위한 유전체 프로파일링 접근법을 보완하고 암 생물학을 조사하고 이해하기 위한 여러 옵션을 사용자에게 제공합니다.

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

다중 암 CNV 및 융합 분석

CNV 및 유전자 융합을 포함한 다중 변이의 표적화된 검출. 단일 튜브 SLIMamp 워크플로우는 빠른 라이브러리 준비 및 총 소요 시간을 제공합니다.

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라이브러리 준비

라이브러리 준비

SLIMamp 앰플리콘 준비

3
데이터 분석 및 해석

데이터 분석

앰플리콘 필러 PiVAT

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

골수암 유전자 검출

골수암과 관련성이 높은 관심 유전자 58개에 대한 표적 조사. 단일 튜브 SLIMamp 워크플로우는 빠른 라이브러리 준비 및 총 소요 시간을 제공합니다.

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라이브러리 준비

라이브러리 준비

SLIMamp 앰플리콘 준비

3
데이터 분석 및 해석

데이터 분석

DRAGEN DNA

앰플리콘 필러 PiVAT

리소스

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

고형암 융합 검출

고형 종양 유형 전반에서 관심 대상의 여러 유전자 재배열 영역을 집중적으로 검출. 단일 튜브 SLIMamp 워크플로우는 빠른 라이브러리 준비 및 총 소요 시간을 제공합니다.

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라이브러리 준비

패널

Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel

라이브러리 준비

SLIMamp 앰플리콘 준비

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데이터 분석 및 해석

데이터 분석

DRAGEN DNA

앰플리콘 필러 PiVAT

암 유전자 발현 및 융합 검출

1385개의 암 관련 RNA 전사물에 대한 포괄적 평가. FFPE 샘플을 포함한 대부분의 샘플 유형에서 암 관련 전사물에 대한 심층적이고 비용 효과적인 평가.

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라이브러리 준비

라이브러리 준비

SLIMamp 앰플리콘 준비

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데이터 분석 및 해석

데이터 분석

앰플리콘 필러 PiVAT

리소스

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

BRCA 유전자 시퀀싱

BRCA1/2 돌연변이 및 유전자 복제수 변이에 대한 표적 시퀀싱 패널. 단일 튜브 SLIMamp 워크플로우는 빠른 라이브러리 준비 및 총 소요 시간을 제공합니다.

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라이브러리 준비

라이브러리 준비

SLIMamp 앰플리콘 준비

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데이터 분석 및 해석

데이터 분석

데이터 해석

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

유전성 암 유전자 시퀀싱

유전자 암 위험 소인과 관련된 113개의 유전자 및 125개의 SNP 전반에서 생식세포 돌연변이를 평가하는 표적 시퀀싱 패널. 주요 오피니언 리더의 의견을 바탕으로 개발된 전문가 정의 콘텐츠.

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라이브러리 준비
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데이터 분석 및 해석

데이터 분석

데이터 해석

샘플에서 분석까지 워크플로우 지원

B세포 및/또는 T세포 수용체 시퀀싱

B세포 또는 T세포 수용체 다양성 및 클론 확장을 분석하여 적응 면역계에 대한 인사이트를 얻습니다. 최소 10 ng에서 최대 3 μg의 RNA까지 광범위한 RNA 투입량으로부터 유연한 라이브러리 준비.

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데이터 분석 및 해석

Takara 데이터 분석

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